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北京化工大學(xué)徐福建教授團隊《自然·通訊》:仿生納米平臺以“能量中斷”策略逆轉(zhuǎn)銅綠假單胞菌耐藥性

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抗菌素耐藥性(AMR)的快速出現(xiàn)已成為當(dāng)今最緊迫的全球公共衛(wèi)生挑戰(zhàn)之一,這使得傳統(tǒng)抗生素對多種病原菌逐漸失效。尤其令人擔(dān)憂的是革蘭氏陰性菌,如銅綠假單胞菌,這種高優(yōu)先級病原體因其固有的耐藥機制(如低外膜滲透性和高表達外排泵)而臭名昭著,是免疫功能低下患者(如囊性纖維化患者)呼吸道感染的主要致病菌。根據(jù)2022年CHINET報告,它在臨床呼吸道病原體中名列前茅。盡管β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類和氟喹諾酮類藥物是當(dāng)前治療銅綠假單胞菌感染的主要手段,但耐藥性的發(fā)展嚴重損害了其療效。更嚴峻的是,自1980年代以來,針對革蘭氏陰性菌的新型抗生素開發(fā)進展甚微,這使得優(yōu)化現(xiàn)有抗生素療效的策略變得迫在眉睫。

針對上述挑戰(zhàn),北京化工大學(xué)徐福建教授、趙娜娜教授張凱副教授團隊提出并展示了一種仿生納米平臺(Ce-Car@EV NPs)。該平臺通過合理整合姜來源的細胞外囊泡(EVs)和pH響應(yīng)性的鈰-羧芐青霉素配位納米顆粒(Ce-Car NCPs)構(gòu)建而成。這種設(shè)計實現(xiàn)了納米顆粒在體內(nèi)的長效循環(huán),并能在酸性的感染部位特異性降解,從而釋放出Ce??離子和羧芐青霉素。釋放的Ce??離子能穿透細菌細胞,通過破壞ATP合成、阻礙氧化磷酸化并抑制外排泵活性來干擾細菌的能量代謝。通過耗竭ATP并阻斷外排泵,Ce??離子作為羧芐青霉素的強效佐劑,成功地逆轉(zhuǎn)了細菌耐藥性。研究團隊在體內(nèi)外證實,該策略能有效恢復(fù)羧芐青霉素對耐藥銅綠假單胞菌的殺菌效力,為利用金屬佐劑對抗抗菌素耐藥性建立了一種新的治療范式。相關(guān)論文以“Biomimetic metal-drug coordination nanoplatform to counteract drug resistance in Pseudomonas aeruginosa via energy disruption”為題,發(fā)表在

Nature Communications
上。


研究團隊首先通過一鍋法自組裝成功制備了Ce-Car NCPs,隨后通過超聲處理將其封裝在姜來源的EVs中,形成Ce-Car@EV NPs。透射電鏡圖像清晰顯示,約10 nm的Ce-Car NCPs被成功包裹在典型的碟形EVs內(nèi)部,XPS、FTIR及分子軌道模擬等多種表征手段證實了Ce(IV)與羧芐青霉素之間的成功配位以及EVs的成功包覆。更重要的是,體外釋放研究表明,在模擬感染微環(huán)境的酸性條件(pH 5.5)下,該納米平臺在12小時內(nèi)釋放了超過70%的羧芐青霉素,而在生理條件(pH 7.4)下釋放量不足15%,展現(xiàn)出了優(yōu)異的pH響應(yīng)控制釋放能力。進一步的分子對接模擬顯示,Ce(IV)的存在不僅能通過靜電吸引增強羧芐青霉素與其靶標(biāo)蛋白PBP3的結(jié)合力(結(jié)合能從-6.93 kcal/mol降至-7.84 kcal/mol),還能穩(wěn)定藥物-蛋白復(fù)合物,從而協(xié)同增強抗菌效果。


圖1. 仿生Ce-Car@EVs納米平臺示意圖:用于在小鼠肺炎模型中對抗耐藥銅綠假單胞菌感染,該平臺具有高細胞內(nèi)抗生素滯留和體內(nèi)長循環(huán)的特性。


圖2. Ce-Car@EV NPs的制備與表征。 a Ce-Car@EV NPs的制備流程示意圖。 b Ce-Car NCPs、G-EVs和Ce-Car@EV NPs的透射電鏡圖像。 c Ce-Car NCPs的最高占據(jù)分子軌道(HOMO)和最低未占分子軌道(LUMO)的局部電荷密度圖。 d Car和Ce-Car NCPs的傅里葉變換紅外光譜。 e Ce-Car NCPs、G-EVs和Ce-Car@EV NPs的Zeta電位。 f Ce-Car@EV NPs在pH 5.5和7.4的Tris-HCl緩沖液中的Car釋放曲線。 g G-EVs和Ce-Car@EV NPs的SDS-PAGE蛋白分析。 h 在無Ce(IV)情況下,Car與青霉素結(jié)合蛋白3(PBP3)結(jié)合的分子對接模擬。 i 在有Ce(IV)情況下,Car與PBP3結(jié)合的分子對接模擬。

體外抗菌實驗證實了這種pH響應(yīng)性帶來的優(yōu)勢。在pH 5.5的酸性環(huán)境下,32 μg/mL的Ce-Car@EV NPs能殺滅96.81%的銅綠假單胞菌,而在pH 7.4時細菌存活率仍高于80%?;?死細菌染色和掃描電鏡圖像也直觀地顯示,只有在酸性條件下經(jīng)Ce-Car@EV NPs處理的細菌才出現(xiàn)大量死亡和嚴重的結(jié)構(gòu)變形。棋盤稀釋法驗證了Ce(IV)與羧芐青霉素的協(xié)同作用(FICI指數(shù)為0.5)。更為關(guān)鍵的是,在連續(xù)傳代30次的耐藥性誘導(dǎo)實驗中,游離羧芐青霉素處理組的最低抑菌濃度(MIC)飆升了256倍,而Ce-Car@EV NPs處理組則顯著延遲且降低了耐藥性的產(chǎn)生。對于已產(chǎn)生的耐藥菌,Ce-Car@EV NPs在16 μg/mL的濃度下就能將其殺滅,而游離羧芐青霉素在高達2048 μg/mL時仍效果不佳。


圖3. Ce-Car@EV NPs的體外抗菌性能。 a 在pH 5.5和7.4條件下,不同濃度Ce-Car@EV NPs處理2小時后標(biāo)準(zhǔn)銅綠假單胞菌的活力。 b 不同pH條件下,經(jīng)Ce-Car@EV NPs處理后的銅綠假單胞菌活/死染色。 c 不同pH條件下,經(jīng)Ce-Car@EV NPs處理后銅綠假單胞菌的掃描電鏡圖像。 d Car和Ce(IV)聯(lián)合抗銅綠假單胞菌的棋盤稀釋法協(xié)同效應(yīng)分析。 e 經(jīng)Ce-Car@EV NPs誘導(dǎo)30代后,銅綠假單胞菌對Car的耐藥性發(fā)展。 f Car和Ce(IV)聯(lián)合抗耐藥銅綠假單胞菌的棋盤稀釋法協(xié)同效應(yīng)分析。 g Car和Ce-Car@EV NPs對耐藥銅綠假單胞菌的抗菌效果。 h 不同濃度Car和Ce-Car@EV NPs與耐藥銅綠假單胞菌共孵育4小時后的細菌活力。 i 對應(yīng)h圖的耐藥銅綠假單胞菌平板計數(shù)數(shù)據(jù)。

為了深入揭示其克服耐藥性的機制,研究團隊進行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析。結(jié)果表明,與游離羧芐青霉素誘導(dǎo)的耐藥菌相比,經(jīng)Ce-Car@EV NPs處理的細菌其基因表達譜變化幅度更小。京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析顯示,差異基因顯著富集在碳代謝、氧化磷酸化、糖酵解/TCA循環(huán)等能量代謝通路上。熱圖分析進一步揭示,Ce-Car@EV NPs能顯著下調(diào)耐藥菌中高表達的外排泵基因(如mexA、mexB、oprM),并將其表達水平恢復(fù)至正常。同時,氧化磷酸化復(fù)合物I和IV的基因(如nuoE、ccoN2)以及TCA循環(huán)和糖酵解的關(guān)鍵酶基因(如acnA、pykA)也顯著下調(diào)。功能實驗驗證了這些轉(zhuǎn)錄水平的變化:Ce-Car@EV NPs以濃度依賴的方式顯著降低細菌內(nèi)ATP含量(100 μg/mL時降低60%),并抑制呼吸鏈復(fù)合物I和IV的活性,從而阻斷了外排泵的能量供應(yīng),使其外排功能顯著下降。這一系列多層次、多靶點的調(diào)控,構(gòu)成了其逆轉(zhuǎn)耐藥性的強大分子基礎(chǔ)。


圖4. Ce-Car@EV NPs克服銅綠假單胞菌耐藥性的機制。 a 三組細菌差異表達基因(DEGs)的韋恩圖。 b 不同處理后細菌DEGs的火山圖。 c PA-30M和PA-30R細胞間DEGs的基因本體論(GO)注釋分析。 d PA-30M和PA-30R細胞間DEGs的KEGG富集分析。 e 基于表達模式的細菌多藥外排相關(guān)基因的聚類分析。 f PA、PA-30R和PA-30M細胞中氧化磷酸化相關(guān)基因的熱圖。 g PA、PA-30R和PA-30M細胞中TCA循環(huán)和糖酵解相關(guān)基因的熱圖。 h Ce-Car@EV NPs作用于氧化磷酸化過程的機制示意圖。 i 不同濃度Ce-Car@EV NPs直接孵育后的ATP含量。 j 經(jīng)不同濃度Ce-Car@EV NPs處理24小時后,銅綠假單胞菌內(nèi)的ATP含量。 k Ce-Car NCPs對細菌呼吸鏈復(fù)合物I和IV活性的影響。 l 不同濃度Ce-Car@EV NPs對耐藥銅綠假單胞菌藥物外排泵活性的影響。

生物安全性是臨床應(yīng)用的前提。體外細胞毒性實驗顯示,即使?jié)舛雀哌_512 μg/mL,Ce-Car@EV NPs與L929、RAW 264.7等細胞共培養(yǎng)24小時后,細胞活力仍高于80%,且溶血率低于5%。在體內(nèi),注射了Ce-Car@EV NPs的小鼠在7天內(nèi)體重、體溫、血常規(guī)、血清生化指標(biāo)及主要器官組織切片均未見明顯異常,大腦皮層中的氧化應(yīng)激標(biāo)志物也無顯著變化,證明了其優(yōu)異的生物相容性。

得益于EVs的仿生偽裝,Ce-Car@EV NPs展現(xiàn)了卓越的體內(nèi)靶向能力?;铙w成像結(jié)果顯示,在感染耐藥銅綠假單胞菌的肺炎小鼠模型中,Ce-Car@EV NPs在感染肺部的富集量遠超未包覆的Ce-Car NCPs,且熒光信號可持續(xù)長達24小時藥代動力學(xué)研究表明,其血液循環(huán)半衰期達到了6.68小時,主要通過肝臟代謝和腎臟排泄兩條途徑在7天內(nèi)近乎完全清除,無明顯器官蓄積。


圖5. Ce-Car@EV NPs的體內(nèi)藥代動力學(xué)、生物分布與代謝。 a Ce-Car@EV NPs體內(nèi)成像流程示意圖。 b 尾靜脈注射Ce-Car NCPs或Ce-Car@EV NPs后不同時間點,耐藥銅綠假單胞菌肺炎小鼠的代表性體內(nèi)熒光圖像。 c 注射后不同時間點,感染肺區(qū)熒光信號強度的定量分析。 d 注射后6小時,主要器官和感染肺組織的熒光圖像。 e 對應(yīng)d圖的熒光強度定量分析。 f 靜脈注射后指定時間點血液中鈰濃度定量,以及通過非房室模型確定的循環(huán)半衰期。 g 注射后7天內(nèi)不同時間段糞便中排出的鈰質(zhì)量。 h 注射后7天內(nèi)不同時間段尿液中排出的鈰質(zhì)量。

在由耐藥銅綠假單胞菌引起的急性肺炎小鼠模型中,Ce-Car@EV NPs展現(xiàn)了強大的治療潛力。與生理鹽水、游離羧芐青霉素和Ce-Car NCPs處理組在36小時內(nèi)全部死亡不同,Ce-Car@EV NPs處理組的小鼠存活率顯著提高,且體重、體溫保持穩(wěn)定,臨床評分也明顯改善。治療后12小時,Ce-Car@EV NPs組小鼠肺組織和支氣管肺泡灌洗液中的細菌載量比其他組降低了2個多數(shù)量級,且有效阻止了細菌向心、肝、脾、腎等器官的擴散。治療60小時后,其肺組織中的細菌負荷進一步降低。肺組織切片的免疫熒光染色也直觀地證實了其卓越的殺菌效果。


圖6. Ce-Car@EV NPs對耐藥銅綠假單胞菌誘導(dǎo)的肺部感染的體內(nèi)治療效果。 a 建立耐藥銅綠假單胞菌誘導(dǎo)的急性肺部感染模型和治療方案的設(shè)計。 b 經(jīng)Car、Ce-Car NCPs或Ce-Car@EV NPs治療的感染小鼠在36小時內(nèi)的存活率。 c 接受不同治療后,感染小鼠在12小時內(nèi)體溫的變化。 d 接受不同治療后,感染小鼠在12小時內(nèi)體重的變化。 e 不同處理后小鼠肺組織的數(shù)碼圖像。 f 評估六個參數(shù)的臨床評分。 g 治療后12小時,肺勻漿中存活細菌的定量。 h 治療后12小時,支氣管肺泡灌洗液(BALF)中存活細菌的定量。 i 用抗耐藥銅綠假單胞菌抗體染色的肺切片免疫熒光圖像。

通過對肺組織損傷指標(biāo)的評估,Ce-Car@EV NPs的治療優(yōu)勢進一步凸顯。該處理組小鼠的肺濕干比(反映肺水腫程度)顯著低于其他感染組,支氣管肺泡灌洗液中的總蛋白濃度和乳酸脫氫酶(LDH)活性也最低,表明其有效減輕了感染引起的肺水腫和組織損傷。H&E染色和Masson染色結(jié)果顯示,Ce-Car@EV NPs處理組小鼠的肺組織結(jié)構(gòu)接近正常,炎癥細胞浸潤和纖維化程度最輕,而其他處理組的肺部則表現(xiàn)出明顯的病理損傷。


圖7. Ce-Car@EV NPs對耐藥銅綠假單胞菌誘導(dǎo)的肺炎感染的療效。 a 不同治療組的肺濕干比。 b 支氣管肺泡灌洗液(BALF)中的總蛋白濃度。 c 支氣管肺泡灌洗液(BALF)中的乳酸脫氫酶(LDH)活性。 d 治療后12小時小鼠的肺指數(shù)。 e 不同治療組肺切片的代表性H&E染色圖像。 f 不同治療組肺切片的代表性Masson染色圖像。

總結(jié)與展望

綜上所述,這項研究成功構(gòu)建了一種名為Ce-Car@EV的仿生pH響應(yīng)性納米平臺,通過協(xié)同整合姜來源細胞外囊泡與鈰-羧芐青霉素配位納米顆粒,為對抗和逆轉(zhuǎn)革蘭氏陰性菌的抗菌素耐藥性提供了創(chuàng)新方案。該平臺的核心優(yōu)勢在于其獨特的雙重作用機制:一方面通過靶向遞送和pH響應(yīng)釋放,實現(xiàn)抗生素在感染部位的高效富集;另一方面,釋放的Ce??離子通過耗竭細胞內(nèi)ATP、破壞氧化磷酸化和抑制外排泵活性,從能量代謝根源上“釜底抽薪”,逆轉(zhuǎn)細菌耐藥性。體內(nèi)外實驗結(jié)果一致證實了其卓越的抗菌效果和良好的生物安全性。這項工作不僅超越了傳統(tǒng)依賴外源能量的系統(tǒng),直接靶向耐藥性的生理基礎(chǔ),而且植物源囊泡的免疫調(diào)節(jié)潛力也為未來的抗感染治療提供了更廣闊的空間,為臨床治療多重耐藥菌感染開辟了一條充滿希望的新途徑。

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