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意難平!這位華裔泰斗發(fā)明的引物延伸法,直接催生兩大諾獎,本人卻終生無緣諾獎

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在科學(xué)界,有這樣一位「無冕之王」:他雖然一生與諾貝爾獎擦肩而過,但 1980 年與 1993 年的兩項(xiàng)諾貝爾獎核心技術(shù),都建立在他親手敲下的底層邏輯之上。他是國際學(xué)術(shù)界公認(rèn)的生物科學(xué)泰斗 —— 吳瑞先生。


圖片來源:Ray Wu Fund [1]

一位頂級科學(xué)家的貢獻(xiàn),一種在于他親手推開了多少扇真理的大門,另一種則在于他為后輩點(diǎn)亮了多少盞指路明燈。吳瑞先生不僅做到了前者,更把后半生的全部心血傾注在了后者。

01 解碼「DNA 天書」的第一行

1968 年,距離沃森和克里克發(fā)現(xiàn) DNA 雙螺旋結(jié)構(gòu)已過去 15 年,科學(xué)界早已明確 DNA 是遺傳信息的載體,由 A、T、C、G 四種堿基組成。早在 1955 年,桑格(Frederick Sanger)就已測定出胰島素的氨基酸序列,但面對 DNA,整個學(xué)術(shù)界卻陷入了困境,DNA 測序被視為無法突破的禁區(qū)。

當(dāng)時的技術(shù)條件存在諸多局限:DNA 成分單一,只有 4 種堿基,化學(xué)性質(zhì)極其相似,很難像氨基酸那樣逐一剝離。而且鏈條過長,動輒數(shù)萬個堿基,當(dāng)時的提純技術(shù)無法獲得足夠純凈且長度適中的片段。當(dāng)時限制性內(nèi)切酶(Restriction Enzymes)尚未被廣泛發(fā)現(xiàn)和應(yīng)用(直到 1970 年才首次發(fā)現(xiàn)),科學(xué)家無法精準(zhǔn)地切割 DNA。

人類已經(jīng)知道了 DNA 是遺傳信息的載體,卻對如何「讀取」它一籌莫展。

彼時,受桑格早期研究的影響,學(xué)術(shù)界的主流思維一直局限于如何通過化學(xué)或核酸酶將 DNA 鏈「降解」來分析。而吳瑞反其道而行之,首創(chuàng)了「邊合成邊測序」的方法 ——

他沒有去切割 DNA,而是以噬菌體 λ DNA 末端游離的 12 個單鏈堿基作為模板,其互補(bǔ)鏈內(nèi)凹的 3'-羥基(3'-OH)則天然充當(dāng)了聚合酶結(jié)合的起點(diǎn)。在反應(yīng)體系中,吳瑞精確地交替加入帶有放射性同位素(如 32P)標(biāo)記的脫氧核苷酸(dNTPs)。聚合酶每延伸補(bǔ)齊一個堿基,放射性信號便被錨定在新合成的鏈上。通過控制反應(yīng)時間和逐一添加堿基的策略,他精確測量了被納入鏈中的堿基種類和數(shù)量。[2]

這一突破確立了「酶促合成測序法」的范式,標(biāo)志著生命科學(xué)研究從「觀察分子形態(tài)」的宏觀時代,正式跨越到了「解碼遺傳代碼」的微觀時代,為后續(xù) DNA 測序技術(shù)的發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。

02 他奠定了兩項(xiàng)諾獎技術(shù)基礎(chǔ)

如果說 1968 年的突破是實(shí)現(xiàn)了對特定 DNA 片段的「首度解碼」,那么1971 年,吳瑞則為全人類發(fā)明了讀取 DNA 遺傳密碼的「通用指南」。

在那個生化反應(yīng)尚顯粗糙的年代,吳瑞首次提出引物延伸(Primer Extension)原理——

通過人工合成一段短小的寡核苷酸(即引物),使其與模板 DNA 的特定位置雜交(Hybridization),就能引導(dǎo)聚合酶從精準(zhǔn)的起始點(diǎn)開始定向合成 [3]。

這一發(fā)現(xiàn),徹底重塑了現(xiàn)代生物科學(xué)。

1980 年諾獎得主 Sanger 的雙脫氧法,本質(zhì)上就是在吳瑞的引物延伸體系里,巧妙地加入了一個終止堿基(ddNTP)。斬獲 1993 年諾獎的 PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù),其核心動力學(xué)完全建立在雙引物介導(dǎo)的延伸之上。

可以說,今天我們做的每一次核酸檢測、每一項(xiàng)基因測序,都離不開吳瑞在 1971 年的這項(xiàng)偉大發(fā)明。

在重組 DNA 技術(shù)發(fā)展的初期,異源 DNA 片段的「末端不兼容」仍是該領(lǐng)域面臨的瓶頸。盡管限制性內(nèi)切酶能夠?qū)固囟ㄐ蛄羞M(jìn)行切割,但物理剪切或不同內(nèi)切酶產(chǎn)生的平末端(Blunt ends)及非互補(bǔ)粘性末端,嚴(yán)重阻礙了連接酶的催化效率,導(dǎo)致基因片段無法實(shí)現(xiàn)通用的跨物種拼接。

1976 年,吳瑞實(shí)驗(yàn)室打破了這一技術(shù)僵局。

他們率先將化學(xué)合成技術(shù)與酶學(xué)手段相結(jié)合,發(fā)明了DNA 聯(lián)接子(Linkers)[4] 與銜接子(Adaptors)[5]。這項(xiàng)技術(shù)通過在目的片段末端共價附加含有特定核酸內(nèi)切酶識別序列的短雙鏈寡核苷酸,賦予了任意 DNA 片段人工定制的「粘性末端」。

后來我們熟知的利用大腸桿菌生產(chǎn)人胰島素、構(gòu)建各類工程菌,均繞不開這套高效的 DNA 組裝方案,直接奠定了現(xiàn)代生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)化的基礎(chǔ)。

03 老先生傳奇的一生

在 20 世紀(jì) 70 年代末,許多尖端實(shí)驗(yàn)協(xié)議(Protocols)僅在少數(shù)頂尖實(shí)驗(yàn)室口耳相傳,缺乏統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)的可重復(fù)性極低。

吳瑞先生承擔(dān)了科學(xué)界極其重要的一項(xiàng)基建工程:他主編了學(xué)術(shù)界「圣經(jīng)」——《酶學(xué)方法》(Methods in Enzymology)中關(guān)于重組 DNA(Recombinant DNA)的關(guān)鍵卷次(如第 68、100、101 卷等)[6]。

這種標(biāo)準(zhǔn)化的推廣,使得即便是資源有限的發(fā)展中國家實(shí)驗(yàn)室,也能開展復(fù)雜的分子克隆研究。吳瑞先生讓生物技術(shù)從少數(shù)科學(xué)家的領(lǐng)地,變成了全球共享的科學(xué)生產(chǎn)力。

如果說 1968 年和 1971 年的發(fā)現(xiàn)是吳瑞在分子層面上書寫傳奇,那么他后半生的重心,則轉(zhuǎn)向了更為宏大的命題 —— 科學(xué)知識的代際傳承與跨國界的人才播種。

在 80 年代初期,中國生命科學(xué)領(lǐng)域面臨嚴(yán)重的人才斷層。吳瑞敏銳地意識到,單純引進(jìn)技術(shù)是不夠的,必須將中國最優(yōu)秀的學(xué)生送往世界頂尖的實(shí)驗(yàn)室。

1981 年,吳瑞用自己作為頂尖科學(xué)家的個人信譽(yù)作為擔(dān)保,給幾十所美國名校寫信游說,說服他們接受由他專門組織的一套「CUSBEA 專項(xiàng)考試」。[7]

他動用自己的人脈,每年邀請、甚至親自陪同美國頂尖大學(xué)的知名教授(如康奈爾大學(xué)的 Richard McCarty 教授等)飛到北京和廣州,去給中國學(xué)生做一對一的全英文面試。[8]

CUSBEA 的項(xiàng)目從 1981 年開始,到 1989 年結(jié)束,在這 8 年間,共選拔派出了 422 名優(yōu)秀的中國學(xué)生赴美頂尖高校攻讀生命科學(xué)領(lǐng)域的博士學(xué)位 ——

袁鈞瑛(第一屆學(xué)者): 現(xiàn)任哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院終身教授、美國國家科學(xué)院院士。她發(fā)現(xiàn)了控制細(xì)胞凋亡的關(guān)鍵基因,隨后開創(chuàng)了細(xì)胞程序性壞死(Necroptosis)這一全新研究領(lǐng)域。

王曉東(第三屆學(xué)者):41 歲即當(dāng)選美國國家科學(xué)院院士,他在細(xì)胞凋亡的生化途徑解析上做出了諾獎級別的突破性貢獻(xiàn),并于 2003 年回國創(chuàng)辦了深刻影響中國科研體制的北京生命科學(xué)研究所(NIBS)。

施揚(yáng)(第一屆學(xué)者): 現(xiàn)任牛津大學(xué)路德維希癌癥研究所主任,他在 2004 年發(fā)現(xiàn)了人類歷史上第一個組蛋白去甲基化酶(LSD1),推翻了學(xué)術(shù)界幾十年的教條,為癌癥靶向治療提供了大量全新靶點(diǎn)。

解密神經(jīng)環(huán)路的駱利群、發(fā)現(xiàn)干細(xì)胞關(guān)鍵機(jī)制的林海帆、推動中國科研體制改革的王小凡 ……

這份熠熠生輝的名單很長。這 422 人,匯聚成了推動 21 世紀(jì)生命科學(xué)狂飆突進(jìn)的中堅力量。

2007 年,饒毅和清華大學(xué)教授施一公、美國杜克大學(xué)教授王小凡共同給國務(wù)院起草了一份建議書,建議增加中國研究生的待遇,包括吳瑞在內(nèi)的 50 多位學(xué)者在上面簽名。饒毅說「這應(yīng)該是他生命中簽名的最后一份提議[9]—— 吳瑞先生于 2008 年去世。


在吳瑞先生的追思會上,他實(shí)驗(yàn)室的資深研究員阿杰 · 加格(Ajay Garg)說道:「吳教授是一位真正的遠(yuǎn)見卓識者,他總是鼓勵實(shí)驗(yàn)室成員去探索創(chuàng)新的想法,并始終致力于確保他的科研成果能夠造福全世界盡可能多的人?!筟10]

吳瑞先生一生與諾貝爾獎擦身而過 ——盡管今天的測序技術(shù)已經(jīng)跨越到了第三代,但吳瑞先生發(fā)明的「引物延伸法」作為其核心邏輯,至今仍未改變 [11]。許多諾獎得主(如 James Watson)都是他的摯友,而他在康奈爾大學(xué)親手帶出的博士生杰克 · 紹斯塔克(Jack Szostak),也憑借端粒酶的發(fā)現(xiàn)斬獲了2009 年的諾貝爾獎。

對于吳瑞先生未能摘取諾貝爾獎的遺憾,學(xué)術(shù)界常常為之惋惜。

2016 年,時任哈佛大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授的頂尖計算生物學(xué)家劉小樂(Xiaole Shirley Liu),曾對此作過一段極其深刻的評價:

「作為一名 50 年代初到美國的華裔移民,吳瑞當(dāng)時所面臨的社會與種族挑戰(zhàn)無疑是極其巨大的。在缺乏社會背景和人脈支撐的情況下,他完全是憑借其卓越的科學(xué)天分與一顆純粹的向善之心,才登上了事業(yè)的頂峰。如果他是一位來自英美的白人科學(xué)家,哪怕只是身處當(dāng)今這個時代,他的科學(xué)貢獻(xiàn)理應(yīng)得到更高的贊譽(yù)與認(rèn)可。但或許,我們有時不必過分執(zhí)著于獎項(xiàng)或 H 指數(shù)(H-index),而應(yīng)以一個人對科學(xué)界的整體影響,來客觀地評價他?!筟11]

「功成不必在我,功成必定有我」或許就是他最無憾的注腳。

參考資料:

[1]https://raywufund.org

[2]Wu R, Kaiser AD. Structure and base sequence in the cohesive ends of bacteriophage lambda DNA. J Mol Biol. 1968 Aug 14;35(3):523-37. doi: 10.1016/0022-2836(68)80012-9. PMID: 4299833.

[3]Wu R. Nucleotide sequence analysis of DNA. I. Partial sequence of the cohesive ends of bacteriophage lambda and 186 DNA. J Mol Biol. 1970 Aug;51(3):501-21. doi: 10.1016/0022-2836(70)90004-5. PMID: 4321727.

[4]Bahl CP, Marians KJ, Wu R, Stawinsky J, Narang SA. A general method for inserting specific DNA sequences into cloning vehicles. Gene. 1976;1(1):81-92. doi: 10.1016/0378-1119(76)90008-1. PMID: 1052323.

[5]Roychoudhury R, Jay E, Wu R. Terminal labeling and addition of homopolymer tracts to duplex DNA fragments by terminal deoxynucleotidyl transferase. Nucleic Acids Res. 1976 Jan;3(1):101-16. doi: 10.1093/nar/3.1.101. PMID: 765970; PMCID: PMC342881.

[6]Wu R. Methods in Enzymology volume 68 recombinant DNA. Methods Enzymol. 1979;68:1-555. doi: 10.1016/0076-6879(79)68001-1. PMID: 94418.

[7]https://news.sciencenet.cn/sbhtmlnews/200772694821625185420.html

[8]https://news.sciencenet.cn/htmlnews/200794113332342188572.html

[9]https://www.bio.pku.edu.cn/homes/Index/news_cont/4/3805.html

[10]https://news.cornell.edu/stories/2008/06/friends-and-family-gather-kendal-remember-ray-wu

[11]Luo L, Wu R. Ray Wu, fifth business or father of DNA sequencing? Protein Cell. 2016 Jul;7(7):467-70. doi: 10.1007/s13238-016-0271-8. Epub 2016 Jun 6. PMID: 27271424; PMCID: PMC4930775.

題圖來源:圖蟲創(chuàng)意

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