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AI助力多組學(xué)與機(jī)器學(xué)習(xí)聯(lián)合分析(機(jī)器學(xué)習(xí)分析代謝組、蛋白組、宏基因組、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、轉(zhuǎn)錄組)

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AI助力多組學(xué)與機(jī)器學(xué)習(xí)聯(lián)合分析課題特色

1.零基礎(chǔ)無壓力,R語言編程從入門到實(shí)戰(zhàn),快速打造你的生信分析基本功

2.AI賦能+CNS文獻(xiàn)精讀,帶你高效拆解多組學(xué)科研的經(jīng)典范式與創(chuàng)新思路

3.全面覆蓋代謝組、蛋白組、微生物組(宏基因組和16s)、轉(zhuǎn)錄組等熱門方向,緊跟科研前沿

4.集成xgboost、lasso、隨機(jī)森林等多種機(jī)器學(xué)習(xí)模型,打造智能化分析能力

5.每節(jié)課精選CNS文章源代碼,手把手復(fù)現(xiàn)高水平研究,提升實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)

6.獨(dú)家“一對(duì)一指導(dǎo)+包教包會(huì)”教學(xué)模式,讓你真正學(xué)得會(huì)、用得上、發(fā)得出

7.直播授課+課后錄屏反復(fù)回看,搭配完整資料包,學(xué)習(xí)節(jié)奏靈活自由

8.課后持續(xù)答疑服務(wù),課程結(jié)束答疑不結(jié)束,真正做到全程陪學(xué)、包教包會(huì)

9.系統(tǒng)教學(xué),一次報(bào)班學(xué)會(huì)多組學(xué),不用東拼西湊反復(fù)報(bào)名各類組學(xué)培訓(xùn)班

機(jī)器學(xué)習(xí)分析多組學(xué)課程安排

第一節(jié)課 AI+多組學(xué)CNS文思路解讀

1.基于Deepseek高效閱讀多組學(xué)的CNS生信文章

2.AI整理代謝組、蛋白組、宏基因組等多組學(xué)數(shù)據(jù)分析流程

3.Deepseek從多篇生信文獻(xiàn)中快速總結(jié)提煉多組學(xué)數(shù)據(jù)分析方法

4.Deepseek評(píng)價(jià)多組學(xué)生信文章思路的創(chuàng)新性和數(shù)據(jù)分析可行性

第二節(jié)課 Deepseek輔助多組學(xué)生信課題設(shè)計(jì)

1.Deepseek輔助代謝組、蛋白組、宏基因組聯(lián)合分析策略

2.AI指導(dǎo)代謝組、蛋白組、宏基因組、轉(zhuǎn)錄組交叉驗(yàn)證的思路

3.Deepseek匯總生信論文模板設(shè)計(jì)的層次和邏輯要點(diǎn)

4.Deeoseek輔助生信多組學(xué)數(shù)據(jù)研究熱點(diǎn)挖掘

5.Deeoseek構(gòu)建多個(gè)公共數(shù)據(jù)庫聯(lián)合驗(yàn)證有效策略

第三節(jié):編程基礎(chǔ)學(xué)習(xí)--R語言

1.R和Rstudio的安裝、環(huán)境配置

2.R語言簡單語法及常見命令

3.以Cell文章方法描述學(xué)習(xí)R包的安裝及使用

4.以Nature文章源代碼學(xué)習(xí)重點(diǎn)函數(shù)基礎(chǔ)代碼

5.向量、矩陣、數(shù)據(jù)框和列表的創(chuàng)建和索引

6.自定義Function函數(shù)構(gòu)建

7.for循環(huán)、字符型數(shù)據(jù)的處理【Cell】

8.云服務(wù)器的使用方法


第四節(jié):機(jī)器學(xué)習(xí)代謝組數(shù)據(jù)分析

1.deepseek對(duì)CNS文章代謝組學(xué)系統(tǒng)解讀

2.三大常見代謝物庫:HMDB 、METLIN 和 KEGG;

代謝組學(xué)原始數(shù)據(jù)庫:Metabolomics Workbench 和 Metabolights

3.無監(jiān)督式機(jī)器學(xué)習(xí)在代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理中的應(yīng)用

4.三種回歸用于代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析:線性回歸、Logistic 回歸與 Cox 回歸

5.PLS-DA 算法:決策樹,隨機(jī)森林和貝葉斯網(wǎng)絡(luò)模型

6.多尺度嵌入式代謝物共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析

7.TDEseq:識(shí)別不同分組條件下基因表達(dá)趨勢的變化

8.Nature子刊代謝分析的源代碼復(fù)現(xiàn)

第五節(jié):機(jī)器學(xué)習(xí)蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)分析

1.蛋白組無監(jiān)督聚一致性聚類(Consensus Clustering)

2,PPI蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建

3.構(gòu)建通路富集網(wǎng)絡(luò):通路基因集之間的相似性,將富集的通路表示為一個(gè)相互連接的簇網(wǎng)絡(luò)

4.蛋白組加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析WGCNA

5.主成分分析不同分組變量差異結(jié)果展示

6.Mfuzz識(shí)別基因、代謝或蛋白質(zhì)表達(dá)的時(shí)間趨勢

7.Nature Medicine文章源代碼復(fù)現(xiàn)


第六節(jié):機(jī)器學(xué)習(xí)宏基因組數(shù)據(jù)分析

1.物種相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)分析

2.基于序列相似性定義的分類單元在不同組間的豐度差異

3.Alpha和Beta多樣性分析(PCoA)

4.非線性最小二乘法識(shí)別物種豐度與環(huán)境變量之間的關(guān)系

5.隨機(jī)森林篩選群落Biomarker

6.物種組成三元圖展示相對(duì)豐度

7.Science文章源代碼復(fù)現(xiàn)

第七節(jié):機(jī)器學(xué)習(xí)16s測序數(shù)據(jù)分析

1.meconetcomp:微生物共生網(wǎng)絡(luò)比較

2.進(jìn)化樹揭示物種間親緣關(guān)系

3.微生物組的擴(kuò)增子測序分析

4.不同條件下的微生物群落差異

5.Mantel檢驗(yàn)群落距離矩陣和不同處理組之間的相關(guān)性

6.微生物群落和環(huán)境數(shù)據(jù)機(jī)器學(xué)習(xí)分析

7.Anova進(jìn)行微生物功能豐度差異檢驗(yàn)

8.Nature Microbiology文章源代碼復(fù)現(xiàn)


第八節(jié):機(jī)器學(xué)習(xí)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

1.隨機(jī)效應(yīng)模型(REM)方法對(duì)差異基因進(jìn)行 meta 分析

2.差異基因的轉(zhuǎn)錄因子富集構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

3.富集分析:GSEA、GSVA分析

4.相關(guān)性聚類熱圖識(shí)別轉(zhuǎn)錄因子共表達(dá)模塊

5.CIBERSORT免疫浸潤

6.調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖展示細(xì)胞動(dòng)靜狀態(tài)--Regulatory network

7.TO-GCN時(shí)序基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)

8.CELL主刊文章源代碼復(fù)現(xiàn)

第九節(jié):機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用于多種組學(xué)篩選重要特征

1.圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)后模型構(gòu)建進(jìn)行預(yù)后基因挖掘

2.xgboost模型:基于梯度增強(qiáng)的決策樹算法

2.隨機(jī)森林模型

3.lasso回歸等模型:線性回歸的另一種正則化形式

4.彈性網(wǎng)絡(luò)回歸:結(jié)合了嶺回歸和Lasso

5. 樸素貝葉斯和支持向量機(jī)

7,多種機(jī)器學(xué)習(xí)算法用于各組學(xué)篩選重要的特征:代謝物、腸道微生物、mRNA、蛋白質(zhì)

8.Nature Medicine文章源代碼復(fù)現(xiàn)

第十節(jié):網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析

1.deepseek解讀網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路

2.藥物靶點(diǎn)的查詢,復(fù)方、單體網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)定位

3.藥物成分與疾病的關(guān)聯(lián)分析,構(gòu)建疾病與中藥成分的網(wǎng)絡(luò)

4.網(wǎng)絡(luò)分析(如PPI互作、模塊挖掘)

5.拓?fù)涮卣鳎ǘ戎行男?、介?shù)中心性)預(yù)測關(guān)鍵靶點(diǎn)

6.基于AI的組學(xué)數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)關(guān)系挖掘

第十一節(jié):分子對(duì)接

1.AIDD人工智能藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計(jì)的基本介紹

2.配體小分子和受體白蛋大分子的前處理

3.建立和運(yùn)行Grid格點(diǎn)文件,建立對(duì)接格點(diǎn)空間文件

4.使用Pymol軟件查看詳細(xì)的結(jié)合位點(diǎn),相互作用的氫鍵

5.結(jié)合能的計(jì)算,結(jié)合位點(diǎn)的確定

第十二節(jié):代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白組學(xué)聯(lián)合分析

1.主成分分析代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)變量差異

2.基于共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)(GCN)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(GRN)探索多組學(xué)數(shù)據(jù)的拓?fù)涮匦?/p>

3.多組學(xué)3D數(shù)據(jù)可視化:整合分析

4.Metscape的使用

5.crosslink轉(zhuǎn)錄-蛋白-代謝 多組學(xué)相關(guān)性可視化

6.多組學(xué)聯(lián)合分析三維多層網(wǎng)絡(luò):一個(gè)級(jí)別基因互作關(guān)系,第二層是蛋白/代謝物,層間邊緣(連線)是基因和代謝物的生物學(xué)關(guān)系

7.使用Deepseek設(shè)計(jì)分析基于蛋白組+代謝組的多器官視角揭示膿毒癥早期的能量代謝適應(yīng)性,并生成初步代碼框架

8.Nature Aging 文章源代碼復(fù)現(xiàn)

第十三節(jié)課:Deepseek解讀腸道微生物組學(xué)與代謝組學(xué)、蛋白組、轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析課題思路設(shè)計(jì)

1.Deepseek設(shè)計(jì)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)和多組學(xué)的綜合分析揭示肝毒性的潛在機(jī)制,并生成初步課題思路框架

2.Deepseek設(shè)計(jì)微生物+代謝組的小鼠下丘腦回路對(duì)腸道微生物群組成的快速調(diào)節(jié),并生成課題思路框架

3.Deepseek設(shè)計(jì)微生物+轉(zhuǎn)錄,腸道細(xì)菌促結(jié)直腸癌新機(jī)制,并生成課題思路框架

4.Deepseek設(shè)計(jì)微生物+蛋白,靈芝多糖對(duì)阿爾茨海默病預(yù)防作用的機(jī)制,并生成課題思路框架

第十四節(jié)課:AI輔助生信論文投稿與發(fā)表

1.Deepseek輔助科研論文選刊(實(shí)操+指令)

2.GPT輔助文本的潤色、改寫與擴(kuò)寫

3.AI自動(dòng)摘要、刪減與提煉關(guān)鍵詞句

4.Deepseek輔助拒稿處理、推薦更適合期刊,提供投稿建議(實(shí)操+指令)

課程相關(guān)問題

1

中間沒時(shí)間咋辦

不用擔(dān)心,我們已經(jīng)考慮到這個(gè)問題了,基本上我們都會(huì)給您兩輪機(jī)會(huì)學(xué)習(xí),而且還配備往期視頻給您預(yù)習(xí)直到您學(xué)會(huì)為止,不行免費(fèi)再來一次,我們一直承諾包教包會(huì)。

2

課程售后服務(wù)怎樣

再好的課程沒有完善的后續(xù)服務(wù)只能讓你摸不著腦袋,所以我們課后有完善的一對(duì)一指導(dǎo)服務(wù),解決每個(gè)學(xué)員的所有問題。有問題及時(shí)一對(duì)一解決,把所有問題解決就學(xué)會(huì)了

3

兩個(gè)月后老師還指導(dǎo)我嗎

我們的指導(dǎo)暫時(shí)沒有時(shí)間限制,課程結(jié)束答疑不結(jié)束。復(fù)習(xí)視頻也不會(huì)限制時(shí)間,甚至六年前的老學(xué)員還在保持聯(lián)系,我們的目標(biāo)是推動(dòng)醫(yī)學(xué)進(jìn)步,希望大家生信問題多多交流。

課程報(bào)名

課程費(fèi)用:4880,醫(yī)咖會(huì)會(huì)員優(yōu)惠價(jià)4500

聯(lián)系人:小咖3號(hào)(微信號(hào):xys2019ykh或掃碼添加)

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