題圖 | Pixabay

撰文 | 宋文法

梅毒螺旋體是一種細(xì)小的呈螺旋狀的細(xì)菌，會(huì)引起如梅毒、雅司病等傳染性疾病，但由于遠(yuǎn)古基因組數(shù)據(jù)匱乏，其起源和演化歷史一直存在爭議。

2026年1月22日，美國加州大學(xué)、瑞士洛桑大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)在"Science"期刊上發(fā)表了一篇題為" A 5500-year-old Treponema pallidum genome from Sabana de Bogotá，Colombia "的研究論文。

這項(xiàng)研究破解了梅毒起源之謎，研究團(tuán)隊(duì)成功從哥倫比亞5500年前古人遺骸中提取了梅毒螺旋體基因組，將梅毒基因組記錄向前推進(jìn)了3000多年，為破解梅毒起源、傳播與演化提供了前所未有的分子證據(jù)。

圖：論文截圖

在這項(xiàng)研究中，研究人員分析了來自一名45-60歲以上的成年男性遺骸，其死亡時(shí)間在公元前5464年至公元前5309年之間，通過對(duì)古人類骨骼樣本進(jìn)行高通量測序與宏基因組篩查，意外發(fā)現(xiàn)了梅毒螺旋體的DNA痕跡，并成功重建出完整古梅毒螺旋體基因組。

過宏基因組篩查技術(shù)，研究團(tuán)隊(duì)意外發(fā)現(xiàn)了梅毒螺旋體的DNA痕跡，并成功重建出覆蓋度達(dá)1.7倍、完整度78.5%的梅毒螺旋體基因組，命名為TE1-3。然而，這具遺骸并無梅毒螺旋體感染典型的骨骼病變特征。

進(jìn)一步分析顯示，TE1-3屬于梅毒螺旋體物種，與現(xiàn)代梅毒、雅司病等相關(guān)病原體亞種的基因組對(duì)比，TE1-3是所有已知現(xiàn)代梅毒螺旋體亞種的早期分化姐妹譜系，是一種此前未知的古老譜系。

分子鐘分析顯示，E1-3與現(xiàn)代梅毒亞種的共同祖先約在1.37萬年前分化，恰逢人類進(jìn)入美洲后不久，表明梅毒螺旋體在哥倫布抵達(dá)美洲之前數(shù)千年已在當(dāng)?shù)厝巳褐袀鞑?，在美洲人類定居后不久，梅毒螺旋體已開始多樣化，挑戰(zhàn)了傳統(tǒng)的“哥倫布輸入”單一假說。

此外，基因組分析顯示，盡管相隔5500年，TE1-3仍攜帶現(xiàn)代梅毒螺旋體菌株中常見的毒力相關(guān)基因，表明這一古老病原體已具備感染人類的潛力。

圖：論文截圖

研究人員表示，這一結(jié)論表明，在美洲人類定居后不久，梅毒螺旋體已開始多樣化，挑戰(zhàn)了該病原體僅起源于亞非大陸的傳統(tǒng)觀點(diǎn)。這是首次在完全沒有骨骼病變特征個(gè)體中，通過DNA測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)梅毒病原體，表明古代感染可能遠(yuǎn)比我們通過骨骼記錄所見的更為普遍。

綜上，TE1-3的發(fā)現(xiàn)，將梅毒基因組記錄向前推進(jìn)了3000多年，也提示我們，許多現(xiàn)代傳染病的故事早在史前就已寫下。

參考文獻(xiàn)：

https://doi.org/10.1126/science.adw3020

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