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抗癌還能抗衰老!攻克“不可成藥”,這10項研究進展值得關(guān)注

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編者按:靶向蛋白降解劑(TPD)通過利用細胞自身的蛋白降解系統(tǒng)降解與疾病相關(guān)的靶蛋白。由于無需直接抑制靶蛋白的活性,這種治療模式有望針對許多以往被認為“不可成藥”的靶點,因而成為新藥開發(fā)的熱點領(lǐng)域之一。早在近10年前,這項技術(shù)剛剛起步時,藥明康德就開始布局相關(guān)能力和技術(shù),積累了豐富的成功經(jīng)驗,搭建起集發(fā)現(xiàn)、合成、分析純化和測試等能力的一體化賦能平臺。目前,該平臺已成功支持超過120款TPD分子的開發(fā),其中20余款順利推進至臨床階段。今年,TPD領(lǐng)域的前沿研究收獲頗豐:多款新型TPD技術(shù)誕生,發(fā)展迅速的PROTAC與分子膠技術(shù)也迎來了治療場景的突破。本文將回顧2025年上半年TPD領(lǐng)域的最新進展。

從癌癥到抗衰:PROTAC新前沿

蛋白降解靶向嵌合體(Proteolysis Targeting Chimeras,簡稱PROTAC)是TPD領(lǐng)域最具代表性的技術(shù)之一,它由靶蛋白配體、E3泛素連接酶配體和連接鏈(Linker)三個關(guān)鍵部分組成。當PROTAC同時結(jié)合目標蛋白和E3連接酶時,E3酶會催化靶蛋白的多泛素化,使其被蛋白酶體識別并降解。

這種特殊作用機制賦予了PROTAC獨特優(yōu)勢:它不需要長時間占據(jù)靶蛋白活性位點,只需短暫結(jié)合蛋白表面即可誘導(dǎo)其降解。這一特性使其能夠靶向缺乏明確活性位點的蛋白,包括轉(zhuǎn)錄因子、支架蛋白和突變體蛋白等傳統(tǒng)"不可成藥"靶點。過往的研究中,PROTAC技術(shù)已經(jīng)在腫瘤領(lǐng)域嶄露頭角,尤其在解決耐藥性和免疫微環(huán)境調(diào)控方面表現(xiàn)出巨大應(yīng)用潛力。


今年上半年,PROTAC的臨床領(lǐng)域迎來里程碑式進展:首個PROTAC分子3期結(jié)果發(fā)布,vepdegestrant在攜帶ESR1突變的HR陽性、HER2陰性乳腺癌患者中,將患者的疾病進展或死亡風險降低超過40%。Arvinas和輝瑞近日已經(jīng)向美國FDA遞交vepdegestrant的新藥申請(NDA)。與此同時,PROTAC領(lǐng)域的前沿研究也取得了一系列突破性進展。伴隨著對分子與細胞機制的探索,多款具有癌癥、衰老相關(guān)疾病治療潛力的PROTAC分子初露鋒芒。

例如,不久前的一項《自然》研究發(fā)現(xiàn),STAT3蛋白會削弱樹突狀細胞的抗原呈遞能力和T細胞活化功能,制約這類細胞在免疫檢查點阻斷治療(ICB)中的功能。為了解決這一問題,研究者開發(fā)了兩種新型STAT3靶向PROTAC分子SD-36和SD-2301。這些PROTAC分子能特異性誘導(dǎo)STAT3蛋白的泛素化降解,激發(fā)樹突狀細胞的抗癌潛能。在多種小鼠腫瘤模型中,SD-36或 SD-2301單藥治療就顯示出顯著療效,不僅能有效抑制腫瘤生長,還能克服ICB耐藥問題。機制研究表明,STAT3降解后樹突狀細胞的共刺激分子表達顯著上調(diào),CD8+T細胞浸潤增加。SD-36、SD-2301與抗PD-L1抗體聯(lián)用,還可顯著增強療效。


另一項《分子細胞》研究設(shè)計了一種靶向NSD3S的PROTAC分子。研究指出,當特定的泛素連接酶復(fù)合物調(diào)控出現(xiàn)故障,導(dǎo)致NSD3S蛋白水平異常升高,就會引發(fā)癌細胞對PARP抑制劑的耐藥性。而在多種前列腺癌模型中,這款PROTAC能夠有效恢復(fù)腫瘤細胞對抗癌藥物PARP抑制劑的敏感度,為前列腺癌提供了新的聯(lián)合治療思路。

除了癌癥,PROTAC技術(shù)也有望在衰老相關(guān)疾病中“施展拳腳”。今年1月,《自然-衰老》的一項研究展示了一種新型雙靶點PROTAC分子753b,能夠同時降解BCL-xL和BCL-2這兩個關(guān)鍵的抗凋亡蛋白。在代謝功能障礙相關(guān)脂肪性肝炎(MASH)小鼠模型中,753b治療選擇性地清除了肝臟中的衰老細胞,使纖維化面積減少60%以上。更重要的是,在MASH驅(qū)動的肝癌模型中,753b能通過清除衰老細胞使肝癌發(fā)生率降低80%,治療性干預(yù)也能顯著抑制腫瘤進展。

為了確保PROTAC分子發(fā)揮出強大功能,科學家們一直在嘗試提升其細胞內(nèi)遞送效率。一項發(fā)表于《細胞》的研究顯著提升了對相關(guān)機制的認知。通過創(chuàng)新的探針技術(shù),該研究首次鑒定出CD36是多種PROTAC分子的內(nèi)吞受體。研究發(fā)現(xiàn),多個PROTAC以及雷帕霉素等大分子藥物,都能通過CD36依賴的內(nèi)吞途徑進入細胞。在精確定位PROTAC分子與CD36的結(jié)合界面后,該研究通過對PROTAC進行前藥修飾,使其與CD36的親和力提升10倍,細胞攝取效率提高3-5倍。

分子膠應(yīng)用范圍大提升

在TPD領(lǐng)域,分子膠以其小分子特性和獨特的誘導(dǎo)蛋白降解機制成為另一類重要療法。分子膠是一類能夠誘導(dǎo)或增強兩個蛋白質(zhì)相互作用的小分子,通常通過促使E3泛素連接酶與目標蛋白結(jié)合,觸發(fā)泛素介導(dǎo)的蛋白降解。與PROTAC不同,分子膠本身不是雙功能分子,而是通過改變蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),間接促成目標蛋白的降解。

經(jīng)典的分子膠,如沙利度胺(Thalidomide)及其衍生物可以結(jié)合CRBN(Cereblon)E3泛素連接酶,促使IKZF1/3等轉(zhuǎn)錄因子降解,用于多發(fā)性骨髓瘤治療。CRBN是一種E3泛素連接酶復(fù)合物的底物識別組分,一項剛剛發(fā)表于《科學》雜志的研究通過系統(tǒng)探索CRBN的靶點空間,揭示了分子膠誘導(dǎo)的新底物識別規(guī)則。篩選結(jié)果顯示,共有1633種人類蛋白可能具有表面暴露的G-loop樣基序,能夠與CRBN結(jié)合。這些蛋白覆蓋超過250種結(jié)構(gòu)域和近100種功能類別,其中包含大量傳統(tǒng)上被認為"不可成藥"的靶點,有望大幅拓展分子膠的應(yīng)用范圍。


癌癥治療是分子膠研發(fā)的重要方向。今年2月《自然》的兩項背靠背研究發(fā)現(xiàn),某些癌癥突變能使蛋白發(fā)揮類似分子膠的作用。例如髓母細胞瘤中反復(fù)出現(xiàn)的KBTBD4突變能使KBTBD4蛋白與組蛋白去乙?;?(HDAC1)緊密結(jié)合,進而影響表觀遺傳調(diào)控。這種突變誘導(dǎo)的蛋白相互作用與小分子藥物UM171的作用機制高度相似。UM171作為分子膠,可通過降解HDAC1干預(yù)癌細胞干性,從而抑制腫瘤生長。研究還發(fā)現(xiàn),UM171分子能夠橋接CUL3-RING E3 KBTBD4的特定結(jié)構(gòu)域和HDAC1的催化結(jié)構(gòu)域,將分子膠的應(yīng)用范圍擴展至CRL3 E3家族,拓展了分子膠設(shè)計的可能性。

多款創(chuàng)新TPD分子涌現(xiàn)

除PROTAC和分子膠外,更多新型TPD技術(shù)正在推動該領(lǐng)域向更精準、更廣泛的方向發(fā)展。例如,溶酶體靶向嵌合體(Lysosome targeting chimera, LYTAC)是一項近年來受到關(guān)注的TPD策略,可以高效將細胞外蛋白或膜蛋白轉(zhuǎn)運到溶酶體中進行降解。今年,

Advanced Materials
的一項研究介紹了一種新型的LYTAC納米平臺(NLTC)。NLTC是一種具有功能表面的聚合物納米膠囊,可以在單個蛋白表面整合蛋白靶向配體、溶酶體靶向配體制備,有效降解特定細胞外蛋白和膜相關(guān)蛋白。根據(jù)臨床前模型結(jié)果,NLTC能有效降解腫瘤細胞表面免疫檢查點并緩解腫瘤免疫抑制性微環(huán)境,抑制惡性腫瘤的生長、復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移。


Nature Chemical Biology
的一項研究展示了一種基于自噬機制的細胞膜蛋白靶向降解技術(shù)——AUTAB(autophagy-inducing antibody)。該技術(shù)通過將細胞自噬誘導(dǎo)分子與細胞膜蛋白靶點抗體進行共價偶聯(lián),可以在不依賴額外細胞表面蛋白的情況下,精確觸發(fā)靶點蛋白通過自噬-溶酶體路徑降解。實驗中,AUTAB在多種細胞類型中均可實現(xiàn)靶蛋白的降解,并且僅需極低濃度就能發(fā)揮作用

今年4月,

Angew
雜志還展示了一種膜結(jié)合型胞內(nèi)E3泛素連接酶靶向嵌合體(MembTAC)技術(shù)。與PROTAC需要進入胞內(nèi)發(fā)揮作用不同,MembTAC無需細胞跨膜遞送過程,也能有效利用細胞內(nèi)E3泛素連接酶實現(xiàn)對腫瘤細胞膜蛋白的降解。這一策略可以進一步提升降解效率并減少副作用。這些新類型技術(shù)都展示了TPD領(lǐng)域在腫瘤治療領(lǐng)域的巨大應(yīng)用前景。


作為賦能全球靶向蛋白降解藥物開發(fā)的重要平臺之一,藥明康德早在此類藥物的浪潮剛剛興起之際,就快速搭建了綜合性的賦能平臺。藥明康德一體化平臺的能力不但涵蓋PROTAC,還包括分子膠、以及多種新興雙功能性蛋白降解劑類型。例如,誘導(dǎo)細胞外或細胞膜蛋白進入溶酶體進行降解的溶酶體靶向嵌合體(LYTAC),將抗體與蛋白降解劑偶聯(lián)產(chǎn)生的蛋白降解劑-抗體偶聯(lián)藥物(DAC),誘導(dǎo)靶蛋白被自噬體吞噬降解的自噬靶向嵌合小分子(AUTAC),以及靶向降解特定RNA的核糖核酸酶靶向嵌合體(RIBOTAC)等。

展望未來,藥明康德將繼續(xù)秉持“讓天下沒有難做的藥,難治的病”的愿景,依托全球研發(fā)基地與生產(chǎn)網(wǎng)絡(luò),以獨特的一體化、端到端的CRDMO模式,助力靶向蛋白降解劑的開發(fā),幫助合作伙伴將科學創(chuàng)新轉(zhuǎn)化為惠及全球患者的變革性藥物。

參考資料:

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