1945年抗戰(zhàn)結束后，上級讓新四軍5師、王樹聲所部以及王震南下支隊組建中原軍區(qū)，李先念擔任司令，鄭位三擔任政委，王樹聲為副司令兼第一縱隊司令，王震為第二副司令兼參謀長。

中原軍區(qū)戰(zhàn)略位置極為重要，使得敵人調集重兵圍剿，1946年6月中原突圍展開，主力分兩路突圍，王樹聲率領一部向鄂西北，李先念率領一部向鄂豫陜。

突圍后的部隊并不輕松，面對惡劣的自然條件，以及國軍采取連坐，加上敵人重兵圍追堵截，部隊每天輾轉，一天大小戰(zhàn)斗太多，部隊沒有喘息的機會，因為沒有根據的，后勤補給困難，更別說發(fā)展部隊。

1947年，上級考慮鄂西北軍區(qū)與鄂豫陜軍區(qū)的困難，以及主要領導身體狀況差，將他們調回后方，李先念、任質斌、鄭位三等都回延安休養(yǎng)工作。鄂西北的王樹聲幾經輾轉到上海走海運到膠東，回到晉冀魯豫根據地休養(yǎng)。

身體不好的他，在短暫休養(yǎng)后，得知劉鄧首長挺進大別山，需要干部就要求去前線。

大別山是他的故鄉(xiāng)，也是過去四方面軍戰(zhàn)斗過的地方，這里的環(huán)境和民情都熟悉。大軍南下大別山要站穩(wěn)腳跟，必須建立根據地。根據地建設也需要部隊，就從1縱、2縱、6縱調，組建鄂豫軍區(qū)，任命王樹聲為司令?？紤]到他身體不好，特意將空降到晉冀魯豫野戰(zhàn)軍當副參謀長的郭天民調去當副手。

郭天民能打仗，在晉察冀軍區(qū)擔任縱隊司令，是主將之一。因張家口保衛(wèi)戰(zhàn)對上級有情緒而離開，南下到劉鄧麾下。

可以說鄂豫軍區(qū)的戰(zhàn)斗力并不弱，完全可以匹敵一支野戰(zhàn)縱隊。因為兵力都是從縱隊抽到的，指揮員也都是經驗豐富的戰(zhàn)將?？梢源虼笞鲬?zhàn)，可首要任務是消滅敵地方武裝，建立根據地，得到老百姓的擁護，后勤補給以及兵員可以得到保障，有利于持久作戰(zhàn)，這一點王樹聲深有體會。

隨著陳謝集團與陳粟大軍策應劉鄧大軍，部隊在大別山站穩(wěn)腳跟，1948年重建中原軍區(qū)，原晉冀魯豫野戰(zhàn)軍改為中原野戰(zhàn)軍。

軍區(qū)重建后，下轄7個二級軍區(qū)，分別是桐柏軍區(qū)、鄂豫軍區(qū)、江漢軍區(qū)、豫皖蘇軍區(qū)、陜南軍區(qū)、豫西軍區(qū)、皖西軍區(qū)。劉、鄧首長作為軍區(qū)兼野戰(zhàn)軍司令、政委，陳毅、李先念擔任軍區(qū)副司令，鄧子恢擔任副政委。

我們知道，李先念過去曾擔任過中原軍區(qū)司令，如今軍區(qū)重建擔任副司令?？赏鯓渎暡]有被提拔到大軍區(qū)位置上，繼續(xù)擔任二級軍區(qū)司令。

重建后的中原軍區(qū)，從兵力，從轄區(qū)來說都遠超1945年。軍區(qū)下轄7個野戰(zhàn)軍，7個二級軍區(qū)，而且二級軍區(qū)都能組建成一支野戰(zhàn)縱隊，如桐柏軍區(qū)部隊就是10縱發(fā)展而來，陜南軍區(qū)由12旅與38軍55師組建而來，皖西軍區(qū)是三縱部隊抽調組建等。江漢軍區(qū)部隊是過去中原軍區(qū)地方部隊與后來南下部隊合編而來。

王樹聲如果調任大戰(zhàn)區(qū)工作，就不能具體負責工作，作為老將的他更希望到一線工作，干具體工作。對于離開鄂西北，沒完成上級交代的任務，內心是不是有些許自責。如今希望多做一些實際工作，彌補心中的遺憾。對他來說，甘愿當綠葉。

1949年，部隊組建野戰(zhàn)軍，他依舊留在后方擔負后勤保障工作。直到河南軍區(qū)、湖北軍區(qū)成立，撤銷鄂豫軍區(qū)、江漢軍區(qū)、桐柏軍區(qū)，他被調任湖北軍區(qū)第二副司令。