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登上Nature:中國(guó)團(tuán)隊(duì)新型堿基編輯療法,成功治療β-地中海貧血,5名患者擺脫輸血依賴

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撰文丨王聰

編輯丨王多魚(yú)

排版丨水成文

2026 年 4 月 8 日,國(guó)際頂尖學(xué)術(shù)期刊Nature在線發(fā)表了正序生物與廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院、上??萍即髮W(xué)、復(fù)旦大學(xué)、上海臨床研究中心合作臨床完成(上海科技大學(xué)陳佳教授、廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院賴永榕教授、復(fù)旦大學(xué)楊力教授、正序生物牟曉盾博士為論文共同通訊作者)的研究成果,論文題為:Clinical application of base editing for treating β-thalassaemia。

該研究利用了基于團(tuán)隊(duì)自主開(kāi)發(fā)的變形式堿基編輯器(transformer Base Editor,tBE)的堿基編輯療法 CS-101治療β-地中海貧血患者的 IIT 臨床試驗(yàn)結(jié)果,5 名輸血依賴型 β-地貧患者在接受單次治療后,造血功能快速重建,總血紅蛋白和 HbF 水平迅速提升且持續(xù)高水平表達(dá),迅速擺脫輸血依賴。

據(jù)悉,這是中國(guó)基因編輯藥物管線臨床結(jié)果首次發(fā)表在Nature正刊,也是中國(guó)地貧領(lǐng)域臨床研究首次發(fā)表于Nature正刊。


地中海貧血:全球性遺傳疾病挑戰(zhàn)

β-地中海貧血是一種常見(jiàn)的單基因遺傳疾病,全球每年有超過(guò) 4 萬(wàn)名兒童患病。這種疾病由于β-珠蛋白合成減少或缺失,導(dǎo)致α/非α珠蛋白鏈?zhǔn)Ш?,過(guò)量的 α-珠蛋白鏈形成毒性聚集體,引發(fā)貧血、無(wú)效紅細(xì)胞生成以及鐵代謝紊亂。

對(duì)于重度患者,特別是輸血依賴型 β-地中海貧血(TDT),終身定期輸血是維持生命的唯一選擇。傳統(tǒng)治療方法包括定期紅細(xì)胞輸注和鐵螯合治療,但這些方法無(wú)法根治疾病,且長(zhǎng)期輸血會(huì)導(dǎo)致鐵過(guò)載等嚴(yán)重并發(fā)癥。

異基因造血干細(xì)胞移植,雖然是一種潛在的治愈方法,但面臨供體匹配困難、移植物抗宿主病以及移植相關(guān)死亡風(fēng)險(xiǎn)等挑戰(zhàn)。

基因編輯:從“可編輯”到“安全精準(zhǔn)編輯”

以 CRISPR 為代表的基因編輯技術(shù)為遺傳疾病的治療帶來(lái)了革命性希望。此前,研究人員已經(jīng)嘗試使用 CRISPR-Cas9 技術(shù)編輯 BCL11A 的紅系增強(qiáng)子區(qū)域,通過(guò)重新激活 γ-珠蛋白基因的表達(dá)來(lái)治療 β-地中海貧血。該療法已獲得 FDA批準(zhǔn)用于治療 12 歲及以上伴有復(fù)發(fā)性血管閉塞危象的鐮狀細(xì)胞病(SCD)和輸血依賴型β-地中海貧血(TDT)。

然而,CRISPR-Cas9 技術(shù)會(huì)產(chǎn)生 DNA 雙鏈斷裂,這會(huì)觸發(fā) p53 依賴的 DNA 損傷反應(yīng),導(dǎo)致細(xì)胞周期停滯和凋亡,并存在染色體異常甚至致癌風(fēng)險(xiǎn)。

上??萍即髮W(xué)陳佳教授團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的變形式堿基編輯器(tBE)屬于下一代基因編輯技術(shù)。它通過(guò)巧妙的“鎖-鑰匙”設(shè)計(jì),從根本上避免了 CRISPR-Cas9 技術(shù)導(dǎo)致的 DNA 雙鏈斷裂及脫靶風(fēng)險(xiǎn),實(shí)現(xiàn)了從“可編輯”到“安全、精準(zhǔn)編輯”的跨越。

tBE技術(shù)原理:精準(zhǔn)靶向BCL11A結(jié)合基序

tBE 技術(shù)的核心在于精準(zhǔn)編輯 HBG1 和 HBG2 啟動(dòng)子區(qū)域中的 BCL11A 結(jié)合基序。BCL11A 是成人期 γ-珠蛋白基因的主要轉(zhuǎn)錄抑制因子,而 γ-珠蛋白是胎兒血紅蛋白(HbF)的組成部分。

在胎兒期,HbF 是主要的血紅蛋白類型,但出生后逐漸被成人血紅蛋白(HbA)取代。通過(guò)編輯 BCL11A 結(jié)合基序,tBE 能夠破壞 BCL11A 的結(jié)合,重新激活 γ-珠蛋白表達(dá),從而增加 HbF 水平。

tBE 系統(tǒng)采用雙 sgRNA 設(shè)計(jì):一個(gè)輔助 sgRNA(hsgHBG-MS2)和一個(gè)主 sgRNA(msgHBG-boxB)。只有當(dāng)兩個(gè) sgRNA 在靶點(diǎn)位置共定位時(shí),脫氨酶抑制劑才會(huì)被切割,激活脫氨酶活性,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的 C-to-T 堿基編輯。這種設(shè)計(jì)確保了編輯的特異性,只有在靶點(diǎn)位置才會(huì)發(fā)生編輯,其他地方脫氨酶活性被抑制,從而避免了脫靶突變。


臨床試驗(yàn)結(jié)果:5 名患者全部擺脫輸血

這項(xiàng)臨床試驗(yàn)納入了 5 名重度輸血依賴型 β-地中海貧血患者,患者的中位年齡為 18.8 歲,其中 3 名男性,2 名女性,患者基因型包括 β0/β0、β0/β0-like 和 β0/β+。

治療過(guò)程包括采集患者自體的 CD34+ 造血干細(xì)胞,使用 tBE 進(jìn)行體外堿基編輯,然后回輸給經(jīng)過(guò)白消安清髓預(yù)處理的患者,中位隨訪時(shí)間為 23.0 個(gè)月。

臨床治療效果驚人:所有 5 名患者(100%)均停止了紅細(xì)胞輸注,平均最后一次輸血時(shí)間為 CS-101 輸注后 16 天。所有患者均達(dá)到了主要終點(diǎn)——輸注后 3 個(gè)月起的 6 個(gè)月輸血獨(dú)立。

更令人振奮的是,所有患者都實(shí)現(xiàn)了長(zhǎng)期輸血獨(dú)立,輸血自由期持續(xù) 15.0-22.9 個(gè)月。

血紅蛋白水平:快速且持續(xù)提升

CS-101 治療后,患者的總血紅蛋白和 HbF 水平迅速提升,輸注后 3 個(gè)月,平均總血紅蛋白濃度為 12.4±1.0 g/dL,平均 HbF 濃度為 11.5±0.9 g/dL。

這些水平在整個(gè)隨訪期間保持相似或更高水平,表明患者的造血重建迅速。值得注意的是,3名 β0/β0 或 β0/β0-like基因型患者幾乎不產(chǎn)生 β-珠蛋白,在實(shí)現(xiàn)輸血獨(dú)立后,他們的 HbF 水平幾乎接近 100%。相比之下,β0/β+ 基因型患者保留了部分 β-珠蛋白產(chǎn)生能力,在輸血獨(dú)立后繼續(xù)合成少量 HbA,因此他們的 HbF 比例未達(dá)到 100%。


安全性與特異性:未檢測(cè)到脫靶編輯

安全性是基因編輯療法的關(guān)鍵考量。在這項(xiàng)研究中,CS-101 的不良事件通常與白消安清髓預(yù)處理和自體造血干細(xì)胞移植一致,未報(bào)告死亡或癌癥發(fā)生。

編輯效率穩(wěn)定:在患者外周血單個(gè)核細(xì)胞中,BCL11A 結(jié)合基序的編輯頻率從第 1 個(gè)月起保持穩(wěn)定,在整個(gè)隨訪期間始終維持在 34% 以上。在骨髓血細(xì)胞中,第 3 個(gè)月的平均堿基編輯頻率為 39.8±7.2%,并在隨訪期間保持穩(wěn)定。

無(wú)脫靶突變:研究團(tuán)隊(duì)使用 Cas-OFFinder、Digenome-seq 和 COSMID 算法鑒定了 145 個(gè)潛在脫靶位點(diǎn)。在所有 5 名患者中,這些位點(diǎn)均未檢測(cè)到脫靶編輯。

這一結(jié)果與傳統(tǒng)的 CRISPR-Cas9 技術(shù)以及堿基編輯器形成鮮明對(duì)比,tBE 不需要產(chǎn)生 DNA 雙鏈斷裂,從而避免了相關(guān)的細(xì)胞毒性和染色體異常風(fēng)險(xiǎn)。其他堿基編輯器,例如 hA3A-BE3、ABE8e 等,雖然在靶點(diǎn)編輯效率和 HbF 誘導(dǎo)方面也很高效,但它們?cè)谀承┪稽c(diǎn)誘導(dǎo)了顯著的脫靶編輯。

未來(lái)展望

總的來(lái)說(shuō),該研究證明了基于tBE開(kāi)發(fā)的堿基編輯療法CS-101注射液展現(xiàn)了出色的療效、安全性以及持久性,效果優(yōu)于其他基因療法,具有顯著的臨床應(yīng)用價(jià)值。CS-101 注射液作為全球首個(gè)且唯一在治療后有兩年以上長(zhǎng)期觀察數(shù)據(jù)的堿基編輯療法,具有成為治療 β-血紅蛋白病的全球 Best-in-Class 基因編輯藥物的潛力。

這項(xiàng)研究標(biāo)志著基因編輯治療 β-地中海貧血的重要進(jìn)展,基于 tBE 的堿基編輯療法不僅展示了良好的安全性和有效性,還為其他遺傳疾病的治療提供了新思路。

據(jù)悉,正序生物目前正在針對(duì)全球多個(gè)國(guó)家的 β-血紅蛋白病患者開(kāi)展臨床治療,并已治愈多位國(guó)內(nèi)外患者。相關(guān)藥物管線 CS-101 除了在進(jìn)行治療 β-地中海貧血的臨床試驗(yàn)外,還在進(jìn)行治療鐮狀細(xì)胞病(SCD)的臨床試驗(yàn)。

值得一提的是,2026 年 4 月 1 日,《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》(NEJM)同期發(fā)表了 3 篇關(guān)于基因編輯治療血紅蛋白病的臨床試驗(yàn)結(jié)果,分別是 CRISPR-Cas12a 基因編輯治療鐮狀細(xì)胞病、CRISPR-Cas12a 基因編輯治療 β-地中海貧血、堿基編輯治療鐮狀細(xì)胞病。

前兩項(xiàng)療法來(lái)自張鋒等人創(chuàng)立的Editas Medicine,第三項(xiàng)療法來(lái)自劉如謙等人創(chuàng)立的Beam Therapeutics。分別代表了 CRISPR-Cas12a 和堿基編輯兩種技術(shù)平臺(tái)的重要進(jìn)展。




這些研究共同推動(dòng)基因編輯技術(shù)向精準(zhǔn)化發(fā)展,為遺傳疾病患者擺脫疾病負(fù)擔(dān)、改善生活質(zhì)量帶來(lái)了新的希望。

論文鏈接

https://doi.org/10.1038/s41586-026-10342-9

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