工欲善其事，必先利其器！好的工具網(wǎng)站可以為科研提供很大的助力。寫(xiě)綜述有助于快速掌握該領(lǐng)域的最新進(jìn)展；識(shí)別研究空白與趨勢(shì)，為研究開(kāi)題提供研究選題和方向的參考。當(dāng)然，綜述寫(xiě)作必須站在一定高度，才能做出精練總結(jié)，對(duì)爭(zhēng)議發(fā)表深刻見(jiàn)解。我們可以結(jié)合既往文獻(xiàn)和公共數(shù)據(jù)挖掘，我們梳理了一些生物網(wǎng)站和生信網(wǎng)站。

網(wǎng)址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

醫(yī)藥生物相關(guān)研究，必不可少的當(dāng)然是NCBI了，基因、蛋白等生物功能信息和科學(xué)文獻(xiàn)全都有。Gene，Genome，Nucleotide等可以查到目的基因的基本分子遺傳信息，通過(guò)Protein看蛋白的生化性質(zhì)，GEO數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了全球研究機(jī)構(gòu)提交的高通量基因表達(dá)數(shù)據(jù)，進(jìn)行生物信息學(xué)分析可以從這里下載到各種基因表達(dá)信息。

網(wǎng)站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/

PubMed文獻(xiàn)檢索工具，海量的生物醫(yī)學(xué)研究論文都能從這個(gè)網(wǎng)站搜索下載。

網(wǎng)址：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/

蛋白研究必不可少的數(shù)據(jù)庫(kù)，UniProt！可以查詢到蛋白基本的生物學(xué)信息，比如蛋白序列和大小，蛋白在細(xì)胞中的定位和功能、結(jié)構(gòu)、蛋白酶的酶活位點(diǎn)等等多物種蛋白質(zhì)的生化信息。同時(shí)，還有肽段Blast以及序列比對(duì)等功能。

網(wǎng)址：https://www.uniprot.org/

人類基因數(shù)據(jù)庫(kù)GeneCards，這是可以全面查看基因相關(guān)信息的非營(yíng)利性網(wǎng)站，而且網(wǎng)站是一直在積極維護(hù)的，目前更新到5.1版本，不僅有編碼蛋白基因的信息，還包含有大量非編碼RNA的信息。網(wǎng)站整合上百個(gè)網(wǎng)站的數(shù)據(jù)信息，提供很全面的基因信息。直接輸入想了解的基因后，可以看到各個(gè)特征，如：Disorders，Domains，Drugs，Expression，Pathways等基本的基因的生物學(xué)特征。

網(wǎng)址：https://www.genecards.org/

要查詢蛋白在組織中的表達(dá)信息，可以使用The Human Protein Atlas網(wǎng)站。這一網(wǎng)站與UniProt有很多相似的功能，可以看蛋白基本的生化特征和基因信息，還可以從不同層面去看蛋白的表達(dá)和分布，而且有圖有真相！

網(wǎng)址：https://www.proteinatlas.org/

要查詢基因在染色體上的位置以及啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)元件，可以使用UCSC網(wǎng)站獲取。首先可以在Genome菜單下選取查詢的數(shù)據(jù)庫(kù)，然后輸入要查詢的基因名即可，簡(jiǎn)單方便。

隨后會(huì)出來(lái)下面的基因圖譜，最下方還有可以勾選的各種基因特征的展示選項(xiàng)，看自己需求添加要看的內(nèi)容，功能強(qiáng)大且信息全面，是了解基因表觀特征及表達(dá)不可或缺的神器！

網(wǎng)址：https://www.proteinatlas.org/

DepMap網(wǎng)站可以搜索基因、細(xì)胞系、化合物的信息。以細(xì)胞搜索為例，可以檢索到細(xì)胞系的來(lái)源和基因?qū)用娴奶卣鳎€包括可能會(huì)轉(zhuǎn)移的位置。對(duì)于藥物的信息也比較全面，可以看在不同細(xì)胞中的作用濃度，以及不同細(xì)胞對(duì)藥物的敏感度、受藥物影響的基因等。

網(wǎng)址：https://depmap.org/portal/

TRRUST可以查找人源和鼠源轉(zhuǎn)錄因子的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，可以正向搜索也可以反向搜索，需要注意選好對(duì)應(yīng)的物種。進(jìn)入后可以看到具體的調(diào)控關(guān)系：轉(zhuǎn)錄激活還是轉(zhuǎn)錄抑制，還能夠看到檢索蛋白所涉及疾病和信號(hào)通路信息。

網(wǎng)站：https://www.grnpedia.org/trrust/

以上主要是生物網(wǎng)站，生信網(wǎng)站的話，我們以前分享過(guò)，有40多個(gè)。

我們以CD73為例，做個(gè)簡(jiǎn)單的呈現(xiàn)。

CD73在肺癌中的表達(dá)

CD73表達(dá)與預(yù)后

CD73與腫瘤微環(huán)境

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