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Nat Commun丨蔣衛(wèi)團隊揭示TGFβ驅(qū)動的代謝重編程調(diào)控人類內(nèi)胚層分化機制

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細胞命運決定是 細胞生物學(xué)與 胚胎發(fā)育研究領(lǐng)域的核心科學(xué)問題之一。近年來,越來越多的研究表明,多能干細胞在分化過程中不僅伴隨基因表達程序的系統(tǒng)性重塑,還發(fā)生顯著的代謝狀態(tài)轉(zhuǎn)變。然而,代謝重編程如何在分子層面參與細胞命運調(diào)控,以及其與經(jīng)典信號通路和表觀遺傳機制之間的耦聯(lián)關(guān)系,仍有待深入闡明。特別是在內(nèi)胚層分化過程中,盡管已有證據(jù)提示 存在 細胞代謝由糖酵解向線粒體氧化 磷酸化 代謝轉(zhuǎn)變,但其上游調(diào)控機制及下游功能效應(yīng)仍不明確。

針對上述問題, 武漢大學(xué) 中南醫(yī)院 醫(yī)學(xué)研究院、免疫與代謝前沿科學(xué)中心蔣衛(wèi)教授團隊 近期 在 Nature Communications 發(fā)表題為 TGFβ-activated PDHB promotes mitochondrial pyruvate metabolism and contributes to human endoderm differentiation via ATP-dependent BRG1 的研究論文。該研究以人多能干細胞分化體系為模型,解析了葡萄糖代謝重編程在內(nèi)胚層分化過程中的調(diào)控機制,揭示了TGFβ信號通過調(diào)控丙酮酸線粒體代謝,進而影響ATP生成與染色質(zhì)重塑,從而驅(qū)動細胞命運轉(zhuǎn)換的分子機制。


研究發(fā)現(xiàn),葡萄糖代謝在內(nèi)胚層分化過程中具有關(guān)鍵作用。提高葡萄糖濃度可顯著促進內(nèi)胚層標(biāo)志物表達,而抑制 葡萄糖代謝 則明顯阻礙分化進程。進一步分析表明,丙酮酸作為糖代謝的重要中間產(chǎn)物,其進入線粒體并參與三羧酸循環(huán)是促進分化的關(guān)鍵步驟。促進丙酮酸氧化代謝可增強分化效率,而阻斷其線粒體轉(zhuǎn)運則導(dǎo)致細胞維持在以乳酸生成為特征的糖酵解狀態(tài),從而抑制分化。轉(zhuǎn)錄組結(jié)果顯示,在分化過程中 乳酸生成 相關(guān)基因整體下調(diào),而 三羧酸循環(huán) 及氧化磷酸化相關(guān)基因顯著上調(diào),表明細胞代謝模式 轉(zhuǎn) 向線粒體氧化代謝。

在機制層面,研究進一步揭示 TGFβ 信號在該代謝重編程中的關(guān)鍵作用。結(jié)果顯示, TGFβ 下游轉(zhuǎn)錄因子 SMAD2/3 可直接結(jié)合 PDHB 基因啟動子區(qū)域并促進其表達。 PDHB 作為丙酮酸脫氫酶復(fù)合體的重要組成部分,是連接糖酵解 (乳酸生成) 與 TCA 循環(huán)的關(guān)鍵節(jié)點。功能研究表明, PDHB 表達上調(diào)可增強線粒體代謝活性并促進內(nèi)胚層分化,而其缺失則導(dǎo)致丙酮酸無法有效進入線粒體,從而抑制分化進程,提示 TGFβ - PDHB 軸在代謝調(diào)控 和細胞分化 中的核心作用。

進一步研究發(fā)現(xiàn), 該 代謝變化 可以 通過 ATP 水平影響染色質(zhì)狀態(tài)從而調(diào)控基因表達。多種代謝中間產(chǎn)物中,僅 ATP 能夠有效挽救 PDHB 缺失 以及抑制葡萄糖代謝 所導(dǎo)致的分化缺陷。機制分析表明, ATP 通過調(diào)控 ATP 依賴的染色質(zhì)重塑復(fù)合體發(fā)揮作用,其中 BRG1 作為 BAF 復(fù)合體的核心 ATP 酶,其活性對于維持染色質(zhì)開放狀態(tài)至關(guān)重要。抑制 BRG1 功能或其 ATP 酶活性均顯著阻斷分化過程。染色質(zhì)可及性分析顯示,在 ATP 水平下降或 PDHB 缺失條件下,內(nèi)胚層關(guān)鍵基因調(diào)控區(qū)域的染色質(zhì)開放程度明顯降低,導(dǎo)致相關(guān)基因表達程序受阻。

此外,結(jié)合人類早期胚胎單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),從內(nèi)細胞團到上胚層再到原始條紋階段,糖酵解相關(guān)基因逐步下調(diào),而 TCA 循環(huán)及氧化磷酸化相關(guān)基因持續(xù)上調(diào),同時 BAF 復(fù)合體相關(guān)因子的表達同步增強,提示該研究所揭示的代謝 - 染色質(zhì)調(diào)控機制在體內(nèi)胚胎發(fā)育過程中同樣具有重要意義。


綜上所述,該研究揭示了 TGFβ 通過轉(zhuǎn)錄激活 PDHB ,促進丙酮酸進入線粒體并增強 TCA 循環(huán)及 ATP 生成,進而通過 ATP 依賴的染色質(zhì)重塑因子 BRG1 調(diào)控染色質(zhì)可及性,最終驅(qū)動人多能干細胞向內(nèi)胚層分化的分子機制。該工作在代謝調(diào)控與表觀遺傳調(diào)控之間建立了聯(lián)系,為理解人類早期發(fā)育過程中細胞命運決定 機制、同時也 為干細胞分化調(diào)控及再生醫(yī)學(xué)研究提供了 新的視角 。

蔣衛(wèi)教授 和湖北大學(xué) 楊介 博士 為本研究的通訊作者 ,武漢大學(xué)醫(yī)學(xué)研究院博士生孟李鳴、滄州師范學(xué)院呂靜博士、已畢業(yè)博士生弋穎為本文的共同第一作者 。 已畢業(yè)博士蘭賢春、博士生朱利航以及南昌大學(xué)江西醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院閆晨超博士也為本文做出了重要貢獻。該研究工作得到了武漢大學(xué)卿國良教授、湖北大學(xué)張冬卉教授的大力 支持。

原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-026-69510-0

蔣衛(wèi)課題組長期致力于干細胞命運決定的分子調(diào)控機制及其轉(zhuǎn)化應(yīng)用研究 , 近年來取得 的 系列 研究 進展 包括: 闡明表觀 遺傳 及 RNA 調(diào)控在人多能性調(diào)控以及胚層分化中的作用及機制( Cell Rep 2025 ; Nat Commun 2022 ; Nucleic Acids Res 202 5/2022 ; Genome Biol 2023 ; Nat Chem Biol 2025 ; Stem Cell Rep 2025/ 2020 ; D evelopment 2023 ; Cell Regen 202 5 ),解析細胞內(nèi)糖脂代謝以及細胞外生物力學(xué)調(diào)控細胞分化的機制( D ev Cell 2023 ; Nat Commun 202 6 ; Redox Biol 2022 ; Stem Cell Rep 2024/ 2021 ),探討胰島分化調(diào)控以及遺傳變異對于糖尿病易感性的作用機制( Nat Commun 202 4 ; Theranostics 2022 ; Genes Dis 202 6 ) ;獲批 8 項國家發(fā)明專利;參與撰寫中文教材 / 專著 3 部,英文專著 1 部。 課題組近期招聘博士后, 歡迎感興趣的同學(xué) 加入課題組 或報考研究生 。

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