新春傳捷報(bào)！北京時(shí)間2026年2月19日，國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Nature同期發(fā)表了上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院，以及松江研究院、附屬新華醫(yī)院聯(lián)合其他單位的兩項(xiàng)重磅研究成果，分別在罕見(jiàn)病AI診斷、神經(jīng)發(fā)育疾病基因治療領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)世界性突破。

兩項(xiàng)成果同日登國(guó)際頂刊，是上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院和附屬醫(yī)院堅(jiān)持醫(yī)教研協(xié)同發(fā)展、深耕前沿交叉領(lǐng)域的重要成果，以科技創(chuàng)新賦能臨床診療、守護(hù)人民健康的生動(dòng)實(shí)踐，也是堅(jiān)持“四個(gè)面向”，強(qiáng)化“有組織的科研”，不斷提升科技創(chuàng)新能力的實(shí)力彰顯。

孫錕教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)布：全球首創(chuàng)可溯源AI系統(tǒng)，破解罕見(jiàn)病診斷世界性難題

由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院孫錕教授、余永國(guó)教授與上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院、醫(yī)學(xué)人工智能研究院張婭教授、上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院謝偉迪副教授領(lǐng)銜的聯(lián)合團(tuán)隊(duì)，以臨床問(wèn)題為導(dǎo)向、聯(lián)合研究為核心、技術(shù)落地為支撐，完成了從臨床需求到技術(shù)突破、再到臨床應(yīng)用的全鏈條創(chuàng)新，研發(fā)出全球首個(gè)可溯源智能體式罕見(jiàn)病診斷系統(tǒng)DeepRare，首創(chuàng)“中樞-分身”可溯源Agentic AI架構(gòu)，讓AI診斷從“黑盒”變?yōu)椤巴该髟\室”，徹底破解傳統(tǒng)醫(yī)療AI推理過(guò)程不可追溯的“信任危機(jī)”。

該架構(gòu)從三大維度實(shí)現(xiàn)對(duì)傳統(tǒng)醫(yī)療AI的代際超越：知識(shí)儲(chǔ)備上打破醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)孤島，深度整合并內(nèi)化海量醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)知識(shí)庫(kù)與真實(shí)臨床病例數(shù)據(jù)；診斷思維上跳出“模式匹配快思考”，擁有人類(lèi)醫(yī)生的“慢思考”能力，通過(guò)“假設(shè)-驗(yàn)證-自我反思”迭代循環(huán)推敲診斷線(xiàn)索；推理過(guò)程上實(shí)現(xiàn)全流程白盒推理，每一個(gè)結(jié)論均附帶完整證據(jù)鏈條。硬核實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)顯示，DeepRare診斷精度刷新世界紀(jì)錄，僅依靠臨床表型信息時(shí)，首位診斷準(zhǔn)確率達(dá)57.18%，較此前國(guó)際最佳模型提升23.79個(gè)百分點(diǎn)，為缺乏基因檢測(cè)條件的基層醫(yī)院打造了罕見(jiàn)病快速篩查的“金鑰匙”；引入基因測(cè)序數(shù)據(jù)后，復(fù)雜病例綜合首位診斷準(zhǔn)確率突破70.6%，顯著優(yōu)于國(guó)際通用的Exomiser工具，其推理報(bào)告更獲新華醫(yī)院專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)95.4%的高度認(rèn)可。

目前，DeepRare罕見(jiàn)病在線(xiàn)診斷平臺(tái)已上線(xiàn)半年，吸引超1000名專(zhuān)業(yè)用戶(hù)注冊(cè)，服務(wù)全球600余家頂尖醫(yī)療科研機(jī)構(gòu)；該系統(tǒng)已在新華醫(yī)院完成院內(nèi)部署并進(jìn)入內(nèi)測(cè)階段，即將作為“數(shù)字質(zhì)控員”應(yīng)用于全院罕見(jiàn)病診療質(zhì)控流程。孫錕教授透露，團(tuán)隊(duì)更正積極籌備發(fā)起“全球AI罕見(jiàn)病診療聯(lián)盟”，同步啟動(dòng)“萬(wàn)人臨床驗(yàn)證計(jì)劃”，計(jì)劃完成20000例疑難罕見(jiàn)病真實(shí)世界驗(yàn)證，讓中國(guó)AI診斷方案惠及全球患者。

值得一提的是，在Nature上線(xiàn)該論文的同期，期刊還特別邀請(qǐng)了澳大利亞西澳大學(xué)兒童健康研究中心專(zhuān)家Timo Lassmann撰寫(xiě)并配發(fā)了題為《AI成功診斷罕見(jiàn)病》（AI succeeds in diagnosing rare diseases）的“新聞與觀(guān)點(diǎn)”（News & views）專(zhuān)文評(píng)論 。文章對(duì)DeepRare給予了極高評(píng)價(jià)。Lassmann在文中指出，DeepRare這種多模塊協(xié)同的架構(gòu)，完美映射了罕見(jiàn)病專(zhuān)科中心多學(xué)科團(tuán)隊(duì)（MDT）的會(huì)診模式，但其“運(yùn)行的速度和規(guī)模卻是人類(lèi)團(tuán)隊(duì)無(wú)法企及的”。針對(duì)該系統(tǒng)的白盒化特征，文章給出了核心定調(diào)：“該系統(tǒng)可溯源的推理能力，可能是其走向未來(lái)臨床應(yīng)用最卓著的貢獻(xiàn)。”評(píng)論強(qiáng)調(diào)，在面臨重大醫(yī)療決策時(shí)，相比于給出“黑盒”答案，像DeepRare這樣“能夠展示其推演過(guò)程的系統(tǒng)，才能經(jīng)得起人類(lèi)專(zhuān)家的審查并贏得信任，最終證明其更具實(shí)用價(jià)值。”

上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院博士研究生趙唯珂、助理教授吳超逸博士、醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院副研究員范燕潔博士為論文的共同第一作者，人工智能學(xué)院張婭教授，謝偉迪副教授與醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院孫錕教授、余永國(guó)教授為論文的通訊作者。上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院博士研究生邱芃鋮、哈佛大學(xué)博士后張小嫚博士、上海交通大學(xué)本科生孫瑜澤、上海人工智能實(shí)驗(yàn)室博士后周曉博士、中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院張樹(shù)菊博士和彭聿博士、上海交通大學(xué)人工智能學(xué)院執(zhí)行院長(zhǎng)王延峰教授、醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院孫新教授對(duì)研究給予了指導(dǎo)、合作和支持。該項(xiàng)目得到了科技創(chuàng)新2030—“新一代人工智能”重大項(xiàng)目、上海市科學(xué)智能“百團(tuán)百項(xiàng)”專(zhuān)項(xiàng)、上海市科委人工智能科技支撐專(zhuān)項(xiàng)項(xiàng)目支持。

仇子龍教授、李斐教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)布：腦內(nèi)精準(zhǔn)基因編輯，為神經(jīng)發(fā)育疾病治療點(diǎn)亮曙光

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院松江研究院仇子龍教授，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院李斐教授、楊侃副研究員團(tuán)隊(duì)聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院程田林研究員團(tuán)隊(duì)和中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心李勁松院士團(tuán)隊(duì)，聚焦由CHD3基因突變導(dǎo)致的Snijders Blok–Campeau綜合征（SNIBCPS）這一典型神經(jīng)發(fā)育性疾病，實(shí)現(xiàn)了腦內(nèi)基因位點(diǎn)的精準(zhǔn)“修錯(cuò)”，為自閉癥等神經(jīng)發(fā)育疾病的基因治療帶來(lái)突破性進(jìn)展。

研究團(tuán)隊(duì)首先針對(duì)CHD3-R1025W熱點(diǎn)高頻突變，構(gòu)建了復(fù)刻患者核心癥狀的人源化突變小鼠模型，為治療研究搭建精準(zhǔn)的“疾病模擬平臺(tái)”；并創(chuàng)新性設(shè)計(jì)新型腺嘌呤堿基編輯器TeABE，這款“基因工匠”可精準(zhǔn)識(shí)別并將突變的A?T堿基對(duì)修復(fù)為正常的G?C堿基對(duì)，與傳統(tǒng)技術(shù)相比，全程無(wú)DNA雙鏈斷裂風(fēng)險(xiǎn)，大幅降低基因組紊亂風(fēng)險(xiǎn)。經(jīng)細(xì)胞水平多輪篩選，團(tuán)隊(duì)鎖定了編輯效率最高、脫靶效應(yīng)最低的sgRNA與編輯器組合，通過(guò)尾靜脈注射將其送入突變小鼠體內(nèi)后，編輯器成功抵達(dá)小鼠多個(gè)腦區(qū)實(shí)現(xiàn)靶向修復(fù)，且旁觀(guān)者效應(yīng)極低。隨著小鼠體內(nèi)CHD3蛋白水平顯著恢復(fù)，其社交回避、認(rèn)知遲鈍、運(yùn)動(dòng)不協(xié)調(diào)等行為異常得到顯著改善，在三箱社交、新物體識(shí)別、巴恩斯迷宮等實(shí)驗(yàn)中均恢復(fù)正常表現(xiàn)。

為筑牢臨床轉(zhuǎn)化的安全防線(xiàn)，團(tuán)隊(duì)通過(guò)GUIDE-seq技術(shù)全基因組排查脫靶位點(diǎn)，結(jié)果顯示人類(lèi)細(xì)胞中潛在脫靶位點(diǎn)編輯率均低于1%，小鼠腦中該數(shù)值更低；同時(shí)對(duì)次要突變開(kāi)展功能驗(yàn)證，確認(rèn)其不影響CHD3蛋白正常功能。更重要的是，團(tuán)隊(duì)在非人靈長(zhǎng)類(lèi)（獼猴）模型中開(kāi)展鞘內(nèi)注射AAV9-TeABE實(shí)驗(yàn)，成功檢測(cè)到明確的堿基編輯活性，驗(yàn)證了該技術(shù)的跨物種應(yīng)用可行性，為后續(xù)臨床試驗(yàn)積累了充足前期數(shù)據(jù)。

新華醫(yī)院團(tuán)隊(duì)深耕兒童神經(jīng)發(fā)育障礙領(lǐng)域二十余年，致力于其遺傳及環(huán)境病因的基礎(chǔ)到臨床轉(zhuǎn)化研究。李斐教授團(tuán)隊(duì)聚焦基因精準(zhǔn)編輯在《Nature》發(fā)表重磅成果的同時(shí)，還在環(huán)境病因研究方面有所突破，近期牽頭完成的“神經(jīng)發(fā)育障礙的生命早期環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)因素識(shí)別和防控體系建立與推廣”項(xiàng)目，在2025年中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)評(píng)選中獲醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)一等獎(jiǎng)。圍繞兒童神經(jīng)發(fā)育障礙領(lǐng)域的系列豐碩成果，將為該病的精準(zhǔn)治療開(kāi)辟新路徑。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院楊侃副研究員、復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院博士后李維克、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院松江研究院博士研究生耿一嘯、山東大學(xué)齊魯醫(yī)院小兒內(nèi)科博士后張淑倩、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越中心博士研究生程艷波、云南大學(xué)醫(yī)學(xué)院吳詩(shī)昊副研究員為論文的共同第一作者，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院楊侃副研究員、李斐教授、復(fù)旦大學(xué)腦科學(xué)轉(zhuǎn)化研究院程田林研究員、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院松江研究院仇子龍教授為論文的共同通訊作者。中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越中心李勁松院士團(tuán)隊(duì)與上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬松江醫(yī)院都愛(ài)蓮主任團(tuán)隊(duì)對(duì)研究給予了指導(dǎo)與大力支持。本研究得到了國(guó)家科技重大專(zhuān)項(xiàng)，國(guó)家自然科學(xué)基金、科技部科技創(chuàng)新2030-“腦科學(xué)與類(lèi)腦研究”重大項(xiàng)目、上海市科學(xué)技術(shù)委員會(huì)、上海市高水平地方高校創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)、上海市衛(wèi)生健康委員會(huì)、中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)、上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院“學(xué)科攀峰計(jì)劃”等資助。

近年來(lái)，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院堅(jiān)持“四個(gè)面向”，圍繞醫(yī)學(xué)重大熱點(diǎn)和難點(diǎn)問(wèn)題，強(qiáng)化“有組織的科研”，不斷提升科技創(chuàng)新能力、完善科研組織模式、建立成果轉(zhuǎn)化體系，構(gòu)建完善科研效能提升架構(gòu)，產(chǎn)生了大量具有影響力的科研成果，為醫(yī)學(xué)科技進(jìn)步注入了強(qiáng)勁動(dòng)能。

未來(lái)，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院和附屬醫(yī)院將錨定國(guó)家戰(zhàn)略新需求，深化創(chuàng)新評(píng)價(jià)“新激勵(lì)”，打造創(chuàng)新策源“強(qiáng)引擎”，勇闖科研創(chuàng)新“無(wú)人區(qū)”，系統(tǒng)推進(jìn)科技創(chuàng)新和成果轉(zhuǎn)化的高質(zhì)量發(fā)展，為建設(shè)中國(guó)特色世界一流醫(yī)學(xué)院和一流醫(yī)學(xué)學(xué)科、服務(wù)國(guó)家高水平科技自立自強(qiáng)貢獻(xiàn)源源不斷的“交醫(yī)”力量。

編輯：陳露

資料：上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院

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