1945年12月，方強(qiáng)被任命為合江軍區(qū)司令，奔赴后方剿匪，擴(kuò)編武裝力量。

當(dāng)時(shí)的合江地區(qū)，匪患猖獗，而軍區(qū)部隊(duì)只有一支800人的新部隊(duì)，戰(zhàn)斗經(jīng)驗(yàn)不足。對方強(qiáng)來說是一個(gè)不小挑戰(zhàn)，因?yàn)樗钦こ錾?，抗?zhàn)時(shí)期長期干機(jī)關(guān)，干軍事工作不多。

盡管在后方，可形勢非常嚴(yán)峻。轄區(qū)有四大土匪，大小匪徒2萬多人。要想完成剿匪任務(wù)，需要擴(kuò)編部隊(duì)，省委通過他提交的作戰(zhàn)報(bào)告，用6個(gè)月從被動(dòng)轉(zhuǎn)為主動(dòng)。如何剿匪，如何擴(kuò)軍，采取招兵買馬和整編、改造一些所謂投誠武裝為主，目的是快速拉起隊(duì)伍與土匪較量。

在實(shí)際戰(zhàn)斗中，部隊(duì)成分復(fù)雜，出現(xiàn)過叛變現(xiàn)象，導(dǎo)致出現(xiàn)過嚴(yán)重問題。但也做出過成績，8個(gè)月殲滅土匪7600余人，擴(kuò)編9000余人，

從形勢上并沒有完全轉(zhuǎn)變敵我態(tài)勢。東北全局來看，前線的局勢不樂觀，因?yàn)樗钠奖Ｐl(wèi)戰(zhàn)失利，敵人占領(lǐng)四平，部隊(duì)撤出戰(zhàn)斗休整補(bǔ)充。后方不穩(wěn)定，不能給前線強(qiáng)有力的保障，因此上級調(diào)一些將領(lǐng)到后方剿匪，方強(qiáng)從合江軍區(qū)司令改為政委，葉長庚從黑龍江軍區(qū)司令改為副司令。

在方強(qiáng)擔(dān)任政委時(shí)，可不是簡單改動(dòng)職務(wù)，而是受到過批判，有人說他右傾路線，主要認(rèn)為他在擴(kuò)軍方式有問題，使得有人中途叛變導(dǎo)致剿匪受到影響。實(shí)際上，在當(dāng)時(shí)的擴(kuò)軍方式在其他軍區(qū)也用，也出現(xiàn)過他們所出現(xiàn)過的情況，并不能說他有問題。

但是在新司令的率領(lǐng)下，調(diào)整剿匪戰(zhàn)術(shù)和剿匪政策以及擴(kuò)軍方式，從1945年8月到1947年2月，半年時(shí)間將四大土匪徹底消滅。

1947年2月，上級將他與賀晉年調(diào)離，準(zhǔn)備讓方強(qiáng)擔(dān)任1縱副司令，先在野戰(zhàn)部隊(duì)歷練一下，然后獨(dú)當(dāng)一面?？伤敢獾揭恢乱恍┑讲筷?duì)，擔(dān)任軍事主官。側(cè)面來看，希望在軍事上有所見長。總部首長得知他的想法，安排擔(dān)任東滿獨(dú)立師師長。

獨(dú)立師屬于地方武裝，一般情況下都是區(qū)域作戰(zhàn)，作戰(zhàn)任務(wù)不大，有時(shí)候會配合野戰(zhàn)主力作戰(zhàn)，也都是打援或者打助攻。這非常適合方強(qiáng)，讓他與部隊(duì)相互成長，而且戰(zhàn)斗從小規(guī)模開始。

1947年6月夏季攻勢中，為奪取中小城市，打通南北滿的聯(lián)系，7個(gè)主力師打四平，其他部隊(duì)重兵包圍長春時(shí)，東滿獨(dú)立師參加德惠攻堅(jiān)戰(zhàn)，牽制敵人。2月份4個(gè)師打過德惠，因?yàn)楦鞣N原因沒有取得預(yù)定目標(biāo)。這次繼續(xù)打，方強(qiáng)提出作戰(zhàn)方案，上級同意。

經(jīng)過兩小時(shí)的激戰(zhàn)，殲滅敵人一個(gè)團(tuán)1800余人，獲得大量武器裝備?？偛渴组L發(fā)電嘉獎(jiǎng)：指揮靈活，英勇善戰(zhàn)。

他這一次的戰(zhàn)斗勝利，證明了自己的軍事水平得到認(rèn)可。

當(dāng)夏季攻勢結(jié)束后，部隊(duì)進(jìn)入休整。8月準(zhǔn)備發(fā)起秋季攻勢時(shí)，組建10縱，將東滿獨(dú)立師改為10縱30師，并擔(dān)任師長。

從資歷和過去職務(wù)來說，當(dāng)獨(dú)立師師長，30師師長都是降職使用，過去人家是合江軍區(qū)司令、政委，相當(dāng)于野戰(zhàn)軍縱隊(duì)司令、政委級別。如今當(dāng)?shù)綆熼L的位置上歷練，在夏季攻勢和秋季攻勢中積累經(jīng)驗(yàn)，為1948年遼沈戰(zhàn)役大規(guī)模兵團(tuán)作戰(zhàn)準(zhǔn)備。

遼沈戰(zhàn)役后，他也得到提拔，擔(dān)任副軍長、軍長，南下中南時(shí)擔(dān)任44軍軍長獨(dú)當(dāng)一面。