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PLOS Pathog | 首個實驗室證據(jù),新冠病毒感染激活了人體另一種病毒,導致嚴重臨床癥狀!

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  人類巨細胞病毒(HCMV)是一種非常常見的病毒,很多人在嬰幼兒時期就已經感染,但它通常不會引起明顯癥狀,而是悄悄“潛伏”在體內,一旦人體免疫力下降,就有可能“激活”,引發(fā)健康問題。近年來,科學家們注意到,新冠病毒(SARS-CoV-2)感染后,有些患者體內的HCMV會被重新激活,但背后的原因一直不清楚。

  2025年7月16日,暨南大學陳俊,聯(lián)合江漢大學萬品和武漢輕工大學曾馳共同通訊在PlosPathogens在線發(fā)表題為“SARS-CoV-2 encoded ORF3a interacts with YY1 to promote latent HCMV reactivation”的研究型論文,該研究發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2的ORF3a蛋白可以通過與MIEP抑制因子YY1相互作用,激活HCMV的MIEP。這種相互作用導致YY1發(fā)生依賴泛素的降解,進而促進潛伏HCMV的再激活以及病毒的復制和增殖。這些發(fā)現(xiàn)揭示了SARS-CoV-2與HCMV在共感染過程中相互作用的分子機制,為未來預防和治療這兩種病毒共感染提供了新的理論基礎。

  促進MIEP激活的SARS-CoV-2蛋白的篩選

  為探究SARS-CoV-2誘導HCMV再激活的機制,研究者利用雙熒光素酶報告系統(tǒng)對SARS-CoV-2編碼蛋白進行篩選,發(fā)現(xiàn)ORF3a、ORF7b和M蛋白均可顯著增強HCMV主要即刻早期啟動子(MIEP)的轉錄活性。

  圖1.促進MIEP激活的SARS-CoV-2蛋白的篩選

  進一步的劑量依賴實驗顯示,三種蛋白對MIEP活性的促進作用與表達量呈正相關。結果表明,這些SARS-CoV-2蛋白可能在病毒共感染中誘導HCMV潛伏病毒的再激活。

  SARS-CoV-2 ORF3a與YY1相互作用

  通過篩選發(fā)現(xiàn),SARS-CoV-2的ORF3a、ORF7b和M蛋白均可激活HCMV MIEP。為進一步探究其機制,作者重點檢測了這些蛋白與已知調控MIEP的轉錄因子(如YY1、NF-κB、AP-1)間的相互作用。免疫共沉淀(Co-IP)實驗顯示,ORF3a能與轉錄抑制因子YY1形成復合物,而ORF7b和M蛋白未檢測到直接結合。免疫熒光共定位實驗進一步證實,ORF3a與YY1在細胞內共定位,且ORF3a促使YY1從核內轉移至胞漿。雙向Co-IP驗證了ORF3a與YY1的互作關系,該互作同樣在SARS-CoV-2感染的THP-1衍生巨噬細胞中得到確認。

  圖2.SARS-CoV-2的ORF3a與YY1相互作用

  結構域功能分析表明,ORF3a與YY1的相互作用依賴于YY1的轉錄激活域(1-154氨基酸)和鋅指DNA結合域(296-414氨基酸)。綜上,ORF3a通過結合YY1影響其細胞定位和功能,可能是調控HCMV MIEP活性及潛伏病毒再激活的關鍵機制之一。

  ORF3a恢復了YY1抑制的MIEP活性

  作者首先驗證了YY1對HCMV MIEP的抑制作用:隨著Flag-YY1表達量增加,MIEP活性逐漸降低。進一步探究ORF3a的作用時,發(fā)現(xiàn)隨著ORF3a表達量增加,YY1對MIEP的抑制作用逐漸減弱,同時免疫印跡顯示YY1蛋白水平下降。使用缺失YY1結合位點的MIEP突變質粒(pGL3-MIEPmut)時,ORF3a對MIEP活性的調控喪失,提示ORF3a對MIEP的激活依賴于YY1及其結合位點。

  圖3.ORF3a可恢復YY1對MIEP活性的抑制作用,并呈劑量依賴性

  此外,敲低YY1表達可促進MIEP活性,但此時ORF3a的促進作用消失,進一步說明ORF3a依賴YY1介導MIEP調控。競爭性表達缺失轉錄抑制結構域的YY1Δ2突變體能結合ORF3a但無法抑制MIEP活性,且恢復野生型YY1后抑制作用得以重建,證明ORF3a通過與YY1相互作用解除其對MIEP的抑制。綜上,ORF3a通過與YY1結合并降低其抑制活性,促進HCMV MIEP的激活,可能驅動潛伏病毒的再激活。

  ORF3a促進YY1的泛素依賴性蛋白酶體降解

  確認SARS-CoV-2 ORF3a與YY1在宿主細胞中相互作用后,作者進一步探討了ORF3a對YY1的影響。隨著ORF3a表達量增加,293T細胞中YY1蛋白水平逐漸降低;在感染SARS-CoV-2的巨噬細胞中亦觀察到YY1顯著下降,敲低ORF3a后YY1表達恢復正常,提示ORF3a促進YY1降解。

  圖4.SARS-CoV-2的ORF3a促進YY1的泛素化降解

  免疫共沉淀實驗結合泛素標記顯示,ORF3a顯著促進了YY1的泛素化修飾。使用蛋白酶體抑制劑MG132能夠阻斷ORF3a介導的YY1降解,而溶酶體抑制劑NH4Cl無效,表明該降解依賴蛋白酶體途徑。

  進一步敲低E3泛素連接酶TRIM59或TRAF3發(fā)現(xiàn),只有TRIM59缺失阻斷了ORF3a誘導的YY1降解。在SARS-CoV-2感染的巨噬細胞中,TRIM59敲低也恢復了YY1蛋白水平。綜上,ORF3a通過與E3連接酶TRIM59相互作用,促進YY1的泛素依賴性蛋白酶體降解。

  SARS-CoV-2 ORF3a促進HCMV從潛伏期重新激活

  除此之外,研究利用THP-1細胞建立HCMV潛伏模型,結合ORF3a的穩(wěn)定表達,發(fā)現(xiàn)ORF3a促進了HCMV主要即刻早期基因(IE1/IE2)的表達,加快了病毒從潛伏期向活躍復制的轉變。RT-qPCR和Western blot結果均顯示,ORF3a表達使IE1/IE2轉錄及蛋白水平在TPA誘導的巨噬細胞分化過程中顯著升高,同時YY1蛋白水平明顯下降,但其mRNA水平無顯著變化,提示ORF3a通過促進YY1蛋白降解激活MIEP。

  圖5.SARS-CoV-2的ORF3a促進HCMV從潛伏期再激活

  在SARS-CoV-2與HCMV共感染模型中,敲低ORF3a可恢復YY1蛋白表達,抑制HCMV再激活和復制,且ΔORF3a突變的SARS-CoV-2病毒增強HCMV IE1/IE2表達及復制能力明顯減弱。以上結果表明,SARS-CoV-2 ORF3a通過介導YY1降解,解除其對HCMV MIEP的抑制,從而促進潛伏HCMV的再激活和病毒復制。

  綜上所述,本研究首次揭示了SARS-CoV-2蛋白ORF3a通過與轉錄抑制因子YY1相互作用,促進其泛素依賴性降解,從而激活HCMV主要即刻早期啟動子(MIEP),促進潛伏HCMV的再激活。該機制為SARS-CoV-2與HCMV共感染過程中病毒相互作用提供了分子基礎,強調了ORF3a作為潛在治療靶點的重要性。未來研究需建立更具生理相關性的模型,深入探索SARS-CoV-2共感染引發(fā)HCMV再激活的多因素調控機制,并評估其在COVID-19長期并發(fā)癥中的作用,為臨床干預提供新思路。

  原文鏈接:https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013344

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