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Nat Cell Biol?|?DOT1L通過拮抗PRC1.1守護白血病基因記憶

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撰文丨

DOT1L和Menin是致癌MLL融合蛋白(MLL-FP)發(fā)揮功能的關鍵輔助因子,其抑制劑在臨床前和臨床試驗中展現(xiàn)出治療潛力,尤其是Menin抑制劑已取得重要進展。然而,這兩種抑制劑(特別是DOT1L抑制劑)在細胞和臨床中表現(xiàn)出不同的反應動力學和療效,暗示其作用機制存在未被充分認知的差異。一個關鍵的謎團是,DOT1L抑制劑引發(fā)的基因表達下調存在顯著延遲,而DOT1L催化產生的組蛋白H3第79位賴氨酸甲基化(H3K79me)作為一種缺乏已知主動去甲基化酶的穩(wěn)定修飾,提示其功能可能超越了傳統(tǒng)的促進轉錄延伸。同時,MLL復合物與Polycomb抑制復合物在發(fā)育基因調控中存在經典的拮抗關系,但這一關系在MLL-FP白血病背景下如何被重塑,以及DOT1L在此軸心中扮演何種角色,尚不清楚。

近日,澳大利亞莫納什大學Omer GilanChen DavidovichNature Cell Biology期刊發(fā)表題為DOT1L provides transcriptional memory through PRC1.1 antagonism的研究論文,揭示了DOT1L通過其催化的穩(wěn)定組蛋白修飾H3K79me,在物理層面直接拮抗PRC1.1復合物的活性,從而為活躍轉錄基因提供保護性記憶;在MLL重排白血病中,這一機制被癌蛋白劫持以維持致癌表達,而抑制DOT1L則會解除其對PRC1.1的阻斷,引發(fā)不可逆的Polycomb介導的基因沉默


首先,研究 團隊 在人類和小鼠的MLL白血病細胞系中,利用針對DOT1L和Menin的抑制劑進行全基因組及表觀遺傳學聚焦的CRISPR-Cas9功能缺失篩選,以系統(tǒng)性鑒定對這兩種抑制劑敏感所必需的基因。功能基因組學篩選與驗證一致表明,PRC1.1復合物的核心組分(BCOR、PCGF1等)是DOT1L抑制劑和Menin抑制劑發(fā)揮抗白血病作用所必需的。在PRC1.1缺失的細胞中,抑制劑誘導的關鍵致癌基因(如Meis1)表達下調被顯著削弱,細胞分化程序被阻滯,并且在小鼠體內模型中,Menin抑制劑的治療效益完全喪失,這確立了PRC1.1是兩種抑制劑下游的共同且關鍵的效應執(zhí)行者。深入的分子機制剖析顯示,Menin抑制會誘導PRC1.1在部分MLL-FP靶基因上特異性沉積抑制性標記H2AK119ub,而DOT1L抑制則引起全基因組范圍內H2AK119ub的廣泛升高。然而,這種PRC1.1的激活并非源于MLL-FP從染色質上解離的直接空間位阻效應,也非轉錄活性降低的次級后果。通過整合多組學數(shù)據的精細分析,發(fā)現(xiàn)H2AK119ub的誘導強度與H3K79me2的基線水平及其丟失程度呈現(xiàn)極強的負相關性,而與MLL-FP結合或轉錄變化的關聯(lián)性很弱。這表明,DOT1L催化產生的H3K79甲基化本身就像一種 “ 分子盾牌 ” ,物理性地阻礙了PRC1.1的催化功能。

這一發(fā)現(xiàn)解釋了兩種抑制劑作用動力學的關鍵差異:Menin抑制劑能迅速驅逐MLL-FP,但由于H3K79me2的緩慢被動稀釋(因其缺乏主動去甲基酶),PRC1.1的激活和后續(xù)的基因沉默被延遲;而DOT1L抑制劑通過直接、快速地去除H3K79me2,立即解除了對PRC1.1的抑制,從而引發(fā)更廣泛、更快速的H2AK119ub沉積。研究進一步描繪了一個動態(tài)的級聯(lián)反應時序:在Menin抑制后,H3K79me2水平隨著細胞分裂逐漸下降,隨后出現(xiàn)H2AK119ub的積累,最終在某些位點引發(fā)PRC2介導的穩(wěn)定抑制性標記H3K27me3的沉積。這種時序性轉換具有重大的功能后果 ——“ 撤藥 ” 實驗證明,在H3K27me3沉積建立之前,Menin抑制引起的基因沉默是可逆的;而一旦通過PRC1.1/PRC2軸建立了H3K27me3標記,即使撤除藥物,基因沉默也變?yōu)槌志煤筒豢赡娴?,這為 “ 表觀遺傳記憶 ” 的建立提供了清晰的分子路徑。

此外,這種DOT1L-PRC1.1拮抗機制具有顯著的普適性,在多種非白血病細胞類型(包括K562細胞、人造血祖細胞和小鼠胚胎干細胞)中均得到證實,表明DOT1L通過維持H3K79me來保護基因免受過早的Polycomb沉默,是一種保守的轉錄活性記憶機制。最后,在最基本的生化層面驗證 了 假設,重組的人源PRC1.1和PRC1.4復合物對含有H3K79me2或me3修飾的核小體的泛素化效率顯著降低,其中H3K79me3的抑制作用更強。這從最基礎的分子互作層面證實,H3K79甲基化可直接抑制PRC1的催化活性。

綜上所述,DOT1L并非僅僅是一個轉錄延伸輔助因子,它通過其產生的穩(wěn)定組蛋白修飾H3K79me,構成了平衡MLL(激活)與Polycomb(抑制)這一關鍵發(fā)育軸心的核心拮抗力量。在MLL-FP白血病中,癌蛋白劫持了DOT1L,利用其 “ 防護 ” 功能來阻止Polycomb復合物對致癌基因的沉默,從而維持白血病狀態(tài)。不僅闡明了靶向DOT1L和Menin的治療機制差異,也為理解表觀遺傳記憶和基因沉默的可逆性轉換提供了全新范式。

https://doi.org/10.1038/s41556-025-01859-8

制版人: 十一

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