故事來到了潛伏者在保衛(wèi)者的武器研究所奪取了神秘的超級戰(zhàn)士血清和綠巨人遺體后，他們將其運(yùn)往了自己一個(gè)位于地下的生化實(shí)驗(yàn)室，在這個(gè)地區(qū)，潛伏者開展了對強(qiáng)化血清的研發(fā)，目的是更好強(qiáng)化人體，隨著一段時(shí)間的研究后，他們終于開發(fā)出來了初代版本的強(qiáng)化血清，準(zhǔn)備尋求一部分人來進(jìn)行人體試驗(yàn)。

很快，一群傭兵就被示意來到進(jìn)行強(qiáng)化血清的實(shí)驗(yàn)，他們開始被注射了強(qiáng)化血清，原本，在研究員看來，這些被注射了強(qiáng)化血清的人勢必會(huì)得到身體上的強(qiáng)化，可試驗(yàn)卻大大出乎了他們的預(yù)料，因?yàn)樗麄儼l(fā)現(xiàn)了一個(gè)非?？膳碌氖虑?，就是這些注射了強(qiáng)化血清的傭兵們開始變得異常暴躁，并且他們完全不受任何控制。

而且更要命的地方是這些人開始肆無忌憚攻擊其他人，但凡被他們抓傷的人，也很快會(huì)被感染成新的感染體，此時(shí)，研究員們很快便呼叫了救援，企圖鎮(zhèn)壓這些不受控制的感染體，但要命的事情出現(xiàn)了，就是參與鎮(zhèn)壓的士兵們發(fā)現(xiàn)，他們非但救不了其他人，甚至很多士兵還反過來被他們感染成了同類，瞬間整個(gè)實(shí)驗(yàn)室就被生化幽靈占領(lǐng)了。

故事來到了生化幽靈危機(jī)爆發(fā)的一年多以后，生化幽靈早已遍布了整個(gè)世界各地，各地都爆發(fā)了生化危機(jī)，保衛(wèi)者和潛伏者早已正式聯(lián)起手共同應(yīng)對這場生化危機(jī)，可是，也因?yàn)樯撵`的巨大的戰(zhàn)爭價(jià)值，讓不少人動(dòng)起了歪心思，他們抓捕了一些生化幽靈，并且對這些生化幽靈進(jìn)行了改造，企圖將其打造成能夠控制的軍事武器。

經(jīng)過他們的科研人員的研發(fā)改造后，新一代的生化幽靈出現(xiàn)了，當(dāng)然，為了測試這種生化幽靈的戰(zhàn)斗力，于是，他們將其投放到了聯(lián)合作戰(zhàn)部隊(duì)作戰(zhàn)的前線陣地上面，事情也跟他們預(yù)想的一樣，即便配備了重型火力的聯(lián)合部隊(duì)，被這種新型生化幽靈打得找不到北，這群人躲在背后也獲得了非常不錯(cuò)的一手?jǐn)?shù)據(jù)。

自從二代生化幽靈出現(xiàn)在戰(zhàn)場過后好幾年，此時(shí)，人們已經(jīng)開始習(xí)慣了生化幽靈的情況，也琢磨出來了應(yīng)對的辦法和策略，可就在這個(gè)時(shí)候，一個(gè)新的神秘組織Blitz再次開始開發(fā)新一代的生化幽靈，他們在一個(gè)神秘的東方國度開展了此次項(xiàng)目的研發(fā)，他們將一種神秘的僵尸基因血液注入到生化幽靈里面，使得這些生化幽靈獲得更加強(qiáng)大的感染能力。