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監(jiān)測(cè)預(yù)警基礎(chǔ)20-Serfling回歸模型是什么?本質(zhì)、內(nèi)涵和用途如何理解?

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系列簡(jiǎn)介

這是我們一系列原創(chuàng)技術(shù)貼,從易到難,每天學(xué)習(xí)一點(diǎn)。所有內(nèi)容均為疾控?cái)?shù)據(jù)分析、科研論文相關(guān),或者說(shuō)很多和現(xiàn)在的熱門(mén)監(jiān)測(cè)預(yù)警相關(guān),所以我們這個(gè)系列就叫“監(jiān)測(cè)預(yù)警基礎(chǔ)”。

今天是第20節(jié),經(jīng)過(guò)2節(jié)課的預(yù)熱,我們終于來(lái)到了最近3-4節(jié)的主題——Serfling回歸,快學(xué)起來(lái)吧。

在傳染病監(jiān)測(cè)領(lǐng)域,我們常常面臨一個(gè)核心問(wèn)題:如何判斷當(dāng)前的發(fā)病人數(shù)、或者說(shuō)死亡人數(shù)是否“異?!保?/strong>是正常的季節(jié)性波動(dòng),還是某種傳染病比如流感的悄然襲擊?

60年前,一位美國(guó)流行病學(xué)家用一套簡(jiǎn)潔而強(qiáng)大的統(tǒng)計(jì)模型,給出了經(jīng)久不衰的答案。今天,我們就來(lái)深入剖析這個(gè)監(jiān)測(cè)領(lǐng)域的經(jīng)典工具——Serfling回歸模型。


Serfling回歸模型,由Robert Serfling博士于1963年創(chuàng)立,是歷史上首個(gè)被系統(tǒng)用于量化流感相關(guān)超額死亡率的統(tǒng)計(jì)模型。

它的核心思路非常直觀(guān):

1.尋找“常態(tài)”收集過(guò)去多年每周的死亡數(shù)據(jù)。

2.剝離“流感”手動(dòng)剔除歷史上明確是流感高峰的時(shí)期,剩下的數(shù)據(jù)被視為“無(wú)流感干擾的本底狀態(tài)”。

3.建模預(yù)測(cè)用這些“干凈”的數(shù)據(jù)擬合一個(gè)模型,這個(gè)模型能刻畫(huà)死亡率的長(zhǎng)期趨勢(shì)固定季節(jié)波動(dòng)

4.照亮“異?!?/strong>將這個(gè)模型外推到全年,生成一條連續(xù)的“預(yù)期死亡基線(xiàn)”。這條線(xiàn)回答了一個(gè)關(guān)鍵的假設(shè)性問(wèn)題:“如果今年完全沒(méi)有流感,死亡情況本應(yīng)如何?”

最后,將實(shí)際觀(guān)測(cè)到的死亡數(shù),與這條理論基線(xiàn)進(jìn)行比較。持續(xù)超出基線(xiàn)的部分,就被估算為流感帶來(lái)的“超額死亡”,當(dāng)然,所有這些死亡,你都可以理解為發(fā)病。


本質(zhì)是“基線(xiàn)模型”該方法的核心思想是利用正弦和余弦函數(shù)的循環(huán)回歸特性,處理時(shí)間序列中的季節(jié)性或循環(huán)波動(dòng)的情況,它不預(yù)測(cè)未來(lái),而是定義“常態(tài)”,它的全部工作就是建立一條合理的基準(zhǔn)線(xiàn),所有監(jiān)測(cè)都始于與這條線(xiàn)的比較。

內(nèi)核是“反事實(shí)推斷”這是其最深刻的內(nèi)涵。它通過(guò)統(tǒng)計(jì)方法構(gòu)建了一個(gè)未曾發(fā)生的“反事實(shí)世界”(無(wú)特殊異常的世界),并將現(xiàn)實(shí)與之對(duì)比,從而量化出疾病的具體影響。

精髓在于“分離”它將時(shí)間序列數(shù)據(jù)中的信號(hào)分離為三部分:


  • 趨勢(shì)(緩慢變化)

  • 季節(jié)(規(guī)律波動(dòng))

  • 超額(異常信號(hào))


模型捕捉前兩者,剩下的突出部分就可能是超額。

一個(gè)生動(dòng)的比喻Serfling模型就像一位嚴(yán)謹(jǐn)?shù)臍v史氣象學(xué)家。他先研究過(guò)去幾十年非臺(tái)風(fēng)季節(jié)的風(fēng)力數(shù)據(jù),總結(jié)出四季的正常風(fēng)力變化規(guī)律,然后,他用這個(gè)規(guī)律去審視全年數(shù)據(jù)。當(dāng)他在某個(gè)夏秋之交,發(fā)現(xiàn)實(shí)際風(fēng)速持續(xù)、顯著地超過(guò)了正常規(guī)律預(yù)測(cè)的值時(shí),他就可以斷言:“這里有一個(gè)臺(tái)風(fēng)信號(hào),它的‘破壞力’可以用超過(guò)正常值的部分來(lái)衡量。


原始論文中,Serfling使用最小二乘法擬合以下模型:


讓我們拋開(kāi)公式,理解其操作邏輯:

第一步:準(zhǔn)備數(shù)據(jù)

收集至少5-7年的每周發(fā)病人數(shù),

第二步:定義“基線(xiàn)期”(關(guān)鍵?。?/strong>

在歷史數(shù)據(jù)中,手工標(biāo)記并剔除所有明確的流感流行周。Serfling本人剔除了每年死亡率最高的約10%的周。剩下的數(shù)據(jù),就是構(gòu)建模型的“凈土”。

第三步:擬合模型

用“凈土”數(shù)據(jù)擬合一個(gè)方程:發(fā)病情況 = 長(zhǎng)期趨勢(shì) + 季節(jié)性波浪

“季節(jié)性波浪”通常用一對(duì)正弦-余弦函數(shù)來(lái)完美模擬其平滑、周期性的波動(dòng)。這一步在統(tǒng)計(jì)軟件中可輕松完成。

第四步:繪制基線(xiàn),設(shè)定閾值

將上述方程用于預(yù)測(cè)全年每一周(包括之前被剔除的流感季),得到貫穿全年的預(yù)期發(fā)病基線(xiàn)。在此基線(xiàn)上方,計(jì)算一個(gè)流行病閾值線(xiàn)(通常為基線(xiàn)預(yù)測(cè)值的95%置信區(qū)間上限)。

第五步:比較與計(jì)算

將當(dāng)前實(shí)際的發(fā)病曲線(xiàn)與預(yù)測(cè)基線(xiàn)、閾值線(xiàn)繪制在同一張圖上。

  • 何時(shí)暴發(fā)?實(shí)際曲線(xiàn)持續(xù)突破閾值線(xiàn)時(shí),提示流行開(kāi)始。

  • 負(fù)擔(dān)多重?將流行期內(nèi),實(shí)際曲線(xiàn)與基線(xiàn)之間區(qū)域的“面積”(死亡數(shù)的累計(jì)差值)加總,即得到超額死亡總數(shù)。


具體來(lái)說(shuō),就是將擬合方程的病例基線(xiàn)95% 置信區(qū)間的上限作為流行閾值,觀(guān)察值大于流行閾值的時(shí)間定義為流行期,該期內(nèi)觀(guān)察值與擬合基線(xiàn)的差值即為超額病例數(shù),用超額病例數(shù)與流行期擬合基線(xiàn)病例數(shù)的比值反映超額幅度即超額占比。

好的,就先這樣吧,具體如何操作,下一節(jié)我們以實(shí)際例子詳細(xì)講述一下怎么操作。



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