編輯丨王多魚

排版丨水成文

長鏈非編碼 RNA（lncRNA）在機體衰老和細胞衰老過程中調(diào)控轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳程序。然而，目前還沒有全面的研究系統(tǒng)地整合多層面的分析來揭示它們多樣化的調(diào)控作用。此外，具有治療年齡相關(guān)疾病潛力的 lncRNA 仍未得到探索。

近日，北京大學韓敬東教授團隊（博士研究生朱壽軒、博士后營孫陽為論文共同第一作者）在 Nature 子刊Nature Aging上發(fā)表了題為：Multiomic single-cell perturbation screens reveal critical lncRNA regulators of senescence 的研究論文。

該研究利用單細胞多組學擾動建立了衰老相關(guān) lncRNA 多組學調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并進一步揭示了 lncRNAHOTAIRM1的抗衰老分子機制，此外，基于 AAV 的 HOTAIRM1 過表達，能夠減輕老年小鼠的纖維化，緩解組織損傷，并促進細胞增殖，突顯了其抗衰老治療潛力。

在這項新研究中，研究團隊利用基于 Perturb-seq 的 CRISPR–dCas9–KRAB 敲低系統(tǒng)結(jié)合單細胞多組學分析，從而能夠同時進行轉(zhuǎn)錄組和染色質(zhì)可及性分析，系統(tǒng)性篩選出了 32 種高豐度、具有獨立啟動子的衰老及細胞衰老相關(guān)長鏈非編碼 RNA（PtbAlnc）。

這項分析揭示了此前未被表征的 lncRNA 在衰老調(diào)控中的關(guān)鍵作用，并通過計算和實驗進行了驗證。這些 lncRNA 通過單細胞 ATAC 測序模塊中多樣但有重疊的表觀遺傳基序來調(diào)控不同的單細胞 RNA 測序模塊。其中，HOTAIRM1是一種與 DNA 修復(fù)相關(guān)的 PtbAlnc，它通過與 BANF1 和 p53 在凝聚體內(nèi)雙鏈斷裂位點協(xié)同作用來穩(wěn)定 DNA 修復(fù)，其缺乏會損害 DNA 修復(fù)，并引發(fā) p53 介導(dǎo)的細胞衰老。

HOTAIRM1 協(xié)調(diào) DNA 修復(fù)并調(diào)控 p53 介導(dǎo)的細胞衰老

研究團隊進一步證實，在自然衰老小鼠（20 月齡）的肺部，腺相關(guān)病毒（AAV）介導(dǎo)的 HOTAIRM1 過表達能夠減輕纖維化，緩解組織損傷，并促進細胞增殖，突顯了其抗衰老治療潛力。

總的來說，該研究建立了一套面向衰老相關(guān) lncRNA 研究的單細胞多組學解析范式，不僅深化了對 lncRNA 調(diào)控衰老機制的認識，也為衰老相關(guān)疾病的干預(yù)提供了潛在新靶點。

論文鏈接：

https://www.nature.com/articles/s43587-026-01100-7