1962年1月18日（昭和37年）

日本陸上自衛(wèi)隊(duì)改組為師級單位制后，第十三師團(tuán)成立，兵力7000人，轄區(qū)包括山口縣、廣島縣、岡山縣、島根縣和鳥取縣、香川縣、愛媛縣、德島縣和高知縣以及兵庫縣的淡路島。

第13特科聯(lián)隊(duì)在姬路要塞組建。第13坦克大隊(duì)在今津駐屯地組建。第8普通科聯(lián)隊(duì)從海準(zhǔn)屯地調(diào)往米子駐屯地。

編制：師部、附屬部隊(duì)、第8、15和17普通科聯(lián)隊(duì)、特科聯(lián)隊(duì)、坦克大隊(duì)、設(shè)施大隊(duì)、通信大隊(duì)、偵察隊(duì)、對坦克隊(duì)、武器隊(duì)、補(bǔ)給隊(duì)、運(yùn)輸隊(duì)、醫(yī)療隊(duì)

1965年（昭和40年）

3月31日：日本原駐屯地成立。第13特科聯(lián)隊(duì)第2大隊(duì)從姬路駐軍調(diào)往日本原駐屯地。

6月30日：第13坦克營從今津駐屯地調(diào)往日本原駐屯地。

1970年3月10日（昭和45年）

改為甲級師：人員編制9000人。下轄四個(gè)普通科聯(lián)隊(duì)。

第46步兵團(tuán)在善通寺駐屯地新組建，后遷至開大市駐屯地。第 13 特科聯(lián)隊(duì)新組建第 4 大隊(duì)、第 5大隊(duì)第 12 中隊(duì)和第 6大隊(duì)第 5 射擊隊(duì)。

1971年3月25日（昭和46年）

第13特科聯(lián)隊(duì)主力（除第1大隊(duì)和第2大隊(duì)外）遷至日本原駐屯地。

1975年8月1日（昭和50年）：在海田市駐屯地新成立了第13樂隊(duì)。

1981 年3 月 25 日（昭和 56 年）

重組為乙級師：人員編制 7,100 人。第15普通科聯(lián)隊(duì)并入第2聯(lián)合旅。第13坦克大隊(duì)第4坦克中隊(duì)被重組為第2聯(lián)合旅坦克部隊(duì)。以第 13 特科聯(lián)隊(duì)第 4 大隊(duì)和第 5 大隊(duì)第 12 中隊(duì)為基礎(chǔ)，第 6 大隊(duì)新組建一個(gè)防空中隊(duì)合并成立第 2 聯(lián)合旅特科大隊(duì)。

1991年3月29日（平成）：

現(xiàn)代化和重組。

第8、17和46普通科聯(lián)隊(duì)被重組為摩托化步兵普通科聯(lián)隊(duì)。第13軍械隊(duì)、第13補(bǔ)給隊(duì)、第13運(yùn)輸隊(duì)和第13醫(yī)療隊(duì)合并組成第13后方支援聯(lián)隊(duì)。第13特科聯(lián)隊(duì)第6大隊(duì)改編為第13高射特科大隊(duì)，直屬師團(tuán)指揮。第13師團(tuán)司令部新組建了一個(gè)化學(xué)防護(hù)小隊(duì)。第13偵察隊(duì)新組建了一個(gè)電子偵察小隊(duì)。

1999 年3 月 28 日（平成 11 年）

第十三師團(tuán)裁撤

1999 年3 月 29 日（平成 11 年）

第 13旅團(tuán)成立。該旅的成員人數(shù)將從 7,100 人減少到 4,100 人。

組建第47普通科聯(lián)隊(duì)，第13坦克大隊(duì)（30輛74式坦克）重組為第13坦克中隊(duì)（16輛74式坦克）。第13特科聯(lián)隊(duì)（約1200人）重組為第13特科隊(duì)（約400-500人）。第13高射特科大隊(duì)重組為第13高射特科中隊(duì)。

2008 年3 月 26 日（平成 20 年）

改組為快速反應(yīng)現(xiàn)代化旅。

第47普通科聯(lián)隊(duì)調(diào)入中部方面隊(duì)聯(lián)合旅。第13坦克中隊(duì)第4坦克小隊(duì)解散。第13對坦克中隊(duì)撤銷。

2013 年3 月 26 日

隸屬于第 13 旅司令部的化學(xué)防護(hù)小隊(duì)脫離第 13 旅司令部，并重組為第 13 化學(xué)防護(hù)隊(duì)。

2014年3月26日（平成26年）

旅級部隊(duì)重組。

第13設(shè)施中隊(duì)被重組為第13設(shè)施隊(duì)。第13通信中隊(duì)重組為第13通信隊(duì)。

第 13 化學(xué)防護(hù)隊(duì)重組為第 13 特殊武器防護(hù)隊(duì)

2024年3月21日（令和

第13偵察隊(duì)和第13坦克中隊(duì)被撤銷并合并，在出云駐地新成立了第13偵察戰(zhàn)斗大隊(duì)。第13特科隊(duì)被撤銷，并重組為中隊(duì)方面隊(duì)特科聯(lián)隊(duì)第3大隊(duì)。

2026年3月23日（令和

第13高射特科中隊(duì)改組為第13概設(shè)特科隊(duì)。