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曾獲諾貝爾獎的固相多肽合成是啥?應(yīng)用中會有哪些問題?

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一、定義與核心概念

固相合成(Solid-Phase Synthesis, SPS)是一種在固相載體上逐步構(gòu)建有機(jī)分子的化學(xué)合成方法,尤其以固相多肽合成( solid phase peptide synthesis, SPPS)最為著名。其核心原理是將目標(biāo)分子的第一個(gè)單體(如氨基酸)通過化學(xué)鍵固定在不可溶的樹脂載體上,隨后依次添加后續(xù)單體,并通過重復(fù)的脫保護(hù)、偶聯(lián)和洗滌步驟完成鏈?zhǔn)窖由欤罱K切割樹脂得到目標(biāo)產(chǎn)物,此反應(yīng)極大的減小了多肽合成的難度。固相肽合成是肽合成化學(xué)的重要突破。其主要特點(diǎn)是無需純化中間產(chǎn)物,合成過程可以連續(xù)進(jìn)行,為多肽合成的自動化奠定了基礎(chǔ)。目前多肽的全自動合成基本上是固相合成。

二、發(fā)展脈絡(luò)

1、奠基階段 ----- 多肽合成研究已經(jīng)走過了一百多年的光輝歷程。1902年,Emil Fischer首先開始關(guān)注多肽合成,由于當(dāng)時(shí)在多肽合成方面的知識太少,進(jìn)展也相當(dāng)緩慢,直到1932年,Max Bergmann等人開始使用芐氧羰基(Z)來保護(hù)α-氨基,多肽合成才開始有了一定的發(fā)展。

到了20世紀(jì)50年代,有機(jī)化學(xué)家們合成了大量的生物活性多肽,包括催產(chǎn)素,胰島素等,同時(shí)在多肽合成方法以及氨基酸保護(hù)基上面也取得了不少成績,這為后來的固相合成方法的出現(xiàn)提供了實(shí)驗(yàn)和理論基礎(chǔ)。

1963年,Merrifield首次提出了固相多肽合成方法(SPPS),這個(gè)在多肽化學(xué)上具有里程碑意義的合成方法,一出現(xiàn)就由于其合成方便,迅速,成為多肽合成的首選方法,而且?guī)砹硕嚯挠袡C(jī)合成上的一次革命,并成為了一支獨(dú)立的學(xué)科——固相有機(jī)合成(SPOS)。因此,Merrifield榮獲了1984年的諾貝爾化學(xué)獎。Merrifield經(jīng)過了反復(fù)的篩選,最終摒棄了芐氧羰基(Z)在固相上的使用,首先將叔丁氧羰基(BOC)用于保護(hù)α-氨基并在固相多肽合成上使用,同時(shí),Merrifield在60年代末發(fā)明了第一臺多肽合成儀,并首次合成生物蛋白酶,核糖核酸酶(124個(gè)氨基酸)。

1972年,Lou Carpino首先將9-芴甲氧羰基(FMOC)用于保護(hù)α-氨基,其在堿性條件下可以迅速脫除,10min就可以反應(yīng)完全,而且由于其反應(yīng)條件溫和,迅速得到廣泛使用,以BOC和FMOC這兩種方法為基礎(chǔ)的各種肽自動合成儀也相繼出現(xiàn)和發(fā)展,并仍在不斷得到改造和完善。同時(shí),固相合成樹脂,多肽縮合試劑以及氨基酸保護(hù)基,包括合成環(huán)肽的氨基酸正交保護(hù)上也取得了豐碩的成果。


2、技術(shù)革新---- Fmoc保護(hù)基的引入:1972年,路易斯·卡彭特(Louis Carpino)開發(fā)了Fmoc(9-芴甲氧羰基)保護(hù)策略。與Boc需強(qiáng)酸(如三氟乙酸,TFA)脫保護(hù)不同,F(xiàn)moc可通過溫和的堿性條件(如哌啶)脫除,減少副反應(yīng),尤其適用于復(fù)雜多肽和自動化合成。自動化合成儀:1980年代,首臺商業(yè)多肽合成儀問世,大幅提升了合成通量和精度。

3、成熟與擴(kuò)展(1990年代至今)---- 樹脂與試劑的優(yōu)化:開發(fā)了高載量、親水性的PEG修飾樹脂(如Tentagel),以及高效偶聯(lián)試劑(如HBTU、HATU)。應(yīng)用拓展:從多肽延伸至寡核苷酸、多糖及小分子化合物合成。技術(shù)融合:微波輔助合成、流動化學(xué)等新方法進(jìn)一步縮短反應(yīng)時(shí)間并提高產(chǎn)率。


三、技術(shù)詳解 1. 基本原理與步驟

固相載體:常用樹脂包括聚苯乙烯(疏水性)和PEG接枝樹脂(親水性),功能基團(tuán)如Wang樹脂(羥基)、Rink酰胺樹脂(氨基)決定產(chǎn)物C端結(jié)構(gòu)。

保護(hù)策略:

Boc法:Boc保護(hù)氨基,需TFA脫保護(hù);適合短肽,但長鏈易因強(qiáng)酸累積損傷。

Fmoc法:Fmoc保護(hù)氨基,哌啶脫保護(hù);條件溫和,兼容側(cè)鏈多樣化保護(hù)(如t-Bu、Trt基團(tuán))。

要成功合成具有特定的氨基酸順序的多肽,需要對暫不參與形成酰胺鍵的氨基和羧基加以保護(hù),同時(shí)對氨基酸側(cè)鏈上的活性基因也要保護(hù),反應(yīng)完成后再將保護(hù)基因除去。同液相合成一樣,固相合成中多采用烷氧羰基類型作為α氨基的保護(hù)基,因?yàn)檫@樣不易發(fā)生消旋。最早是用芐氧羰基,由于它需要較強(qiáng)的酸解條件才能脫除,所以后來改為叔丁氧羰基(BOC)保護(hù),用TFA(三氟乙酸)脫保護(hù),但不適用含有色氨酸等對酸不穩(wěn)定的肽類的合成。changMeienlofer和Atherton等人采用Carpino報(bào)道的Fmoc(9-芴甲氧羰基)作為α氨基保護(hù)基,F(xiàn)moc基對酸很穩(wěn)定,但能用哌啶-CH2CL2或哌啶-DMF脫去,近年來,F(xiàn)moc合成法得到了廣泛的應(yīng)用。羧基通常用形成酯基的方法進(jìn)行保護(hù)。甲酯和乙酯是逐步合成中保護(hù)羧基的常用方法,可通過皂化除去或轉(zhuǎn)變?yōu)殡乱员阌糜谄瑪嘟M合;叔丁酯在酸性條件下除去;芐酯常用催化氫化除去。對于合成含有半胱氨酸、組氨酸、精氨酸等帶側(cè)鏈功能基的氨基酸的肽來說,為了避免由于側(cè)鏈功能團(tuán)所帶來的副反應(yīng),一般也需要用適當(dāng)?shù)谋Wo(hù)基將側(cè)鏈基團(tuán)暫時(shí)保護(hù)起來。保護(hù)基的選擇既要保證側(cè)鏈基團(tuán)不參與形成酰胺的反應(yīng),又要保證在肽合成過程中不受破壞,同時(shí)又要保證在最后肽鏈裂解時(shí)能被除去。如用三苯甲基保護(hù)半胱氨酸的S-,用酸或銀鹽、汞鹽除去;組氨酸的咪唑環(huán)用2,2,2-三氟-1-芐氧羰基和2,2,2-三氟-1-叔丁氧羰基乙基保護(hù),可通過催化氫化或冷的三氟乙酸脫去。精氨酸用金剛烷氧羰基(Adoc)保護(hù),用冷的三氟乙酸脫去。

固相中的接肽反應(yīng)原理與液相中的基本一致,將兩個(gè)相應(yīng)的氨基被保護(hù)的及羧基被保護(hù)的氨基酸放在溶液內(nèi)并不形成肽鍵,要形成酰胺鍵,經(jīng)常用的手段是將羧基活化,變成混合酸酐、活潑酯、酰氯或用強(qiáng)的失去劑(如碳二亞氨)形成對稱酸酐等方法來形成酰胺鍵。其中選用DCC、HOBT或HOBT/DCC的對稱酸酐法、活化酯法接肽應(yīng)用最廣。

裂解及合成肽鏈的純化 BOC法用TFA+HF裂解和脫側(cè)鏈保護(hù)基,F(xiàn)MOC法直接用TFA,有時(shí)根據(jù)條件不同,其它堿、光解、氟離子和氫解等脫保護(hù)方法也被采用。合成肽鏈進(jìn)一步的精制、分離與純化通常采用高效液相色譜、親和層析、毛細(xì)管電泳等。

合成循環(huán):

  • 脫保護(hù):移除氨基保護(hù)基(Fmoc用20%哌啶/DMF)。

  • 偶聯(lián):活化羧酸的氨基酸(如用HBTU/HOBt/DIEA)與樹脂上的游離氨基反應(yīng)。

  • 洗滌:DMF、DCM等溶劑去除未反應(yīng)試劑。

切割與純化:合成完成后,用TFA(含清除劑如H?O、TIS)切割樹脂與多肽間的連接鍵,經(jīng)HPLC和質(zhì)譜純化鑒定。

2. 關(guān)鍵試劑與載體

偶聯(lián)試劑:HBTU/HATU(提高偶聯(lián)效率)、DIC/Oxyma(減少消旋化)。

樹脂類型:

Wang樹脂:適用于羧酸終產(chǎn)物(如游離酸或酯)。

Rink酰胺樹脂:生成C端酰胺化多肽(類似天然蛋白結(jié)構(gòu))。

側(cè)鏈保護(hù)基:如Trityl(Trt)保護(hù)半胱氨酸,Pbf保護(hù)精氨酸,防止副反應(yīng)。

C端羧肽合成可選用Wang樹脂;對于C端酰胺肽的合成,可選擇Rink Amide AM Resin或Rink Amide MBHA Resin;對于全保護(hù)肽的合成,我們可以選擇2-Cl Trt Resin。

樹脂的參數(shù)及其含義:
一般樹脂的參數(shù)包括載量、目數(shù)和規(guī)格,如1% DVB。
載量:單位為mmol/g,即每克樹脂存在多少毫摩爾官能團(tuán)。
目數(shù):粒度一般為100-200目,數(shù)值越大,顆粒越細(xì)。
1% DVB:交聯(lián)劑二乙烯基苯在苯乙烯和二乙烯基苯共聚物中的比例。

固相多肽合成廣泛應(yīng)用于藥物開發(fā)領(lǐng)域,如合成胰島素類似物、GLP-1受體激動劑(如利拉魯肽),定制表位肽用于抗體生產(chǎn)或蛋白相互作用研究。固相合成技術(shù)正朝著高通量、綠色化學(xué)(減少溶劑浪費(fèi))和智能化(AI優(yōu)化序列設(shè)計(jì))方向發(fā)展。新型載體(如可降解樹脂)和連續(xù)流反應(yīng)器有望進(jìn)一步突破合成極限,推動合成生物學(xué)與精準(zhǔn)醫(yī)療的進(jìn)步。

參考文獻(xiàn):

  1. Merrifield, R.B. (1963). J. Am. Chem. Soc., 85(14), 2149–2154.

  2. Chan, W.C., & White, P.D. (2000). Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis: A Practical Approach. Oxford University Press.

  3. Henninot, A., et al. (2018). J. Med. Chem., 61(4), 1382–1414.

固相多肽合成中可能出現(xiàn)的問題:

1. 什么是凈肽含量(肽含量),其意義是什么?
多肽的干重不僅包含肽本身,還包括水分、吸附溶劑、配位離子及鹽類等非肽成分。凈肽含量指肽在該混合物中的重量百分比,范圍通常在50%-90%之間,具體取決于純度、序列及合成/純化方法。凈肽含量不可與肽純度混淆——二者概念不同:純度通過高效液相色譜(HPLC)測定,表示正確序列組分的百分比;而凈肽含量量化的是肽材料相對于非肽物質(zhì)的比例。凈肽含量通常通過氨基酸組成分析或紫外分光光度法測定,這對肽濃度敏感的實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要。

2. 多肽生產(chǎn)的常用方法有哪些?
線性肽采用Fmoc固相法從C端向N端延伸合成。首個(gè)氨基酸通過酸敏連接劑固定于不溶性樹脂上,經(jīng)哌啶去除Fmoc保護(hù)基后,耦聯(lián)第二個(gè)Fmoc保護(hù)氨基酸。活化方式包括預(yù)活化或“一鍋法”。完成目標(biāo)序列后,用三氟乙酸(TFA)將肽從樹脂上切下,獲得粗產(chǎn)物。

3. 如何根據(jù)實(shí)驗(yàn)選擇肽純度?

純度需求依實(shí)驗(yàn)?zāi)康亩ǎ?/p>

  • 篩選實(shí)驗(yàn)(低靈敏度):粗品>75%

  • 免疫實(shí)驗(yàn):>85%

  • 受體-配體研究、生物測定或細(xì)胞實(shí)驗(yàn):>95%

  • 結(jié)構(gòu)研究:>98%

4. 為何合成含Cys、Met或Trp的肽較困難?
這些殘基易氧化,合成高純度含此類殘基的肽需特殊工藝,儲存時(shí)需避免反復(fù)接觸空氣。

5. 若肽純度為95%,剩余5%是什么?
主要為耦聯(lián)步驟不完善產(chǎn)生的氨基酸缺失副產(chǎn)物,因其色譜性質(zhì)相似,常與目標(biāo)肽共同洗脫。

6. 未HPLC純化的肽含哪些雜質(zhì)?
粗品或脫鹽肽可能含截短肽、殘留溶劑(如DTT、TFA)及合成試劑。

7. 最佳肽長度是多少?
合成效率隨長度增加(>20殘基)下降。短肽(5殘基)建議使用疏水性氨基酸以簡化純化;功能域兩側(cè)建議添加親水/帶電殘基提升溶解性。

8. 如何從序列預(yù)測肽溶解性?

  • 疏水殘基(Leu、Val、Ile、Met、Phe、Trp)>50%:可能難溶于水

  • 帶電殘基(Lys、Arg、His、Asp、Glu)≥20%:溶解性佳

  • 中性肽:需有機(jī)溶劑(如DMSO、乙腈)

9. 如何純化多肽?采用反相HPLC(C8/C18柱),以TFA/乙腈梯度洗脫。疏水肽可能需甲酸或乙酸。長肽(>20aa)需質(zhì)譜鑒定目標(biāo)峰。

10. 如何計(jì)算Fmoc-氨基酸樹脂載量?
兩種方法:
(1) 耦聯(lián)后增重除以分子量與樹脂質(zhì)量
(2) 紫外吸光度分析:如果肽段序列中含有Trp或Tyr,可用紫外法分析肽段的含量,根據(jù)摩爾消光系數(shù):
色氨酸 5,560 AU/mmole/ml
酪氨酸 1,200 AU/mmole/ml
(280 nm at 中性pH使用 1 cm 比色皿)
肽的摩爾消光系數(shù)可以根據(jù)每個(gè)色氨酸或酪氨酸的系數(shù)相加,然后根據(jù)在 280 nm 處測得的吸光值按公式計(jì)算。
mg 肽/ml = (A280 x DF x MW) / e
A280,280 nm 處的實(shí)際吸收值(1 cm 池),
DF,稀釋因子,
MW,肽的分子量
e,肽的摩爾消光系數(shù)

11. 如何溶解多肽?

  • 凈電荷>0(堿性):溶于水;可加乙酸(≥10%)或TFA

  • 凈電荷=0(酸性):溶于水;可加氨水

  • 中性電荷:用有機(jī)溶劑(如DMSO、乙腈)或尿素

12. 如何儲存合成肽?

  • 長期:凍干、干燥后-20°C保存

  • 含Cys/Met/Trp的肽:用脫氧緩沖液;避免反復(fù)凍融

  • 含Gln/Asn的肽:因易降解,保質(zhì)期有限

13. 如何處理肽末端?

肽用于模擬蛋白質(zhì)。為了模擬蛋白質(zhì)的表達(dá),我們需要合成與蛋白質(zhì)具有相似結(jié)構(gòu)和電荷的肽。當(dāng)一個(gè)肽從蛋白質(zhì)中“切出”時(shí),兩端的電荷數(shù)將與基因體蛋白的電荷數(shù)不同。我們需要改變合成策略以使它們保持一致。一般來說,如果來自蛋白質(zhì)的C端,N端被乙酰化屏蔽;如果它來自蛋白質(zhì)的N端,則C端被酰胺化屏蔽;如果它來自蛋白質(zhì)的中間部分,則兩端被乙?;王0坊帘?。


編輯自:

1、

2、百度百科:https://baike.baidu.com/item/%E5%A4%9A%E8%82%BD%E5%9B%BA%E7%9B%B8%E5%90%88%E6%88%90%E6%B3%95/7327635

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