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新分子加速蛋白降解,為癌癥免疫治療提供新策略

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細胞擁有一套非凡的“內(nèi)務(wù)清理”系統(tǒng):那些不再被需要的、有缺陷的或潛在有害的蛋白質(zhì),會被貼上一種分子標簽,并在細胞的回收系統(tǒng)中被拆解分解。這一過程被稱為泛素-蛋白酶體系統(tǒng),對健康與生存至關(guān)重要。

在一項新發(fā)表于《自然·化學》雜志的研究中,一個國際研究團隊識別出一類新的小分子——iDeg,能利用這套天然的泛素-蛋白酶體系統(tǒng),加速清除一種名為IDO1的免疫調(diào)節(jié)酶。這一發(fā)現(xiàn)為藥物研發(fā)引入了一個新概念,并有望改變在癌癥及其他領(lǐng)域如何靶向那些“難以對付”的蛋白質(zhì)的困局。

癌細胞如何欺騙免疫系統(tǒng)

大約130年前,癌癥免疫治療先驅(qū)威廉·科利(William Coley)將一種致命性的細菌混合物直接注射到一位癌癥患者的腫瘤中。患者出現(xiàn)了高燒,但腫瘤奇跡般地完全消退了。利用免疫系統(tǒng)對抗癌癥的癌癥免疫治療由此誕生。

我們的免疫系統(tǒng)能為我們提供全面的保護,抵御許多外來物質(zhì)、細菌、病毒以及受損細胞。其工作原理很簡單——區(qū)分“自我”和“外來”,或者說區(qū)分“健康”與“患病”。這項任務(wù)由一種稱為T細胞的特殊白細胞完成。然而,癌細胞往往能從這張“網(wǎng)”中溜走。好在存在一種特殊的T細胞——細胞毒性T細胞,能借助高度敏感的受體識別惡性細胞表面的癌癥特異性結(jié)構(gòu),并觸發(fā)這些細胞的死亡。

盡管如此,癌細胞已經(jīng)發(fā)展出多種策略來躲避細胞毒性T細胞,從而逃避免疫系統(tǒng)的清除。一方面,惡性細胞可以通過改變其表面具有癌癥特征的結(jié)構(gòu),把自己偽裝成健康細胞。另一方面,它們還可以通過使T細胞失活來“拖慢”免疫系統(tǒng)。為了達成這一目的,癌細胞會通過釋放某些信號物質(zhì)(如前列腺素)或代謝產(chǎn)物(如乳酸鹽),來抑制T細胞的活性。此外,癌細胞還可以通過激活T細胞上的免疫檢查點,從而減緩免疫應(yīng)答,這些檢查點在正常情況下用于防止免疫系統(tǒng)反應(yīng)過度——也就是避免自身免疫應(yīng)答。現(xiàn)代免疫治療旨在對抗這些機制,并重新激活免疫系統(tǒng)。

使用檢查點抑制劑的免疫療法可以解除免疫系統(tǒng)中的那些保護癌細胞的“剎車”,并已被用于治療多種腫瘤,例如黑色素瘤、肺癌、結(jié)腸癌和乳腺癌。然而,它們只能讓一部分患者獲益,并且會頻繁出現(xiàn)耐藥性。

IDO1與抑制劑

過去的一些臨床前研究顯示,將免疫檢查點抑制劑與免疫調(diào)節(jié)酶IDO1的抑制劑聯(lián)合使用,可顯著提高療效。IDO1在正常組織中幾乎不存在,卻在許多腫瘤中有很高含量。在腫瘤中,IDO1會將氨基酸色氨酸轉(zhuǎn)化為犬尿酸原。這種代謝轉(zhuǎn)變會通過減少細胞毒性T細胞的數(shù)量與活性來抑制免疫應(yīng)答。

在新的研究中,研究團隊在尋找新的IDO1抑制劑過程中,開發(fā)出了一種新的細胞檢測方法:通過測量培養(yǎng)細胞中的色氨酸向犬尿酸原的轉(zhuǎn)化,來衡量IDO1的活性。在對157,332種小分子進行篩選后,研究人員獲得了多種機制各異、效力極強的抑制劑,其中包括許多直接的IDO1抑制劑。

然而,一項涉及數(shù)千名患者的晚期III期臨床數(shù)據(jù)顯示:將檢查點抑制劑與傳統(tǒng)IDO抑制劑聯(lián)合使用,并不會帶來臨床上的效益。

研究人員雖然無法完全解釋試驗失敗的原因,但他們發(fā)現(xiàn)許多已知的IDO1抑制劑實際上會增加IDO1蛋白質(zhì)的含量,這反而會進一步增強對腫瘤的保護。因此,他們認為即使IDO1被抑制,但只要這種蛋白質(zhì)本身存在于細胞中,就可以僅憑“存在”而發(fā)揮促癌作用。

從“抑制”到“降解”

在新研究中,研究人員識別出一類新的分子——iDeg(IDO1降解劑)。他們發(fā)現(xiàn),iDeg與IDO1結(jié)合會誘發(fā)一種構(gòu)象變化,使IDO1被標上泛素的標記。隨后,被泛素化的IDO1會被E3連接酶CRL2KLHDC3識別,并被引導至蛋白酶體進行降解。


癌細胞(藍灰色)通過IDO1促進色氨酸分解為犬尿酸原,從而使T細胞(灰色) 失活。iDeg(綠色) 與 IDO1結(jié)合,并促使細胞內(nèi)的IDO1被降解,從而導致T細胞及免疫應(yīng)答被重新激活。(圖/Max Planck Institute)

這意味著,這些分子并非“發(fā)明”了一條新的降解路線,而是在更用力地按下細胞原本就具備的一枚“開關(guān)”。結(jié)果是:IDO1既被抑制,又被更高效地銷毀了。因此,這種獨特機制或許能夠克服以往IDO1抑制劑的局限,并為增強基于檢查點的免疫治療開辟新途徑。

這一發(fā)現(xiàn)的意義還不止于此,在另一篇后續(xù)發(fā)表的研究中,研究人員證明iDeg能抑制攜帶SKOV-3腫瘤的小鼠的腫瘤生長,從而延長其生存時間。

這項研究的思路遠不止適用于IDO1——許多在穩(wěn)定與不穩(wěn)定狀態(tài)之間循環(huán)的蛋白質(zhì),也可能擁有被低估的天然降解回路。研究人員表示,如果能學會如何放大這些回路,或許就能攻克那些長期以來被認為“無法成藥”的靶點。

#參考來源:

https://www.mpg.de/26031452/0121-moph-strengthened-immune-defence-against-cancer-151445-x?c=2249

https://cemm.at/news/detail/boosting-the-cells-own-cleanup-new-molecules-accelerate-protein-degradation

https://www.nature.com/articles/s41557-025-02021-5

#圖片來源:

封面圖&首圖:

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