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從“創(chuàng)制”到“創(chuàng)智”,看高性能計算如何提速綠色農(nóng)藥創(chuàng)新發(fā)展?

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在現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,農(nóng)藥的使用對于保障作物生長、提高產(chǎn)量和品質(zhì)具有不可或缺的作用。數(shù)據(jù)顯示,使用農(nóng)藥每年可為全球農(nóng)作物挽回三到四成的產(chǎn)量損失;而在中國,使用農(nóng)藥每年挽回的產(chǎn)量損失更是超2800億斤。

當前,對人類健康安全無害,對環(huán)境友好,超低用量,具有高選擇性,以及通過綠色工藝流程生產(chǎn)出來的綠色農(nóng)藥既是現(xiàn)代農(nóng)業(yè)“提質(zhì)增效”的關(guān)鍵之舉,也是建設農(nóng)業(yè)科技強國、保障糧食安全的戰(zhàn)略舉措。

但也要看到,綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制是國際公認的重大科技難題,涉及廣泛學科交叉,往往需合成大量化合物,并需要歷經(jīng)多年驗證,成本高昂且風險巨大。也正因此,將高性能計算、大數(shù)據(jù)以及人工智能等新興技術(shù)應用于綠色農(nóng)藥創(chuàng)制研究,提高綠色農(nóng)藥創(chuàng)制效率,已成為重要的發(fā)展趨勢。

在此背景之下,華中師范大學綠色農(nóng)藥全國重點實驗室聯(lián)合武漢人工智能計算中心、華為,開發(fā)出的全球首款軟硬件全棧創(chuàng)新領(lǐng)先的農(nóng)藥分子設計“神農(nóng)”一體機,為農(nóng)藥創(chuàng)制人員提供了強大的算力和算法支持,無疑就具有重要而深遠的價值。

01.

綠色農(nóng)藥亟待高質(zhì)量發(fā)展

作為農(nóng)藥生產(chǎn)、使用、出口大國,中國農(nóng)藥創(chuàng)制經(jīng)歷了“低效高毒-高效高毒-高效低毒-綠色農(nóng)藥”的發(fā)展過程,整體能力不斷增強,產(chǎn)品結(jié)構(gòu)明顯優(yōu)化,在“保供給、保安全、保生態(tài)”方面發(fā)揮了不可替代的價值和作用。

但隨著重大病蟲害呈多發(fā)重發(fā)態(tài)勢,防控任務加重,加之林草、衛(wèi)生等領(lǐng)域需求的增加,以及當前人民對美好生活的向往需要提供安全多樣的農(nóng)產(chǎn)品,都對農(nóng)藥產(chǎn)業(yè)綠色高質(zhì)量發(fā)展以及綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制提出了更高要求。

可以看到,近年來,國家高度重視農(nóng)藥科技創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)發(fā)展,特別是在國家發(fā)布的《“十四五”全國農(nóng)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃》中,就明確提出要“加強農(nóng)藥產(chǎn)業(yè)關(guān)鍵核心技術(shù)攻關(guān),通過優(yōu)化協(xié)同創(chuàng)新路徑,加大優(yōu)勢科研資源整合,推進產(chǎn)學研深度融合,提升我國農(nóng)藥產(chǎn)業(yè)原始創(chuàng)新、協(xié)同創(chuàng)新和集成創(chuàng)新能力。”

與此同時,綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制一直是國際公認的重大科技難題,這是一項非常復雜、多學科集成的系統(tǒng)工程,平均耗資巨大,且耗時長。數(shù)據(jù)顯示,由于農(nóng)藥登記要求的變化以及對農(nóng)藥性能要求的不斷提高,現(xiàn)在成功開發(fā)一個新農(nóng)藥,需要合成篩選約15.9萬個化合物,耗資超過3億美元,從首次合成到上市平均歷時11.3年。

近些年,隨著高性能計算和人工智能輔助藥物分子設計技術(shù)的持續(xù)創(chuàng)新,則為綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制以及產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展帶來了“彎道超車”的機會。例如,人工智能輔助的綠色農(nóng)藥研發(fā),可以其精準的數(shù)據(jù)分析能力,對農(nóng)藥成分、作用機理以及環(huán)境影響進行深入挖掘。通過機器學習算法,篩選出高效且低毒的化合物,同時評估其生態(tài)兼容性,確保新農(nóng)藥的環(huán)境友好性。這種由數(shù)據(jù)驅(qū)動的研發(fā)模式,不僅縮短了農(nóng)藥從實驗室到田間的時間,還大大提高了研發(fā)的成功率。

不僅如此,隨著AI技術(shù)的發(fā)展,其還能夠根據(jù)不同地區(qū)的氣候、作物種植習慣以及害蟲發(fā)生規(guī)律,智能化推薦最適宜的農(nóng)藥品種和施用時機。這種定制化的農(nóng)藥使用策略,能夠在保證防效的同時,最大程度減少農(nóng)藥的使用量,減輕對環(huán)境的負擔;此外,人工智能還在農(nóng)藥的風險評估與監(jiān)控中發(fā)揮重要作用。通過對農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量、土壤和水體等環(huán)境因素的實時監(jiān)測,AI能夠及時預警可能的風險,并指導農(nóng)戶進行科學施藥,保障農(nóng)產(chǎn)品的安全與健康。

由此可見,通過引入包括高性能計算和人工智能在內(nèi)的新技術(shù),持續(xù)提升綠色農(nóng)藥創(chuàng)新研究水平,推動國家農(nóng)藥產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展和綠色新質(zhì)生產(chǎn)力的打造可以說不僅是“趨勢所在”,更是“迫在眉睫”。

02.

智慧平臺建設“創(chuàng)新先行”

在這方面,華中師范大學綠色農(nóng)藥全國重點實驗室可謂“一馬當先”, 其團隊一直致力于用人工智能等新興技術(shù)輔助綠色農(nóng)藥分子設計,不僅率先建立了人工智能輔助的類農(nóng)藥性預測模型,打造了全球首個基于高性能計算與人工智能驅(qū)動的綠色農(nóng)藥分子設計專用軟件技術(shù)平臺Pesticide Discovery AI(PDAI)。

PADI軟件涵蓋了靶標發(fā)現(xiàn)、苗頭產(chǎn)生、從苗頭到先導、先導優(yōu)化、候選化合物選擇、毒性預測、抗性預測等多個農(nóng)藥創(chuàng)制的關(guān)鍵環(huán)節(jié),同時還整合了人工智能輔助的原創(chuàng)性分子靶標發(fā)現(xiàn)新算法、人工智能輔助的原創(chuàng)性先導結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)新算法、人工智能輔助的類農(nóng)藥性分析新算法、人工智能輔助的農(nóng)藥代謝行為及環(huán)境毒理學性質(zhì)預測算法等,在人工智能技術(shù)的加持之下,該平臺能夠大幅減少需要合成篩選化合物數(shù)量,大幅降低研發(fā)資金投入,大幅縮短研發(fā)周期,同時顯著提高研發(fā)效率和成功率,助力發(fā)現(xiàn)高效、安全、經(jīng)濟的綠色農(nóng)藥先導化合物,推動綠色農(nóng)藥創(chuàng)制技術(shù)的變革。

在此基礎(chǔ)上,華中師范大學綠色農(nóng)藥全國重點實驗室還與武漢人工智能計算中心、華為技術(shù)有限公司共同開展合作,并基于鯤鵬CPU、歐拉操作系統(tǒng)等芯片和操作系統(tǒng)等“根”技術(shù)進行聯(lián)合創(chuàng)新,開發(fā)了全球首款軟硬件全棧創(chuàng)新領(lǐng)先的農(nóng)藥分子設計“神農(nóng)”一體機,使得以往研發(fā)平均需要11.3年的時間,縮短到的現(xiàn)在只需1到3年。

該一體機采用鯤鵬服務器做計算、存儲與管理,中間通過高速網(wǎng)絡互聯(lián),能夠提供計算、存儲可彈性擴展靈活架構(gòu),幫助用戶獲取極致有效算力,同時基于全棧軟硬件的深度優(yōu)化也使得搭載在“神農(nóng)”一體機之上的PDAI平臺能夠應對復雜的農(nóng)藥分子設計任務時更好發(fā)揮性能潛力,真正為農(nóng)藥創(chuàng)制人員提供強大的算力和算法支持。

據(jù)了解,“神農(nóng)”一體機在近期多個農(nóng)藥技術(shù)創(chuàng)新會議上展示,就引起了參會者的強烈關(guān)注,未來也將面向全國農(nóng)藥企業(yè)、科研院所進行推廣,實現(xiàn)聯(lián)合創(chuàng)新、產(chǎn)業(yè)成果轉(zhuǎn)化?梢哉f,它的成功研發(fā)和推出,為未來綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制提供了極具借鑒和參考的新價值。

一方面,基于高性能計算和人工智能輔助藥物分子設計技術(shù),持續(xù)創(chuàng)新綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制,將為破解綠色農(nóng)藥創(chuàng)制這一國際公認的重大科技難題提供“新路徑”,為未來綠色農(nóng)藥的創(chuàng)制和發(fā)展提供更多的想象力和創(chuàng)造力。

另一方面,借助鯤鵬CPU、歐拉操作系統(tǒng)等“根”技術(shù)打造的全棧創(chuàng)新領(lǐng)先的一體機,則為突破綠色農(nóng)藥分子設計中所面臨的“卡脖子”技術(shù)提供了“新選擇”,為我國實現(xiàn)高水平的農(nóng)業(yè)科技自立自強提供了關(guān)鍵技術(shù)支撐。

全球首款軟硬件全棧創(chuàng)新領(lǐng)先的農(nóng)藥分子設計“神農(nóng)”一體機的成功推出,背后同樣也是學科交叉協(xié)同創(chuàng)新的重要體現(xiàn),也是強強聯(lián)合創(chuàng)新突破“卡脖子”技術(shù)難題的“標桿”案例,相信未來在各方的共同努力下,高性能計算和人工智能輔助藥物分子設計技術(shù),也將在新時代綠色農(nóng)藥創(chuàng)制的過程中“大展拳腳”,持續(xù)推動綠色農(nóng)藥產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展再創(chuàng)“新篇章”。

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