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解鎖生命密碼的生物芯片

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上??萍吉?jiǎng)勵(lì)研究成果科普化特別報(bào)道

我國(guó)科學(xué)家研發(fā)的高精度多維微納操作技術(shù),解決了生物芯片制備的準(zhǔn)確度和精度難題,提升了制備效率。

芯片上的“生命小天地”

在信息時(shí)代,人們對(duì)計(jì)算機(jī)芯片已不再陌生,它是計(jì)算機(jī)得以高效運(yùn)轉(zhuǎn)的“心臟”與“大腦”。但是,計(jì)算機(jī)芯片還有一個(gè)“遠(yuǎn)房表親”生物芯片,很多人對(duì)它就未必熟悉了。

與計(jì)算機(jī)芯片類(lèi)似,生物芯片也采用了集成化技術(shù)。它用玻璃、塑料或硅膠當(dāng)“畫(huà)布”,把核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞等固定在上面。不同于計(jì)算機(jī)芯片,生物芯片是一種生物檢測(cè)的工具,可以用來(lái)檢測(cè)DNA、RNA或蛋白質(zhì)。

生物芯片上海國(guó)家工程研究中心主任郜恒駿教授介紹說(shuō),生物芯片是一種基因組研究工具,它們?cè)诤苄∶娣e的載玻片上集成了探針。這些探針與生物樣本(核酸、蛋白質(zhì)或組織)進(jìn)行接觸、雜交后,科學(xué)家對(duì)其進(jìn)行研究,就可以知道樣本中哪些基因或蛋白質(zhì)發(fā)生了改變,從而發(fā)現(xiàn)某些重要疾病的標(biāo)志物,進(jìn)而將其轉(zhuǎn)化為藥物治療的靶點(diǎn),應(yīng)用于臨床。

生物芯片“大家庭”

根據(jù)芯片中生物成分的不同,生物芯片“大家庭”包括基因芯片、蛋白質(zhì)芯片、組織芯片、器官芯片和類(lèi)器官芯片等。

基因芯片上固定了許多已知序列的核酸片段,就像是一把把特定的鑰匙。當(dāng)我們把從生物樣本中提取出來(lái)的DNA放在基因芯片上時(shí),如果樣本中的DNA片段和基因芯片上的某一段核酸序列互補(bǔ),它們就會(huì)像鑰匙和鎖一樣緊緊結(jié)合在一起。通過(guò)檢測(cè)這種結(jié)合情況,科學(xué)家就能知道樣品中包含哪些基因,以及這些基因表達(dá)水平的高低。

蛋白質(zhì)芯片上固定著許多不同的抗體??贵w就像是專(zhuān)門(mén)尋找特定蛋白質(zhì)的偵探,當(dāng)樣品中的蛋白質(zhì)與芯片上對(duì)應(yīng)的抗體相遇時(shí),它們會(huì)特異性地結(jié)合在一起。通過(guò)檢測(cè)這種結(jié)合反應(yīng),科學(xué)家就能了解樣品中各種蛋白質(zhì)的種類(lèi)和含量。在癌癥研究中,蛋白質(zhì)芯片可以幫助研究人員找到與癌癥相關(guān)的蛋白質(zhì)標(biāo)志物,就像在茫茫人海中精準(zhǔn)定位出那些可能引發(fā)疾病的“壞分子”。

在經(jīng)典的生物芯片中,大量生物分子(如核酸、蛋白質(zhì)等)被固定在固相載體表面,形成微陣列。隨著生物測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,一些經(jīng)典的生物芯片被逐漸替代。不過(guò),當(dāng)微流控技術(shù)創(chuàng)新應(yīng)用于生物芯片后,促成了器官芯片和類(lèi)器官芯片的誕生,使生物芯片家族進(jìn)一步壯大。

微流控技術(shù)是指使用微管道處理或操縱微小流體的技術(shù)??茖W(xué)家通過(guò)在生物芯片上設(shè)計(jì)復(fù)雜的微通道網(wǎng)絡(luò)并結(jié)合使用微量壓力泵、微量注射泵等精密流控儀器,可以精確地控制細(xì)胞的生長(zhǎng)環(huán)境(包括營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的供應(yīng)、廢物的排出及細(xì)胞間的相互作用)。這種精確控制使生物芯片能夠高度模擬人體內(nèi)的生理?xiàng)l件,為觀察細(xì)胞的生物學(xué)行為提供了很好的平臺(tái)和工具。

器官芯片仿佛是一個(gè)微觀的生命系統(tǒng)。借助微加工技術(shù),科學(xué)家如同技藝高超的建筑師,在芯片基底上精心搭建出模擬人體環(huán)境的“小房子”(微通道和微腔室),然后邀請(qǐng)?zhí)囟?xì)胞“居民”入住,通過(guò)微流控系統(tǒng)為細(xì)胞提供必要的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和生長(zhǎng)因子。如此悉心培育后,芯片上就“生長(zhǎng)”出與特定細(xì)胞對(duì)應(yīng)的“微縮版”器官或組織模型。

類(lèi)器官是一種在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng)的迷你器官,它們能夠模擬真實(shí)器官的組織結(jié)構(gòu)和部分功能,如會(huì)跳動(dòng)的心臟類(lèi)器官、會(huì)流淚的淚腺類(lèi)器官等。類(lèi)器官通常由干細(xì)胞或多能干細(xì)胞通過(guò)自組織過(guò)程形成,它們可以自我組裝成具有器官特異性的細(xì)胞類(lèi)型和組織結(jié)構(gòu)。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),器官芯片上長(zhǎng)了類(lèi)器官就成了類(lèi)器官芯片。類(lèi)器官芯片就像一個(gè)超級(jí)迷你器官工廠 ,能在小小的芯片上培育出多個(gè)類(lèi)器官,并且模擬它們?cè)谌梭w中相互協(xié)作的場(chǎng)景。

器官芯片和類(lèi)器官芯片的一個(gè)重要作用是替代模式動(dòng)物。在藥物研發(fā)領(lǐng)域,它們堪稱(chēng)“超級(jí)加速器”。新藥研發(fā)是一個(gè)漫長(zhǎng)的過(guò)程,通常需要十幾年時(shí)間,且耗資巨大。在新藥研發(fā)的臨床前階段,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)扮演著至關(guān)重要的角色。但是,模式動(dòng)物不僅培養(yǎng)周期長(zhǎng),成本高昂,而且一致性較差,實(shí)驗(yàn)結(jié)果可能無(wú)法直接外推到人類(lèi)。器官芯片和類(lèi)器官芯片能夠更精確地模擬人體的器官功能結(jié)構(gòu),提供更精準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),大大縮短藥物研發(fā)的周期,讓特效藥物更快問(wèn)世。

器官芯片

(圖片來(lái)源:上海生物芯片有限公司)

“蛻變”的生物芯片

器官芯片和類(lèi)器官芯片等新型生物芯片的發(fā)展,對(duì)芯片制備的準(zhǔn)確度和精度提出了更大的挑戰(zhàn)。為此,上海生物芯片有限公司與上海大學(xué)合作開(kāi)展了“高精度多維微納操作關(guān)鍵技術(shù)及應(yīng)用”項(xiàng)目。

針對(duì)目前尖端光電和先進(jìn)制造裝備在復(fù)雜嚴(yán)苛環(huán)境下面臨的“納米精度難實(shí)現(xiàn)”“傳動(dòng)行程難保證”“操控器件難構(gòu)建”等挑戰(zhàn),項(xiàng)目組突破了高精度多維微納操作關(guān)鍵技術(shù),形成了系列多自由度精密定位平臺(tái)及其末端操作器,支撐尖端光電和先進(jìn)制造裝備在微納米尺度下實(shí)現(xiàn)“驅(qū)動(dòng)精”“傳動(dòng)準(zhǔn)”“操控順”。

項(xiàng)目組成員、上海生物芯片有限公司總經(jīng)理助理兼研發(fā)總監(jiān)徐祎春介紹說(shuō),傳統(tǒng)的生物芯片制備效率較低,一次只能點(diǎn)制幾十片,采用高精度多維微納操作技術(shù)后,可以一次性點(diǎn)制成百上千片芯片,大大提升了制備效率。

另外,生物芯片的制備對(duì)材料的要求非常高,傳統(tǒng)的制備技術(shù)會(huì)對(duì)材料造成一定的損傷。項(xiàng)目組基于光鑷和光成形的原位微成形技術(shù),建立了基于不同表面特性的微納操作器非接觸組裝操控方法。這種方法可以更精細(xì)地操縱細(xì)胞,避免了對(duì)細(xì)胞的傷害。項(xiàng)目成果使生物芯片的制備從微米尺度進(jìn)入納米尺度,提高了芯片的均一性和準(zhǔn)確度。

本文相關(guān)成果“高精度多維微納操作關(guān)鍵技術(shù)及應(yīng)用”榮獲2022年度上海市技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)。

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