1987年，十三大召開后，軍委主要領(lǐng)導(dǎo)班子成員進(jìn)行重大調(diào)整，像副秘書長(zhǎng)兼總長(zhǎng)楊得志、副秘書長(zhǎng)兼總政主任余秋里、副秘書長(zhǎng)兼國(guó)防部長(zhǎng)張愛萍退居二線，副秘書長(zhǎng)兼總后勤部長(zhǎng)洪學(xué)智繼續(xù)在一線，但不再擔(dān)任總后部長(zhǎng)。

此時(shí)，上級(jí)任命遲浩田為總長(zhǎng)，楊白冰為總政主任，秦基偉為國(guó)防部長(zhǎng)，趙南起為總后部長(zhǎng)。

1988年1月，上級(jí)又增補(bǔ)劉華清為軍委副秘書長(zhǎng)。從當(dāng)時(shí)新一屆領(lǐng)導(dǎo)班子可以看出與上一屆有何不同。上一屆三總部負(fù)責(zé)人和國(guó)防部長(zhǎng)都是軍委副秘書長(zhǎng)，參與軍委日常工作?，F(xiàn)在專設(shè)兩位副秘書長(zhǎng)，三總部負(fù)責(zé)人和國(guó)防部長(zhǎng)不再兼任。

到1988年，上級(jí)為17位將軍授予上將軍銜，其中10位是被二次授予將星，分別是洪學(xué)智、劉華清、秦基偉、張震、李德生、李耀文、向守志、王誠(chéng)漢、尤太忠、郭林祥。1990年，洪學(xué)智、李德生、李耀文、向守志、王誠(chéng)漢、尤太忠、郭林祥7位將領(lǐng)從領(lǐng)導(dǎo)位置上退下來(lái)轉(zhuǎn)入二線。只剩下劉華清、張震、秦基偉。

他們?nèi)粸楹螞]有退下來(lái)呢？

劉華清是軍委副主席，而八十年代到九十年代軍隊(duì)現(xiàn)代化建設(shè)最急切的是武器裝備，而他在解放后長(zhǎng)期負(fù)責(zé)海軍、以及全軍武器裝備研制領(lǐng)導(dǎo)工作，對(duì)武器裝備非常了解，把他放在主要位置上的作用不言而喻，有資歷，有經(jīng)驗(yàn)，更能協(xié)助正職處理好軍隊(duì)現(xiàn)代化工作。

張震是多次想要退下來(lái)，在1985年想退下來(lái)過(guò)，但被任命國(guó)防大學(xué)校長(zhǎng)；在1990年，軍隊(duì)精簡(jiǎn)改革時(shí)也希望退下來(lái)，比他小一歲的李德生政委都退了，自己也77歲了。但上級(jí)不僅沒有同意，還讓他兼任政委工作。到1992年，提拔為軍委副職，協(xié)助正職處理軍隊(duì)事務(wù)。

秦基偉為何沒有退下來(lái)呢？

他擔(dān)任國(guó)防部長(zhǎng)，在他之前國(guó)防部長(zhǎng)都是老帥擔(dān)任，彭總、林總、葉帥、徐帥等都擔(dān)任過(guò)，解放后到八十年代初期，國(guó)防部做為“軍委對(duì)外的名稱”的職責(zé)，在外人看來(lái)是軍事最高機(jī)構(gòu)，到1982年以后，僅僅是國(guó)務(wù)院系統(tǒng)的軍事工作機(jī)關(guān)。

國(guó)防部長(zhǎng)一職是由提名選舉產(chǎn)生，個(gè)人去留也是要通過(guò)代表大會(huì)通過(guò)才行，如果沒有問(wèn)題一般會(huì)干滿一屆，而一屆為5年。

到1990年時(shí)，秦基偉才履職第三個(gè)年頭。直到1993年召開十四大時(shí)，他才被免去防長(zhǎng)職務(wù)，改為人大副委員長(zhǎng)。