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衰老不是磨損,而是泄漏!Nature揭示炎癥新源頭!

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衰老長期以來被視為身體自然磨損的結(jié)果,但最新研究卻提出了一個顛覆性的觀點:衰老并非單純的“磨損”,而是一種由“泄漏”引發(fā)的內(nèi)在過程。2025年9月,Nature期刊發(fā)表題為Ribonucleotide incorporation into mitochondrial DNA drives inflammation的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn),核苷酸失衡使核糖核苷酸錯誤摻入mtDNA,導(dǎo)致mtDNA不穩(wěn)定并激活免疫反應(yīng),引發(fā)衰老相關(guān)分泌表型(SASP)。該過程可通過外源性補充脫氧核苷酸抑制,并進一步揭示核苷酸代謝失衡在衰老和炎癥反應(yīng)中起關(guān)鍵作用。


一、差異表達(dá)揭示炎癥的遲發(fā)性激活

通過NanoString轉(zhuǎn)錄組分析,作者發(fā)現(xiàn)Mgme1?/?小鼠在70周齡時表現(xiàn)出干擾素刺激基因(ISG)的顯著上調(diào),而在年輕小鼠(10–55周)中未觀察到類似變化,表明ISG上調(diào)并非一開始就發(fā)生,而是隨著年齡積累,逐漸激活。這揭示了一個非常有趣的現(xiàn)象:衰老引起的免疫表型是一個遲發(fā)性反應(yīng),隨著時間的推移才逐漸顯現(xiàn)。這種免疫反應(yīng)在全身范圍內(nèi)普遍存在,包括腎臟、肝臟、心臟和肌肉等多個組織。通過數(shù)字PCR技術(shù),發(fā)現(xiàn)Mgme1?/?小鼠胞質(zhì)中mtDNA顯著積累,推測線粒體DNA外泄激活cGAS–STING通路,觸發(fā)慢性炎癥,提示基因缺失在時間積累下轉(zhuǎn)變?yōu)槁悦庖叻磻?yīng)的驅(qū)動因素。(如圖1)


二、差異影響表型:STING通路的核心作用。

為了驗證Mgme1缺失引發(fā)的免疫反應(yīng)的分子機制,研究團隊構(gòu)建了雙基因小鼠模型(Mgme1?/?與Mgme1?/?Sting1mut/mut),進一步驗證了STING通路的核心作用。NanoString轉(zhuǎn)錄組分析顯示,Mgme1?/?小鼠腎臟中ISG顯著上調(diào),而在STING缺失小鼠中,這一上調(diào)幾乎完全消失,表明STING是Mgme1缺失誘導(dǎo)免疫反應(yīng)的核心介質(zhì)。在Mgme1缺失的細(xì)胞(MEFs)中,線粒體DNA外泄明顯,而STING缺失小鼠無法激活免疫反應(yīng)。PAS染色與免疫組化實驗發(fā)現(xiàn),Mgme1?/?小鼠的腎小管硬化與免疫細(xì)胞浸潤顯著,而STING突變小鼠中的這些損傷得到緩解。這一系列實驗揭示了Mgme1缺失→mtDNA外泄→STING激活→炎癥與組織損傷的完整機制鏈條。這一發(fā)現(xiàn)暗示衰老相關(guān)的慢性炎癥可能源自細(xì)胞內(nèi)部的遺傳物質(zhì)泄漏,而非外源感染。(如圖2)


三、機制探討:mtDNA復(fù)制缺陷與免疫激活

研究團隊通過siRNA下調(diào)mtDNA復(fù)制相關(guān)酶,發(fā)現(xiàn)抑制mtDNA復(fù)制酶時,ISG表達(dá)顯著升高,提示mtDNA復(fù)制缺陷可能觸發(fā)STING依賴的免疫反應(yīng)。dPCR和LC-MS分析顯示,Mgme1缺失小鼠中dNTP水平顯著下降,影響了mtDNA復(fù)制穩(wěn)定性。下一代測序分析發(fā)現(xiàn),Mgme1缺失阻礙了mtDNA復(fù)制起始位點的啟動,Mgme1缺失導(dǎo)致mtDNA復(fù)制起始位點受阻。這些結(jié)果表明,dNTP缺乏與mtDNA復(fù)制障礙共同作用,最終激活了cGAS–STING通路,引發(fā)免疫反應(yīng)。這一機制的揭示,不僅解釋了Mgme1缺失如何通過影響dNTP合成和mtDNA復(fù)制激活免疫信號通路,也為開發(fā)免疫抑制藥物或線粒體保護策略提供了理論支持。(如圖3)


四、轉(zhuǎn)化探索:核糖核苷酸不平衡與mtDNA復(fù)制不穩(wěn)定

進一步研究使用LC-MS和HydEn-seq技術(shù)分析Mgme1?/?與Yme1l?/?小鼠細(xì)胞中的rNTP和dNTP水平變化,發(fā)現(xiàn)rNTPs(如rA、rG)顯著升高,尤其是在mtDNA中,提示核糖核苷酸不平衡影響mtDNA穩(wěn)定性。Southern雜交和RNase H2處理驗證了rNTP的過度摻入,導(dǎo)致mtDNA不穩(wěn)定,并激活STING通路。結(jié)合dNTP水平下降的發(fā)現(xiàn),研究揭示了dNTP不足如何導(dǎo)致mtDNA復(fù)制缺陷并激活免疫反應(yīng)。最終,研究將這一機制與線粒體功能障礙和免疫系統(tǒng)激活聯(lián)系起來,為抗衰老與免疫抑制治療策略的研發(fā)提供了理論支持。此研究不僅闡明了核糖核苷酸不平衡與mtDNA復(fù)制不穩(wěn)定如何激活免疫反應(yīng),還提出rNTPs過度摻入可能成為衰老及相關(guān)免疫疾病的重要機制。


五、從基礎(chǔ)機制到臨床轉(zhuǎn)化:核苷酸代謝紊亂的可干預(yù)性

研究通過輻射誘導(dǎo)的衰老IMR90細(xì)胞和體外實驗,篩選出rNTP與dNTP比例失衡對mtDNA穩(wěn)定性和免疫反應(yīng)的影響。外源性脫氧核苷酸補充實驗驗證了代謝紊亂與衰老相關(guān)炎癥的可干預(yù)性。研究表明,補充脫氧核苷可以恢復(fù)dNTP水平,抑制mtDNA外泄及相關(guān)免疫炎癥,為抗衰老和免疫調(diào)節(jié)提供新思路。進一步分析發(fā)現(xiàn),衰老細(xì)胞中rNTP異常摻入通過激活cGAS–STING途徑,顯著增強SASP。外源補充脫氧核苷成功逆轉(zhuǎn)這一過程,提出了通過恢復(fù)核苷酸平衡抑制衰老相關(guān)免疫反應(yīng)的治療策略。(如圖5)


六、重新定義衰老的科學(xué)意義

圖6揭示了衰老過程中dNTP池枯竭和rNTP積累的關(guān)鍵作用。核苷酸池失衡導(dǎo)致rNMPs摻入mtDNA,引發(fā)mtDNA不穩(wěn)定和斷裂,最終通過mtDNA泄漏激活免疫反應(yīng),維持SASP。補充dNTPs可逆轉(zhuǎn)這一過程,證明該機制在衰老中起重要作用。這一發(fā)現(xiàn)挑戰(zhàn)了傳統(tǒng)的衰老理解,提出衰老不僅是外部磨損,更是內(nèi)部代謝紊亂引發(fā)的免疫激活。恢復(fù)核苷酸代謝平衡或為抗衰老和免疫調(diào)節(jié)治療提供新路徑。(圖6)


文章最后的十張擴展數(shù)據(jù)圖共同構(gòu)建了一個完整且堅實的證據(jù)鏈。


首先,通過定義表型(擴展數(shù)據(jù)圖1),揭示MGME1缺失引發(fā)的炎癥反應(yīng)和線粒體損傷;接著,通過驗證通路(擴展數(shù)據(jù)圖2, 3),證明炎癥反應(yīng)是通過cGAS-STING-TBK1通路介導(dǎo)的;隨后,闡明機制(擴展數(shù)據(jù)圖4, 5),展示cGAS定位變化及mtDNA外泄是激活該通路的信號源;進一步深入挖掘(擴展數(shù)據(jù)圖6, 7, 8),發(fā)現(xiàn)復(fù)制過程、核苷酸池平衡和POLγ抑制是導(dǎo)致炎癥的上游根源;最后,通過提升意義(擴展數(shù)據(jù)圖9, 10),在衰老模型和多種組織中進行了驗證,證明這一機制具有廣泛的生理相關(guān)性。

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