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Sci Adv新發(fā)現(xiàn):大腦里有個“基因建筑師”,它的工作你意想不到

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我們的大腦發(fā)育竟然用上了“馴化”的跳躍基因!PGBD5 是一個源自遠(yuǎn)古轉(zhuǎn)座子的基因,在人和小鼠大腦中高度活躍,尤其在關(guān)鍵神經(jīng)元里。研究發(fā)現(xiàn),它并非搗亂分子,而是在發(fā)育過程中精準(zhǔn)切割DNA,幫助神經(jīng)元正常成熟。一旦 PGBD5 出現(xiàn)突變,就會導(dǎo)致智力障礙、癲癇、運(yùn)動失調(diào)等神經(jīng)發(fā)育疾??;小鼠缺失該基因也會出現(xiàn)腦變小、行為異常和癲癇。

基于此,2026年1月14日,紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心Alex Kentsis研究團(tuán)隊(duì)在Science Advances雜志發(fā)表了“A transposasederived gene required for human brain development”揭示了一種源自轉(zhuǎn)座酶、對人類大腦發(fā)育所必需的基因。


DNA轉(zhuǎn)座元件通常被認(rèn)為只與基因組不穩(wěn)定有關(guān),但本研究發(fā)現(xiàn),源自轉(zhuǎn)座酶的基因 PGBD5 在大腦發(fā)育中扮演關(guān)鍵角色。它在小鼠和人類中高度保守,對正常神經(jīng)發(fā)育不可或缺:缺失 PGBD5 會導(dǎo)致智力障礙、運(yùn)動異常和癲癇。在小鼠大腦皮層中,Pgbd5 能誘導(dǎo)終末分化神經(jīng)元發(fā)生特定的 DNA 斷裂和體細(xì)胞基因組重排;若缺失,則谷氨酸能神經(jīng)元的基因表達(dá)紊亂,進(jìn)而引發(fā)神經(jīng)功能異常。簡言之,PGBD5 是一個“馴化”的轉(zhuǎn)座酶基因,已進(jìn)化為哺乳動物大腦發(fā)育所必需的調(diào)控因子。


圖一 PGBD5:源自轉(zhuǎn)座酶的神經(jīng)發(fā)育關(guān)鍵基因

作者首先發(fā)現(xiàn),PGBD5 在人和小鼠大腦中高表達(dá),尤其富集于谷氨酸能神經(jīng)元。為探究其功能,通過 GeneMatcher 找到 5個近親婚配家系、共10名患者均攜帶純合的 PGBD5 無義或移碼突變,多位于關(guān)鍵的保守結(jié)構(gòu)域。這些突變導(dǎo)致 PGBD5 蛋白顯著減少且與疾病共分離。

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患者臨床表現(xiàn)高度一致:

神經(jīng)發(fā)育障礙:100% 有智力障礙、發(fā)育遲緩、嚴(yán)重語言缺陷; 癲癇(9/9)、自閉癥或社交遲緩(4/6);運(yùn)動異常:普遍肌張力低下(軀干)伴外周肌張力異常、痙攣、共濟(jì)失調(diào)(7/10)、間歇性肌張力障礙(3/10);腦部MRI異常:胼胝體變?。?/7)、小腦蚓部發(fā)育不良(7/7),隨年齡增長更明顯;部分有輕度面部特征(如眼距寬、耳垂厚)和身材矮小,但頭圍正常。

為驗(yàn)證功能,作者構(gòu)建了 Pgbd5 敲除小鼠(Pgbd5?/?)。盡管完全缺失第4外顯子,仍殘留少量截短轉(zhuǎn)錄本。另通過敲入報(bào)告小鼠證實(shí):Pgbd5 僅在神經(jīng)元表達(dá),不在膠質(zhì)細(xì)胞中。

綜上,PGBD5 是神經(jīng)元特異性表達(dá)的關(guān)鍵基因,其缺失導(dǎo)致以智力障礙、癲癇、共濟(jì)失調(diào)肌張力障礙為核心的神經(jīng)發(fā)育綜合征,揭示了源自轉(zhuǎn)座酶的基因在哺乳動物大腦發(fā)育中的必要作用。


圖二 Pgbd5缺失導(dǎo)致神經(jīng)發(fā)育障礙與癲癇易感

作者發(fā)現(xiàn),Pgbd5?/?小鼠能夠按預(yù)期孟德爾比例出生,但體型發(fā)育遲緩,大腦明顯小于野生型同窩小鼠。為模擬人類PGBD5缺乏癥的表現(xiàn),他們對小鼠進(jìn)行了系列行為測試:

活動性增強(qiáng):Pgbd5?/?和雜合子(Pgbd5?/?)小鼠在開放環(huán)境中自發(fā)活動顯著增多;

焦慮樣行為減弱:在高架十字迷宮中,Pgbd5?/?小鼠進(jìn)入開放臂的次數(shù)更多、停留時間更長,表明對高風(fēng)險(xiǎn)區(qū)域的回避減少,而雜合子小鼠表現(xiàn)居中,提示劑量依賴效應(yīng);

運(yùn)動協(xié)調(diào)受損:雄性Pgbd5?/?小鼠在轉(zhuǎn)棒實(shí)驗(yàn)中掉落更快,但抓握力正常;

感覺異常:所有Pgbd5?/?小鼠均出現(xiàn)熱痛覺過敏,但步態(tài)無明顯異常;

癲癇易感:多數(shù)Pgbd5?/?小鼠在接受輕微應(yīng)激操作時出現(xiàn)局灶性運(yùn)動發(fā)作甚至全身性強(qiáng)直陣攣性癲癇,而野生型小鼠從未發(fā)作。

進(jìn)一步通過錳增強(qiáng)MRI分析腦結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)Pgbd5?/?小鼠的大腦皮層體積顯著縮小。綜上,Pgbd5缺失導(dǎo)致包括癲癇、運(yùn)動與行為異常及腦結(jié)構(gòu)改變在內(nèi)的復(fù)雜神經(jīng)表型。


圖三 Pgbd5驅(qū)動發(fā)育期神經(jīng)元DNA斷裂

哺乳動物的大腦皮層主要在胚胎中晚期形成,小鼠在胚胎第14.5天(E14.5)時神經(jīng)發(fā)生達(dá)到高峰。此時,新生的終末分化神經(jīng)元從腦室區(qū)遷移到皮層地幔層的過程中,會自然產(chǎn)生大量DNA斷裂,并通過修復(fù)機(jī)制處理,這一過程以γH2AX為標(biāo)志。

作者發(fā)現(xiàn),在Pgbd5?/? 胚胎中,Tuj1陽性(即已分化的)神經(jīng)元內(nèi)的γH2AX焦點(diǎn)顯著減少,說明DNA斷裂明顯降低;但在未分化的神經(jīng)前體細(xì)胞(Tuj1陰性)中則無此差異。這表明Pgbd5的作用特異性發(fā)生在神經(jīng)元分化階段。

該效應(yīng)具有時間特異性:在更早期的E12.5(皮層僅單層結(jié)構(gòu))未觀察到差異;且在攜帶轉(zhuǎn)座酶結(jié)構(gòu)域突變的Pgbd5敲入小鼠(Pgbd5ki/ki)中,γH2AX也顯著減少,說明其功能依賴于完整的轉(zhuǎn)座酶同源結(jié)構(gòu)域。

綜上,Pgbd5通過其轉(zhuǎn)座酶活性,在特定發(fā)育窗口期特異性驅(qū)動神經(jīng)元中的程序性DNA斷裂或修復(fù),是皮層正常發(fā)育所必需的。


圖四 Pgbd5介導(dǎo)可重復(fù)的體細(xì)胞基因組重排

作者通過高深度(90×)無PCR擴(kuò)增的全基因組測序,分析了21日齡小鼠外周血單個核細(xì)胞(PBMCs),驗(yàn)證其體細(xì)胞變異檢測方法的可靠性:在野生型小鼠中,免疫球蛋白基因(如Igkj1/2)存在RAG1/2介導(dǎo)的典型體細(xì)胞缺失,而腦組織中沒有;胎脾(E14.5)則無此類重排,符合RAG活性尚未啟動的發(fā)育規(guī)律。

值得注意的是,Pgbd5?/?小鼠的PBMCs和胎脾中特異性出現(xiàn)第4號外顯子的克隆性缺失,提示該方法可有效捕捉Pgbd5相關(guān)的結(jié)構(gòu)變異。隨后,作者將此策略應(yīng)用于比較Pgbd5?/?與Pgbd5?/?小鼠的腦組織(成年30日齡和胚胎E14.5),發(fā)現(xiàn)兩者的體細(xì)胞點(diǎn)突變數(shù)量和分布無差異,且無重復(fù)性;總體結(jié)構(gòu)變異總數(shù)也無顯著差別。但關(guān)鍵區(qū)別在于:成年野生型小鼠在不同個體及腦區(qū)(如海馬、小腦、嗅球),而Pgbd5?/?小鼠中這類重復(fù)性重排顯著減少;這一現(xiàn)象在胚胎期尚未出現(xiàn),與Pgbd5功能在發(fā)育后期才激活的時間窗口一致。

綜上,Pgbd5并非導(dǎo)致隨機(jī)基因組不穩(wěn)定,而是指導(dǎo)特定、可重復(fù)的體細(xì)胞DNA重排,這些事件很可能是其在正常大腦發(fā)育中發(fā)揮生理功能的重要機(jī)制。

總結(jié)

PGBD5介導(dǎo)的神經(jīng)元DNA重排揭示了一種進(jìn)化保守的機(jī)制:馴化的轉(zhuǎn)座酶可在發(fā)育中程序性重塑體細(xì)胞基因組,為生理多樣性提供基礎(chǔ),但其失調(diào)亦可能驅(qū)動疾病如RAG1/2引發(fā)白血病,PGBD5異?;?qū)е律窠?jīng)發(fā)育障礙中的致病性體細(xì)胞突變。

文章來源

10.1126/sciadv.adv7530

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