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自組裝,最新Science封面!

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自然界中,從細(xì)菌菌落到細(xì)胞骨架,大量活性物質(zhì)展現(xiàn)出令人驚嘆的集體行為。然而,這些復(fù)雜現(xiàn)象背后的物理機制是什么?形狀如何影響微觀粒子的自組織?一項最新的研究通過人工合成的光驅(qū)活性棒狀材料,系統(tǒng)揭示了形狀各向異性與濃度如何共同調(diào)控從無序運動到有序集群、乃至活性湍流的豐富相行為。


在活性軟物質(zhì)研究領(lǐng)域,微米尺度的自驅(qū)動粒子因其能夠模擬生命系統(tǒng)的集體行為而備受關(guān)注。與各向同性的球形粒子不同,細(xì)長粒子會因其形狀而產(chǎn)生本征的各向異性排列效應(yīng),并經(jīng)歷與取向相關(guān)的立體和水動力學(xué)相互作用,從而產(chǎn)生截然不同的集體動力學(xué)。盡管諸多理論和模擬研究預(yù)測,自驅(qū)動棒狀材料可展現(xiàn)出包括集群、極性群游、向列相有序、活性湍流乃至堵塞在內(nèi)的豐富涌現(xiàn)行為,但此前的實驗研究大多局限于干燥的顆粒體系,缺乏流體力學(xué)相互作用和熱漲落,難以真實反映生物體系的復(fù)雜動力學(xué)。因此,開發(fā)一種能夠同時捕捉生物微游泳體關(guān)鍵特征(如微米尺度、沿長軸推進(jìn))的“最小模型”體系,對于理解自組織的物理機制、并將其與生物化學(xué)信號(如群體感應(yīng))解耦至關(guān)重要。

針對這一挑戰(zhàn),荷蘭特文特大學(xué)Hanumantha Rao Vutukuri課題組結(jié)合實驗與活性布朗動力學(xué)模擬,系統(tǒng)揭示了形狀誘導(dǎo)的排列效應(yīng)、立體和水動力學(xué)相互作用如何主宰活性棒狀材料的自組織。通過獨立改變棒的長徑比和面積分?jǐn)?shù),他們觀察到一系列相變過程,包括活性布朗運動、集群、活性湍流、群游、大團(tuán)簇和堵塞。最終,他們繪制了一幅相圖,總結(jié)了這些涌現(xiàn)行為,并通過時空分析揭示了不同狀態(tài)下獨特的巨數(shù)漲落現(xiàn)象。該最小模型為理解生物棒狀微游泳體的自組織提供了新視角,并為可編程合成活性材料的設(shè)計提供了物理規(guī)則。相關(guān)論文以“Shape anisotropy governs organization of active rods: Swarming, turbulence, flocking, and jamming”為題,發(fā)表在Science上,并被選為當(dāng)期封面論文。


實驗中,研究團(tuán)隊合成了由二氧化鈦頭部和二氧化硅尾部組成的光驅(qū)膠體棒。這些棒在綠光照射下,頭部發(fā)生光催化氧化還原反應(yīng),產(chǎn)生局部化學(xué)梯度,驅(qū)動棒沿長軸方向推進(jìn)。為了理解流體力學(xué)相互作用如何促進(jìn)團(tuán)簇形成,研究者利用二氧化硅示蹤粒子觀測了棒周圍的流場。粒子圖像測速顯示,流體從頭部前端向外推出,并在頭部后方彎曲向內(nèi),沿尾部方向耗散。這一流場模式表明該棒屬于“推進(jìn)型”推進(jìn)機制,與許多生物體系的特征一致。定量分析表明,示蹤粒子速度隨距離的衰減服從vr(r)=A/r2的關(guān)系,偶極強度A=36.9μm4/s,該標(biāo)度關(guān)系與考慮趨化相互作用和滲透流的理論預(yù)測相符。當(dāng)用聚合物刷層包被示蹤粒子以抑制趨化運動時,示蹤粒子僅表現(xiàn)出從棒頭部向外的滲透流,而無向內(nèi)的運動,進(jìn)一步證實了流場的來源。


圖1. 長徑比α=7.5的活性膠體桿的集體運動。 (A)流線及流速分布顯示流體在桿頭部被強烈推離,而流線在頭部后方彎曲并沿尾部耗散,證實桿表現(xiàn)出pusher型行為。 (B)裸二氧化硅和pNIPAM包覆二氧化硅示蹤粒子在桿頭部前方的徑向速度分量vr與距離r的關(guān)系。(插圖)vr與r的雙對數(shù)圖顯示裸示蹤粒子的標(biāo)度接近1/r3。黑線表示指數(shù)為?2.9的擬合。誤差條代表四根桿的標(biāo)準(zhǔn)差。

當(dāng)兩根棒以頭對頭、推進(jìn)方向相反的方式靠近時,它們會經(jīng)歷水動力學(xué)排斥;而當(dāng)它們以銳角同向推進(jìn)并靠近時,重疊的橫向流場會誘導(dǎo)水動力學(xué)吸引,形成配對。這種水動力學(xué)相互作用是團(tuán)簇形成的基礎(chǔ)。隨著面積分?jǐn)?shù)增加,系統(tǒng)的集體行為發(fā)生了顯著變化。在低面積分?jǐn)?shù)(?≤0.06)時,棒呈現(xiàn)活性布朗運動,隨機探索空間。當(dāng)?=0.11 時,相互作用導(dǎo)致棒自組織成2-5根的小團(tuán)簇。在?=0.23 時,形成內(nèi)聚性的集群,局部取向一致并集體運動。當(dāng)?=0.39 時,系統(tǒng)進(jìn)入活性湍流相,相同取向的團(tuán)簇頻繁碰撞,產(chǎn)生旋轉(zhuǎn)的混沌渦旋運動。進(jìn)一步增加 ? 至 0.72,形成更大、穩(wěn)定、緩慢移動的團(tuán)簇。最終在?≈0.9 時,系統(tǒng)完全堵塞,棒被固定。值得注意的是,在集群內(nèi)部,棒呈現(xiàn)交錯的之字形排列,這源于流體介導(dǎo)的水動力學(xué)排斥與頭部后方微弱的趨化吸引之間的平衡。通過使用頭尾尺寸相同的棒,研究者確認(rèn)集群行為并非由稍大的頭部導(dǎo)致,而是極性活性棒的一個普遍特征。


圖1(C至F)代表性明場與熒光顯微圖像顯示了隨面積分?jǐn)?shù)(φ)增加而不同的集體狀態(tài):(C)φ=0.01,各向同性狀態(tài)。插圖顯示具有TiO?頭部和SiO?尾部的桿的掃描電子顯微鏡圖像。(D)φ=0.23,集群狀態(tài)。插圖顯示團(tuán)簇內(nèi)桿的橫向交錯或鋸齒形排列。(E)φ=0.39,湍流狀態(tài)。(F)φ=0.72,大團(tuán)簇狀態(tài)。標(biāo)尺:10微米(F),1微米(C插圖)。

為了定量刻畫不同狀態(tài)的時空動力學(xué),研究者分析了速度自相關(guān)函數(shù)和數(shù)密度漲落。速度自相關(guān)函數(shù)在不同狀態(tài)下表現(xiàn)出鮮明差異:各向同性相中衰減緩慢,反映了持續(xù)運動與微弱相互作用;集群和湍流相中衰減加快,尤其是湍流相中由混沌局部流和強水動力學(xué)扭矩導(dǎo)致的衰減最快;而大團(tuán)簇相中則表現(xiàn)為初期陡降(由立體約束導(dǎo)致)與后期緩慢衰減(由密集穩(wěn)定團(tuán)簇導(dǎo)致)相結(jié)合的特征。數(shù)密度漲落的標(biāo)度分析進(jìn)一步揭示了非平衡行為。在平衡系統(tǒng)中,漲落遵循中心極限定理,標(biāo)度指數(shù)β=0。而在此實驗中,各向同性相 (?=0.01) 的β≈0.10,接近平衡;集群相 (?=0.23) 的 β≈0.21,呈現(xiàn)中等程度的巨數(shù)漲落;湍流相 (?=0.39) 的β≈0.38,表現(xiàn)出強烈的巨數(shù)漲落,反映了強關(guān)聯(lián)運動;而在大團(tuán)簇相 (?=0.72) 中,β≈0.05,漲落被強烈抑制。這些標(biāo)度行為揭示了從微弱相互作用到強關(guān)聯(lián)、再到擁擠抑制的完整轉(zhuǎn)變。


圖2. 活性膠體桿的時空動力學(xué)。 (A)不同面積分?jǐn)?shù)下的速度自相關(guān)函數(shù)(VACF)。(B)不同面積分?jǐn)?shù)下的歸一化數(shù)漲落ΔN/√?N?與平均粒子數(shù)?N?的關(guān)系。(C)不同面積分?jǐn)?shù)下的團(tuán)簇尺寸分布。(D至G)不同集體狀態(tài)的相應(yīng)圖像:各向同性(D)、集群(E)、湍流(F)和大團(tuán)簇(G)。(H)湍流狀態(tài)的渦量圖。

長徑比是調(diào)控集體行為的關(guān)鍵參數(shù)。通過對比長徑比α=4.5、7.5、11.6 和15.1 的棒,研究者發(fā)現(xiàn)了迥異的相行為。短棒 (α=4.5) 因高轉(zhuǎn)動擴散和弱排列作用,在高密度下僅形成瞬態(tài)無序團(tuán)簇并發(fā)生相分離,稀釋與密集區(qū)域共存。中等長徑比 (α=7.5) 的棒則呈現(xiàn)出最豐富的相圖:從各向同性到集群、再到活性湍流、大團(tuán)簇和堵塞。而高長徑比 (α=15.1) 的棒表現(xiàn)出更強的形狀誘導(dǎo)排列和更低的轉(zhuǎn)動擴散,集體運動在更低的面積分?jǐn)?shù)下即可觸發(fā)。它們呈現(xiàn)集群行為,并在中等面積分?jǐn)?shù)下形成更大的群游結(jié)構(gòu)。與 α=7.5 在?=0.39 時出現(xiàn)湍流不同,高長徑比棒在相同條件下湍流被抑制,轉(zhuǎn)而形成群游狀態(tài)。這證實了高各向異性會抑制湍流,與先前的模擬預(yù)測一致。隨著長徑比增加,相干運動所覆蓋的面積分?jǐn)?shù)范圍也相應(yīng)擴大。


圖3. 三種不同長徑比在一系列面積分?jǐn)?shù)范圍內(nèi)的涌現(xiàn)集體狀態(tài)。 長徑比α=4.5的短桿由于其高旋轉(zhuǎn)擴散,在中等面積分?jǐn)?shù)下產(chǎn)生瞬態(tài)團(tuán)簇狀態(tài)。在更高面積分?jǐn)?shù)下,其低各向異性導(dǎo)致相分離為稀薄和致密區(qū)域。相比之下,長桿(α=11.6和α=15.1)展現(xiàn)出與α=4.5桿不同的集體行為,隨面積分?jǐn)?shù)增加依次出現(xiàn)集群、群集和大團(tuán)簇狀態(tài)。α=11.6和α=15.1桿的圖像經(jīng)過帶通濾波處理以增強對比度和視覺清晰度。標(biāo)尺:20微米。

為了解耦立體與水動力學(xué)相互作用的貢獻(xiàn),研究者進(jìn)行了排除水動力學(xué)的活性布朗動力學(xué)模擬。模擬中,棒僅通過排斥立體相互作用、粒子數(shù)和轉(zhuǎn)動擴散產(chǎn)生集體行為。模擬重現(xiàn)了團(tuán)簇化和集群行為,但完全無法產(chǎn)生活性湍流。這一關(guān)鍵差異突顯了實驗中存在的水動力學(xué)相互作用(包括流體介導(dǎo)的扭矩和流場)對于驅(qū)動系統(tǒng)進(jìn)入活性湍流狀態(tài)的核心作用。模擬與實驗在團(tuán)簇尺寸分布、數(shù)密度漲落和速度自相關(guān)函數(shù)上的趨勢一致性,也驗證了模型的有效性。


圖4. 活性桿的實驗狀態(tài)相圖。 符號表示不同長徑比:方形為α=4.5,圓形為α=7.5,三角形為α=11.6,叉號為α=15.1。顏色編碼的背景區(qū)域作為視覺指南,突出不同的集體狀態(tài):各向同性(藍(lán)色):隨機取向的桿,無集體運動;集群(綠色):排列的桿表現(xiàn)出集體運動(α=7.5、α=11.6和α=15.1);瞬態(tài)團(tuán)簇(粉色,α=4.5):形成并快速消散的小團(tuán)簇;湍流(紅色,α=7.5):混沌渦旋運動,桿頻繁碰撞;群集(黃色):集群合并形成更大的群集集體運動(α=11.6和α=15.1);大團(tuán)簇(紫色):形成大團(tuán)簇,核心內(nèi)移動受限(α=7.5、α=11.6和α=15.1);相分離(灰色):致密團(tuán)簇與稀薄區(qū)域共存(α=4.5);堵塞(棕色):桿的移動完全被抑制。

綜合實驗與模擬結(jié)果,該研究清晰地展示了形狀誘導(dǎo)排列、粒子濃度和水動力學(xué)相互作用如何共同主宰活性棒的自組織。研究不僅構(gòu)建了一幅涵蓋從各向同性運動到集群、活性湍流、群游、大團(tuán)簇和堵塞的完整相圖,還揭示了水動力學(xué)扭矩在動態(tài)重取向棒、產(chǎn)生局部渦量和旋轉(zhuǎn)應(yīng)力以驅(qū)動活性湍流中的關(guān)鍵作用。有趣的是,該研究為生物學(xué)中長期觀察到的現(xiàn)象——野生型大腸桿菌和枯草芽孢桿菌(長徑比約5.6-6.3)呈現(xiàn)湍流,而細(xì)長突變體(長徑比13-25)則不呈現(xiàn)湍流——提供了物理層面的解釋:天然游泳者可能演化出了優(yōu)化集體輸運和混合的最佳長徑比。這項研究為理解活性物質(zhì)中形狀依賴的集體動力學(xué)建立了框架,并將推動更真實的理論與模擬模型的發(fā)展,對可編程集群、自適應(yīng)輸運和仿生材料設(shè)計具有深遠(yuǎn)意義。

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