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《食品科學(xué)》:喬學(xué)義研究員、朱丹曄博士等:結(jié)合機器學(xué)習(xí)算法的食品風(fēng)味分析策略

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嗅覺和味覺是人類重要的感官功能。具體來說,嗅覺感知是指揮發(fā)物質(zhì)刺激鼻腔內(nèi)的嗅覺感受器,這些感受器將化學(xué)信號轉(zhuǎn)化為神經(jīng)沖動,經(jīng)過復(fù)雜的神經(jīng)傳導(dǎo)通路,最終在大腦中產(chǎn)生的氣味感知;味覺則是食物中的化學(xué)物質(zhì)與口腔內(nèi)的感受器作用,引發(fā)神經(jīng)信號傳導(dǎo),在大腦中形成的味道感受。嗅覺與味覺相互配合構(gòu)成“風(fēng)味”這一綜合感官體驗。具體而言,食物中的香氣由醇類、酯類、酚類和萜類等多種揮發(fā)芳香物相互作用產(chǎn)生,味道包括酸、甜、苦、咸、鮮5 種基本味道,其賦予了食品獨特的特征,是人們評判食品質(zhì)量的關(guān)鍵因素。

食品風(fēng)味研究經(jīng)歷了4 個發(fā)展階段。最初,主要依賴于人的主觀感官評價,需要專業(yè)的人工小組通過感官器官對食物中指標(biāo)和特征進(jìn)行分析。這種方式雖然直接,但評價標(biāo)準(zhǔn)難以統(tǒng)一、易受個體差異影響;隨后進(jìn)入風(fēng)味組學(xué)儀器分析階段。影響食品風(fēng)味的關(guān)鍵在于食物中氣味和味道相關(guān)化學(xué)成分,這些物質(zhì)的測定依賴于儀器,由于測定手段或風(fēng)味物質(zhì)數(shù)據(jù)信息的不同,引入了風(fēng)味組學(xué)的概念,其在代謝組學(xué)基礎(chǔ)上發(fā)展起來,其目的是通過結(jié)合化學(xué)分析技術(shù)和生物信息學(xué)的方法在化學(xué)分子水平上全面的描述風(fēng)味。借助儀器分析能夠精準(zhǔn)地檢測食品中的成分,然而卻難以完全反映出消費者對風(fēng)味的整體感受;接著,感官評價與儀器分析結(jié)合的方法應(yīng)運而生,試圖彌補兩者單獨使用時的不足,該方法能更全面地了解食品風(fēng)味化學(xué)成分與感官體驗之間的關(guān)系,有助于闡明食品風(fēng)味的形成機制;現(xiàn)今,隨著人工智能的興起,食品風(fēng)味研究邁入基于機器學(xué)習(xí)(ML)的智能化分析階段。目前結(jié)合ML算法已經(jīng)實現(xiàn)基于儀器分析對食物進(jìn)行有效風(fēng)味測試,涵蓋基于分子特性感知氣味、消費者對食物的偏好分析、合成風(fēng)味分子、篩選關(guān)鍵風(fēng)味物質(zhì)等相關(guān)研究以及利用數(shù)據(jù)庫進(jìn)行分子味道和氣味的預(yù)測。ML在食品風(fēng)味發(fā)展中具有顯著優(yōu)勢,能從大量復(fù)雜、高維度數(shù)據(jù)中自動學(xué)習(xí)和識別潛在的模式規(guī)律,研究人員可以借助ML深入探討分子與風(fēng)味之間的復(fù)雜關(guān)系。ML還具有良好的適應(yīng)性和擴展性,可以根據(jù)不同的分子數(shù)據(jù)和實現(xiàn)目標(biāo)進(jìn)行調(diào)整,使得它在分子層面的研究發(fā)揮出重要作用。

中國煙草總公司鄭州煙草研究院的張超、朱丹曄*、喬學(xué)義*等將綜述食品風(fēng)味分析中所涉及到的ML算法以及研究食品風(fēng)味的策略性問題,旨在突出ML在食品風(fēng)味研究中的重要作用以及研究食品風(fēng)味的重要方法,為未來生產(chǎn)高品質(zhì)食品提供技術(shù)保障。


01

食品風(fēng)味研究中的常見MMLL算法

作為人工智能的細(xì)分領(lǐng)域,ML技術(shù)快速發(fā)展,在食品風(fēng)味分析中的融合逐漸受到關(guān)注,ML通過從大量風(fēng)味數(shù)據(jù)中自動學(xué)習(xí)模式和規(guī)律,提供更高效、準(zhǔn)確的分析結(jié)果。ML在食品風(fēng)味研究中常見方法見圖1,可大致劃分為3 個子類型:有監(jiān)督算法、無監(jiān)督算法和深度學(xué)習(xí)算法。有監(jiān)督算法是利用模型從標(biāo)記的訓(xùn)練數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí),每個訓(xùn)練樣本均包括輸入和期望的輸出,目標(biāo)是學(xué)習(xí)出一個映射函數(shù),使其能夠?qū)π碌摹⑽匆娺^的數(shù)據(jù)作出準(zhǔn)確的預(yù)測;而在無監(jiān)督學(xué)習(xí)中,模型處理的是未標(biāo)記的數(shù)據(jù),即沒有明確的輸出標(biāo)簽,目標(biāo)是發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的隱藏結(jié)構(gòu)或模式;深度學(xué)習(xí)是基于具有深層結(jié)構(gòu)的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法,是ML近年來出現(xiàn)的新型分支,逐漸成為ML中的主流。以下將逐一介紹這些所用算法的原理、優(yōu)缺點和風(fēng)味分析實例。


1.1 有監(jiān)督算法

傳統(tǒng)統(tǒng)計方法起源于統(tǒng)計學(xué),通過統(tǒng)計推斷揭示變量間的因果關(guān)系或概率分布規(guī)律,更加側(cè)重數(shù)學(xué)模型的理論解釋,適用于小樣本分析。線性回歸和邏輯回歸是使用線性方程描述變量的相關(guān)性以進(jìn)行預(yù)測、相關(guān)性分析,該方法適用于擬合線性關(guān)系,對復(fù)雜非線性數(shù)據(jù)擬合能力有限。判別分析(DA)通過建立判別函數(shù)f,判定樣品x屬于的類別y,用于預(yù)測分類,同樣該方法不適用非線性數(shù)據(jù)且對噪聲敏感。PLS是用于處理高維數(shù)據(jù)的多變量統(tǒng)計分析方法,特別適用于自變量和因變量之間存在復(fù)雜關(guān)系且自變量存在多重共線性的情況,它通過將數(shù)據(jù)投影到低維空間中,同時考慮自變量和因變量的信息,從而提高模型的預(yù)測能力,是風(fēng)味數(shù)據(jù)統(tǒng)計中應(yīng)用較為廣泛的方法。然而,PLS在處理非線性關(guān)系時也存在一定的局限性,預(yù)測過程的準(zhǔn)確性不如其他模型,尤其是應(yīng)對復(fù)雜數(shù)據(jù)時,在具體進(jìn)行風(fēng)味分析時可通過交叉驗證的方法優(yōu)化模型性能。

經(jīng)典ML算法是ML領(lǐng)域的核心方法,主要代表包括SVM、KNN、決策樹(DT)和ELM,側(cè)重于從數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)規(guī)律,依賴優(yōu)化算法,常用于分類和回歸任務(wù),它們更注重模型的預(yù)測準(zhǔn)確性和泛化能力,不具備傳統(tǒng)統(tǒng)計方法的強解釋性。

SVM是一種經(jīng)典的監(jiān)督學(xué)習(xí)算法,廣泛應(yīng)用于分類和回歸。SVM的核心思想是通過尋找一個最優(yōu)超平面,將不同類別的數(shù)據(jù)點分隔開,同時最大化類別之間的間隔,如圖2a所示。具體來說,SVM的原理包括以下3 個關(guān)鍵點:1)SVM通過最大化類別之間的幾何間隔提高模型的泛化能力;2)對于非線性可分的數(shù)據(jù),SVM通過核函數(shù)Φ(x)將數(shù)據(jù)映射到高維空間,使其在高維空間中線性可分;3)軟間隔與松弛變量:為了處理線性不可分的數(shù)據(jù),SVM引入松弛變量,允許一定程度的誤分類,從而在分類精度和泛化能力之間取得平衡。Wang Hongmei等開發(fā)的基于傳感器和SVM結(jié)合的方法能夠快速、準(zhǔn)確地評估牛肉風(fēng)味屬性,使用PCA處理數(shù)據(jù)并建立SVM模型,分類準(zhǔn)確率達(dá)到90%。盡管SVM可處理高維數(shù)據(jù),但模型參數(shù)和核函數(shù)的選擇需要根據(jù)對應(yīng)的風(fēng)味實驗調(diào)整到最佳結(jié)果;對于多種類的風(fēng)味物質(zhì)區(qū)分問題增加了模型拓展使用的復(fù)雜性;不擅長解決數(shù)據(jù)缺失問題;在處理大規(guī)模數(shù)據(jù)時,訓(xùn)練時間較長,計算開銷較大。











KNN根據(jù)樣本之間的相似度來進(jìn)行預(yù)測,可用于分類和回歸,如圖2b所示。在分類任務(wù)中,KNN會在訓(xùn)練數(shù)據(jù)集中找到與待測樣本距離最近的k 個樣本,然后根據(jù)這k 個樣本所屬的類別進(jìn)行投票,得票最多的類別即為待測樣本的類別;在回歸任務(wù)中,KNN同樣會找到與待測樣本距離最近的k 個樣本,然后將這k 個樣本的目標(biāo)值進(jìn)行平均,得到的平均值就是待測樣本的預(yù)測值。KNN只需存儲訓(xùn)練數(shù)據(jù)集和計算距離,無需訓(xùn)練過程,對數(shù)據(jù)分布無要求且可以很自然地處理多分類問題。Wu Xiaohong等利用電子鼻結(jié)合PCA以及KNN成功識別了中國白酒的種類,結(jié)果表明KNN在處理經(jīng)過PCA提取的特征后表現(xiàn)更高的白酒分類性能。但算法中k值的選擇對KNN的性能影響很大,易出現(xiàn)分類邊界模糊的問題,可以結(jié)合交叉驗證優(yōu)化k值和距離度量提高分類準(zhǔn)度。

DT能模擬人類決策過程,通過構(gòu)建樹形結(jié)構(gòu)進(jìn)行分類或回歸,其內(nèi)部每個節(jié)點代表一個屬性上的測試,分支代表測試輸出,葉節(jié)點代表類別或值。構(gòu)建DT時,會根據(jù)信息增益、基尼指數(shù)等準(zhǔn)則選擇最優(yōu)劃分屬性,將數(shù)據(jù)集不斷分割成更小的子集,直到滿足停止條件。DT直觀易懂,可解釋性強,能處理多類型的數(shù)據(jù)。Dagan-Wiener等利用DT開發(fā)一個基于化學(xué)結(jié)構(gòu)預(yù)測化合物是否具有苦味的工具BitterPredict,能夠快速提取和分類大量化合物。但當(dāng)DT結(jié)構(gòu)的過深時易發(fā)生過擬合,影響分類結(jié)果。

ELM是一種用于單隱層前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練算法,其隨機初始化輸入層到隱藏層的權(quán)重和偏置,通過最小二乘法直接計算隱藏層到輸出層的權(quán)重,提高訓(xùn)練速度。Men Hong等通過電子舌和電子鼻獲取啤酒的味覺和嗅覺信息,利用多傳感器數(shù)據(jù)融合技術(shù),挖掘影響啤酒風(fēng)味的關(guān)鍵特征變量,使用ELM、SVM、RF實現(xiàn)對啤酒風(fēng)味的高效、準(zhǔn)確分類。ELM、SVM、RF分類準(zhǔn)確率分別達(dá)到98.33%、96.67%、94.44%;ELM與SVM和RF相比,在某些情況下能達(dá)到更高的分類準(zhǔn)確率,這表明ELM在處理啤酒風(fēng)味分類問題時具有獨特的優(yōu)勢。然而,ELM的性能依賴于隱藏層節(jié)點數(shù)量和核函數(shù)的選擇,且模型的參數(shù)解釋性較弱,在實際應(yīng)用中需要根據(jù)具體風(fēng)味問題進(jìn)行參數(shù)調(diào)整。

集成學(xué)習(xí)算法是通過組合多個基學(xué)習(xí)器(如DT)提升整體模型性能,如減少過擬合和增加魯棒性,實現(xiàn)“群體智慧優(yōu)于個體”,屬于ML的高級策略。集成學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)組件仍屬機器學(xué)習(xí)范疇,預(yù)測結(jié)果依賴于基學(xué)習(xí)器的假設(shè),但集成框架本身是元方法,可處理高維數(shù)據(jù),完全面向預(yù)測性能優(yōu)化,相對于經(jīng)典ML算法,有黑盒般的低解釋性。RF是基于DT發(fā)展來的集成算法,如圖2c所示,它通過自助采樣法從原始數(shù)據(jù)集中有放回地抽取多個樣本集,為每個子數(shù)據(jù)集構(gòu)建一棵DT,可形成樹1、樹2,直到樹n,最終綜合所有DT的結(jié)果進(jìn)行預(yù)測,在分類問題中采用投票法,回歸問題中采用平均值法。Li Qiang等利用基于石英晶體微天平的電子鼻結(jié)合RF分類器,能夠識別中國不同白酒的風(fēng)味,表明RF通過集成多個DT,可有效區(qū)分白酒類別。梯度提升決策樹(GBDT)是一種迭代的DT集成算法,通過迭代訓(xùn)練一系列的弱DT,每一棵新的DT都致力于擬合前一輪模型預(yù)測結(jié)果與真實值之間的殘差,使得形成的殘差1、殘差2等依次減小,通過不斷累加這些DT的結(jié)果得到最終模型,如圖2d所示。GBDT能夠自動發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)中的復(fù)雜關(guān)系,對異常值相對魯棒,但訓(xùn)練速度較慢,易受到超參數(shù)影響。而極端梯度提升算法(XGBoost)是對GBDT的擴展,在GBDT的基礎(chǔ)上進(jìn)行了一系列改進(jìn),采用了二階泰勒展開(使用一階導(dǎo)數(shù)g和二階導(dǎo)數(shù)h)近似損失函數(shù)L,使得模型更加精確,同時還引入了正則化項Ω控制模型的復(fù)雜度,防止過擬合。XGBoost結(jié)合了DT的可解釋性和GBDT的擬合能力,在各類ML比較和實際應(yīng)用中都表現(xiàn)出色,在食品風(fēng)味感官分析中已經(jīng)成為很受青睞的算法之一。Armstrong等利用XGBoost結(jié)合化學(xué)成分的光譜數(shù)據(jù)預(yù)測葡萄酒的感官屬性,表明XGBoost能處理復(fù)雜的光譜數(shù)據(jù),并從中學(xué)習(xí)到與感官屬性相關(guān)的特征值。

分析上述算法結(jié)合風(fēng)味研究得出,線性回歸和PLS適用于處理線性關(guān)系較為明顯的風(fēng)味數(shù)據(jù),例如在某些風(fēng)味成分定量分析中,當(dāng)風(fēng)味物質(zhì)的含量與傳感器響應(yīng)信號之間存在近似線性關(guān)系時,可以建立簡單的線性模型進(jìn)行預(yù)測;DA和KNN適用于處理分類問題,尤其是基于特征向量的風(fēng)味類別劃分。SVM對于線性或非線性的風(fēng)味數(shù)據(jù)都能通過選擇合適的核函數(shù)進(jìn)行分類或回歸分析;ELM對于具有一定規(guī)律但樣本量不是特別大的風(fēng)味數(shù)據(jù)能夠快速學(xué)習(xí)并建立映射關(guān)系;DT、RF、GBDT以及XGBoost適合處理具有復(fù)雜非線性關(guān)系和多特征的風(fēng)味數(shù)據(jù),例如在分析影響食品風(fēng)味的多種因素及其相互作用時,這些基于樹的算法可以自動學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)中的規(guī)律分布。ML在食品風(fēng)味分析中具有各種優(yōu)勢,模型的可解釋性較強;對數(shù)據(jù)量要求相對靈活,與深度學(xué)習(xí)相比,ML算法在處理中小規(guī)模數(shù)據(jù)集時能取得很好的效果,這使得ML在一些數(shù)據(jù)獲取相對困難的風(fēng)味研究領(lǐng)域能夠有效應(yīng)用;計算資源消耗較低,無需像深度學(xué)習(xí)需要高性能的GPU計算設(shè)備支持;ML擁有眾多算法,針對不同的風(fēng)味數(shù)據(jù)分析需求,研究者可以選擇合適的算法進(jìn)行定制化應(yīng)用,能夠很好地適應(yīng)各種復(fù)雜多樣的實際問題。但ML也有許多不足之處,例如,特征提取能力有限,往往需要人工提取特征;處理大規(guī)模數(shù)據(jù)時模型性能會受限。

1.2 無監(jiān)督算法

無監(jiān)督算法在數(shù)據(jù)探索和模式發(fā)現(xiàn)方面具有明顯優(yōu)勢,能夠?qū)]有標(biāo)簽的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,但算法的結(jié)果通常較難解釋,可能會因不同的算法或參數(shù)選擇而產(chǎn)生較大差異。盡管如此,這些算法在數(shù)據(jù)預(yù)處理和特征提取中仍發(fā)揮著重要作用。K-means是將數(shù)據(jù)集劃分為預(yù)定義數(shù)量的簇,隨機選擇初始簇中心,然后將每個數(shù)據(jù)點分配到最近的簇中心對應(yīng)的簇中,接著計算每個簇中心內(nèi)所有數(shù)據(jù)點的均值,這一過程不斷重復(fù),直至簇中心不再發(fā)生變化或達(dá)到預(yù)設(shè)的迭代次數(shù),最終結(jié)果是簇內(nèi)數(shù)據(jù)點相似,而不同簇之間的數(shù)據(jù)點不同,如圖2e所示。在研究味覺感知時,采用K-means對受試者按照口味偏好劃分亞群,用于研究不同群體的感官特征,其性能依賴于初始簇中心的選擇和簇數(shù)量K的設(shè)定。HC根據(jù)數(shù)據(jù)點之間的相似性逐級合并最相似的點或簇,形成一個樹狀結(jié)構(gòu),如圖2f所示。Agorastos等根據(jù)啤酒的口感維度,采用HC對啤酒進(jìn)行分級。HC的優(yōu)點在于不需要預(yù)先指定簇的數(shù)量,能夠提供數(shù)據(jù)的層次結(jié)構(gòu)信息,適用于探索性數(shù)據(jù)分析。PCA是一種降維技術(shù),廣泛應(yīng)用于數(shù)據(jù)預(yù)處理、特征提取和數(shù)據(jù)可視化,PCA可對咖啡的揮發(fā)性成分特征提取,從而確定影響感官特征的主要因素。PCA是通過計算原數(shù)據(jù)的協(xié)方差矩陣,并找到一組正交基向量,將數(shù)據(jù)從高維映射到低維空間,使得主成分在PC1、PC2等各坐標(biāo)軸上有效展開,達(dá)到最大化解釋數(shù)據(jù)方差和區(qū)分?jǐn)?shù)據(jù)的目的,如圖2g所示。對于不同產(chǎn)地松茸的風(fēng)味指紋,研究者基于鑒定揮發(fā)性化合物的信號強度進(jìn)行PCA,結(jié)果顯示不同樣本在相對獨立的空間中可以被很好地區(qū)分。自編碼器通過編碼器將輸入數(shù)據(jù)壓縮到一個低維的潛在空間,然后再通過解碼器嘗試重構(gòu)輸入數(shù)據(jù),使得模型能夠?qū)W習(xí)數(shù)據(jù)的內(nèi)在結(jié)構(gòu)。Dibeklio?lu等利用自編碼器將面部表情圖片轉(zhuǎn)化為特征向量,為模型訓(xùn)練提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。自編碼器的多種變體如去噪、卷積自編碼器等在不同場景中均會出現(xiàn)。

1.3 深度學(xué)習(xí)算法

深度學(xué)習(xí)相對于ML算法,能夠自動學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)中的復(fù)雜特征層次,無需人工干預(yù),更能捕捉到隱藏在數(shù)據(jù)中的復(fù)雜模式;在大規(guī)模數(shù)據(jù)訓(xùn)練下也能展現(xiàn)出強大性能,能很好去適應(yīng)一些食品風(fēng)味大數(shù)據(jù);深度學(xué)習(xí)通過構(gòu)建多層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),能夠?qū)W習(xí)到極其復(fù)雜的非線性關(guān)系,對于風(fēng)味數(shù)據(jù)特性交織的復(fù)雜系統(tǒng)可以構(gòu)建強大的模型進(jìn)行準(zhǔn)確描述和預(yù)測;同時深度學(xué)習(xí)可處理多種數(shù)據(jù),例如高維圖像、大規(guī)模文本數(shù)據(jù)、音頻數(shù)據(jù)以及各種變量的時間序列數(shù)據(jù)。

ANN是一種模仿人類神經(jīng)系統(tǒng)中神經(jīng)元相互連接和信息處理方式的ML算法,其中的神經(jīng)元按照不同層次結(jié)構(gòu)排列,通常包含輸入層、隱藏層和輸出層。輸入層接收外界的數(shù)據(jù),將其傳遞給隱藏層,隱藏層由多個神經(jīng)元構(gòu)成,神經(jīng)元之間相互連接并進(jìn)行復(fù)雜的非線性變換,能夠自動從輸入數(shù)據(jù)中提取特征和模式,經(jīng)過隱藏層的處理后,信息再傳遞到輸出層,輸出層給出最終的預(yù)測結(jié)果,如圖2h所示。ANN通過調(diào)整神經(jīng)元之間連接的權(quán)重W學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)中的規(guī)律模式,這個過程通常借助反向傳播(BP)算法實現(xiàn),該算法會根據(jù)輸出結(jié)果與真實值之間的誤差,反向傳播并更新各層連接神經(jīng)元的權(quán)重W,以逐步減小誤差,提高模型的預(yù)測準(zhǔn)確性。ANN具有強大的非線性映射能力,可以處理復(fù)雜的、高度非線性的數(shù)據(jù)關(guān)系。Li Yu等基于理化參數(shù)和閃速氣相色譜-電子鼻的進(jìn)行分析,通過ANN建立分類模型,用于評估不同釀造工藝的醋的質(zhì)量和揮發(fā)性特征。ANN快速識別不同釀造工藝的醋為工業(yè)生產(chǎn)和市場流通中的醋分類提供了技術(shù)支持。

CNN是一種因受到了人類視覺神經(jīng)系統(tǒng)啟發(fā),專門為處理具有網(wǎng)格結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)而設(shè)計的算法,主要由輸入層、卷積層、池化層、全連接層和輸出層構(gòu)成。輸入層接收原始數(shù)據(jù),卷積層利用多個卷積核在輸入數(shù)據(jù)上進(jìn)行滑動卷積操作,各卷積核可提取不同的局部特征且參數(shù)共享機制大大減少了模型參數(shù)量,降低了計算復(fù)雜度;池化層緊跟其后,對卷積層的輸出進(jìn)行下采樣,減少數(shù)據(jù)的維度,同時保留重要特征,常見的池化操作有最大池化和平均池化;經(jīng)過若干個卷積層和池化層的交替處理后,得到的數(shù)據(jù)會被展平并輸入到全連接層,全連接層將前面提取的特征進(jìn)行組合和變換;最后輸出層根據(jù)具體任務(wù)輸出預(yù)測結(jié)果,如圖2i所示。CNN廣泛應(yīng)用于圖像識別、目標(biāo)檢測、語義分割等領(lǐng)域,能有效地處理大規(guī)模的數(shù)據(jù),并且具有較高的準(zhǔn)確率和泛化能力。Wu Danli等提出一種基于CNN的模型,用于通過電子鼻數(shù)據(jù)預(yù)測氣味的愉悅度,簡化氣味評估過程。CNN不僅適用于愉悅度預(yù)測,還可用于新氣味分類和評估,為香水行業(yè)和環(huán)境監(jiān)測提供了參考。

RNN的神經(jīng)元不僅接收當(dāng)前時刻的輸入,還會接收上一時刻自身的輸出,形成一種循環(huán)結(jié)構(gòu),使得它可以對序列中的信息進(jìn)行記憶和傳遞,捕捉到序列數(shù)據(jù)中的時間依賴關(guān)系,這在結(jié)構(gòu)設(shè)計上有別于傳統(tǒng)的前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),在序列數(shù)據(jù)處理中有大量應(yīng)用。但傳統(tǒng)RNN存在梯度消失或梯度爆炸的問題,這使得它在處理長序列數(shù)據(jù)時難以捕捉到較早時刻的信息,導(dǎo)致長距離依賴關(guān)系學(xué)習(xí)能力較弱,為了克服該問題,后來又發(fā)展出了如長短期記憶網(wǎng)絡(luò)(LSTM)和門控循環(huán)單元(GRU)等改進(jìn)的RNN變體,它們通過引入特殊的門控機制,有效地解決了梯度問題,提升了對長序列數(shù)據(jù)的處理能力。Miller等通過LSTM從大量威士忌評論中自動提取描述性術(shù)語,構(gòu)建威士忌的風(fēng)味詞匯表,并探索了在感官科學(xué)中的應(yīng)用。LSTM能夠有效捕捉文本中的信息,準(zhǔn)確區(qū)分出描述性和非描述性術(shù)語,自動提取出的描述性術(shù)語能夠快速構(gòu)建威士忌的風(fēng)味詞匯表,為感官分析提供了新的工具。RNN可以處理大規(guī)模的文本數(shù)據(jù),可擴展到其他食品和飲料領(lǐng)域,幫助研究人員快速分析和比較產(chǎn)品感官屬性。

繼傳統(tǒng)RNN及其變體(LSTM、GRU)之后出現(xiàn)了更加強大的序列數(shù)據(jù)處理模型Transformer,它摒棄了序列逐個處理的方式,引入的自注意力機制和多頭注意力結(jié)構(gòu)能夠高效并行處理序列數(shù)據(jù),捕捉長距離依賴關(guān)系,并借助位置編碼保留序列順序信息,通常采用編碼器-解碼器架構(gòu),具備強大的語義轉(zhuǎn)換能力,適用于多種自然語言處理任務(wù),同時具有高度的可擴展性和靈活性。在呈味肽研究中,Transformer可以處理多肽的氨基酸序列數(shù)據(jù),最終實現(xiàn)多肽生物活性和呈味特性預(yù)測。

02

結(jié)合ML的食品風(fēng)味分析策略

利用ML學(xué)習(xí)進(jìn)行食品風(fēng)味分析可大幅度提高效率,但食品風(fēng)味分析過程中可以側(cè)重點會有所區(qū)別,若是使用具體的某一ML算法進(jìn)行風(fēng)味分析,分析過程可能會更偏向于ML算法的改善工作以達(dá)到更精準(zhǔn)的預(yù)測任務(wù);若是對食品在生活中的使用進(jìn)行敘述,風(fēng)味分析過程就會更偏向于食品對消費者和企業(yè)效益的影響,例如在食品摻假分析中,可用摻入不同比例的非主料食品進(jìn)行風(fēng)味分析,以達(dá)到識別食物真?zhèn)蔚哪康?;在食品風(fēng)味預(yù)測中,可重點研究食品等級、食品風(fēng)味變化、食品地區(qū)劃分等相關(guān)問題。表1舉例了近年來ML基于分子特性的風(fēng)味分析策略主要應(yīng)用,以下將先明確風(fēng)味研究基礎(chǔ)的分析儀器,隨后從分子屬性角度出發(fā)分析食物風(fēng)味,最后還可利用常見風(fēng)味綜合數(shù)據(jù)庫進(jìn)行快捷風(fēng)味特征分析。


2.1 基于儀器基礎(chǔ)的風(fēng)味分析

食品中確切的揮發(fā)風(fēng)味物往往需要通過客觀且精密的儀器分析得到,并結(jié)合ML算法實現(xiàn)有效的食品風(fēng)味測試,從而快速評估食品的屬性。儀器分析是風(fēng)味物質(zhì)誕生的基礎(chǔ)手段,以下將介紹多種常見的輔助風(fēng)味分析的儀器為食品發(fā)展提供可靠的標(biāo)準(zhǔn)基礎(chǔ)。

GC-MS和GC-IMS是常見的分析工具,前者是一種強大的化學(xué)分析工具,結(jié)合了GC的分離能力和MS的鑒定能力,用于鑒定和定量復(fù)雜樣品中的揮發(fā)性和半揮發(fā)性物質(zhì),其通過色譜部分將混合物中的化合物分離,然后通過質(zhì)譜部分對每個單獨的化合物進(jìn)行質(zhì)量分析,從而實現(xiàn)對樣品中未知組分的識別和定量,它不僅在環(huán)境監(jiān)測、藥物研發(fā)等領(lǐng)域發(fā)揮著關(guān)鍵作用,在食品風(fēng)味分析中也尤為重要。研究人員能夠通過它識別和定量食品中的特定風(fēng)味物質(zhì),這些物質(zhì)可能對食品的整體感官有顯著影響。Chen Cheng等使用SPME-GC-MS聯(lián)用測定全部添加脂肪酸和鐵的乳粉樣品的感官數(shù)據(jù)并使用RF預(yù)測腥味,RF識別出了對腥味有顯著貢獻(xiàn)的GC-MS峰,這些峰被標(biāo)注為醇類、酮類、醛類和呋喃類化合物。GCIMS也是一種高效的分析技術(shù),通過結(jié)合GC分離能力和IMS的檢測速度和靈敏度,對揮發(fā)性和半揮發(fā)性物進(jìn)行快速鑒定和定量。與傳統(tǒng)GC-MS相比,其優(yōu)勢在于高分離效率和快速響應(yīng)能力,能提供更快的分析速度,不需要樣品預(yù)處理和真空操作,極大縮短了樣品分析時間,通常在10~15 min內(nèi)完成一個樣品的檢測;儀器中空氣可作為載氣,能夠檢測到傳統(tǒng)儀器無法識別的小分子揮發(fā)有機物;設(shè)備也具有便攜性和低的維護成本。它可對食品的風(fēng)味成分進(jìn)行更詳細(xì)的分析,例如檢測水果中的香氣化合物、酒類中的風(fēng)味物質(zhì)等,這有助于評估食品的質(zhì)量。Zhang Yi等通過HS-GC-IMS快速全面評估不同發(fā)酵處理對柑橘果皮在儲存過程中的風(fēng)味化合物的動態(tài)變化,PCA能明顯區(qū)分不同貯藏時間樣品的風(fēng)味物質(zhì),為柑橘果皮老化提供理論指導(dǎo)。

兩種感官儀器分別是電子鼻和電子舌,其中電子鼻是模擬人類嗅覺的儀器,核心組成包括氣味取樣、氣體傳感器陣列和信號處理系統(tǒng),將氣體傳感器捕捉到的氣味分子的化學(xué)信號轉(zhuǎn)換成電信號,然后通過模式識別算法進(jìn)行分析和識別,這些傳感器對不同氣體的靈敏度有差異,從而可形成獨特的響應(yīng)圖案。優(yōu)點是響應(yīng)時間短、重復(fù)性好、操作簡單且準(zhǔn)確客觀,在食品工業(yè)中被用于檢測食品的新鮮度、預(yù)估貯存時間。電子舌模擬的是人類味覺感知,它利用傳感器感知樣品的整體特征響應(yīng)信號,并通過模式識別對樣品分析,能在短時間內(nèi)完成樣品的檢測。Liu Ming等利用電子鼻測量得到響應(yīng)值,并通過PCA結(jié)合BP-ANN和SVM客觀評估20 種最受歡迎且商業(yè)可得的中國白酒。結(jié)果表明,傳感器S1、S3、S5、S6、S7和S9可用于香型評估,S7和S9能夠識別鳳香型和豉香型,S6能夠區(qū)分老白干香型,S1、S3、S5適用于醬香型、濃香型、清香型、芝麻香型和濃香型白酒的評估。因此,電子鼻可以作為中國白酒質(zhì)量控制和風(fēng)味評估的客觀工具。

其他幾種儀器也可用于食品風(fēng)味分析,NIR可利用700~2 500 nm之間的電磁波譜進(jìn)行非破壞性分析,它通過測量分子中化學(xué)鍵吸收特定波長的近紅外光,尤其是C—H、O—H和N—H鍵,導(dǎo)致分子振動特性獲取物質(zhì)的化學(xué)信息,可用來識別和定量物質(zhì)中的特定組分。NIR分析速度快、分析成本低、儀器操作簡單、對樣品無化學(xué)污染、測量準(zhǔn)確度高,可實現(xiàn)多組分的同步快速定量,已廣泛應(yīng)用于食品領(lǐng)域。另外一種利用光譜學(xué)并結(jié)合成像的是近紅外高光譜成像,它能在900~1 700 nm的波長范圍內(nèi)捕獲圖像,通過逐像素收集光譜和空間信息,為每個像素產(chǎn)生一個光譜特征,從而為不同材料提供獨特的指紋。它在食品風(fēng)味中可用于檢測食品中的關(guān)鍵物質(zhì)各項指標(biāo)。Gehlken等開發(fā)基于傳感器進(jìn)行NIR測量得到葡萄漿樣品的光譜數(shù)據(jù)結(jié)合PLS回歸和光譜一階導(dǎo)數(shù)的校準(zhǔn)模型預(yù)測釀酒葡萄中的感官屬性,并與感官評估結(jié)果進(jìn)行比較,對于果香、青草、花香和微生物味4 種感官指標(biāo)顯示出較高的預(yù)測準(zhǔn)度。SERS是基于金屬納米結(jié)構(gòu)的高靈敏度光譜分析技術(shù),它能夠顯著增強吸附在金屬表面(如金、銀、銅)附近分子的拉曼信號,增強效果可達(dá)108 倍甚至更高,其增強效應(yīng)主要由電磁增強和化學(xué)增強兩方面構(gòu)成,其中電磁增強起主導(dǎo)作用。SERS靈敏度高,無需標(biāo)記能快速檢測,具有分子特異性,能夠提供分子水平上的信息,用于檢測并識別各種化學(xué)物質(zhì),包括生物分子、有機污染物等,在食品安全領(lǐng)域有巨大的應(yīng)用潛力。Leong等設(shè)計一種由PCA和SVM-DA驅(qū)動的“SERS品嘗器”,使用SERS技術(shù)捕獲風(fēng)味分子并同時利用多個受體的振動信息增強對5 種葡萄酒風(fēng)味分子的多重分析,SERS品嘗器在人工葡萄酒基質(zhì)中實現(xiàn)了100%的風(fēng)味定量精度。LF-NMR利用原子核在外加磁場作用下的能級分裂和能量吸收釋放現(xiàn)象,通過射頻激勵和檢測獲取樣品中不同核自旋的信號。相比高場核磁共振,LF-NMR具有成本低、設(shè)備小型化、操作簡便等優(yōu)勢,在食品風(fēng)味分析中能夠檢測食品中的水分含量、脂肪含量、糖含量等。Sun Yanan等采用LF-NMR分析大蒜中的水分狀態(tài)和風(fēng)味物質(zhì)并使用PLS和BP-ANN成功監(jiān)測了大蒜在干燥過程中的風(fēng)味變化。利用上述這些精密的分析儀器可對食物中某一分子層面進(jìn)行測定,構(gòu)建出目標(biāo)數(shù)據(jù)庫結(jié)合算法進(jìn)行相關(guān)風(fēng)味研究。

2.2 基于分子屬性的風(fēng)味分析

研究食物的風(fēng)味就是探索影響味道和氣味的風(fēng)味分子,分子通過儀器和軟件測得的單一結(jié)構(gòu)或序列結(jié)構(gòu)與反映或發(fā)揮出的功能會彰顯出食物的不同特點,最終的風(fēng)味特征也不相同。因此,研究食物的風(fēng)味需研究食物中分子的結(jié)構(gòu)特征、分子發(fā)揮的性質(zhì)與食物風(fēng)味的關(guān)系。接下來將從食品的分子結(jié)構(gòu)、分子性質(zhì)和分子序列角度具體說明風(fēng)味分析的方法與應(yīng)用。

2.2.1 基于分子結(jié)構(gòu)的風(fēng)味分析

1)分子氣味感知與消費者偏好

一種基于結(jié)構(gòu)信息估算分子特性的通用方法,稱為定量構(gòu)效關(guān)系(QSPR)建模。該方法通常使用SMILES分子表示法。SMILES可被視為一種真正的語言,而非樹狀結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)作為輸入,這些信息可直接由軟件生成或在數(shù)據(jù)庫中查詢。Sharma等基于化合物結(jié)構(gòu)的理化性質(zhì)、分子指紋和SMILES符號,開發(fā)了使用DNN結(jié)合物理化學(xué)性質(zhì)、PPMF以及CNN結(jié)合化學(xué)結(jié)構(gòu)圖像(使用Xception權(quán)重)預(yù)測結(jié)構(gòu)-氣味關(guān)系的模型。DNN結(jié)合PPMF和CNN結(jié)合化學(xué)結(jié)構(gòu)圖像的組合架構(gòu)準(zhǔn)確預(yù)測了64 種氣味感知,準(zhǔn)確率為100%,對102 種氣味感知的預(yù)測準(zhǔn)確率為90.35%。Wang Yutang等為預(yù)測啤酒中化合物的風(fēng)味和保留指數(shù),從文獻(xiàn)和FlavorDB數(shù)據(jù)庫中收集啤酒揮發(fā)性物質(zhì),使用SMILES符號作為風(fēng)味模型SVM、RF和KNN和預(yù)測保留指數(shù)值的回歸模型PCR、RFR和PLS的輸入,風(fēng)味分類最高準(zhǔn)確率達(dá)到0.686,最佳回歸模型的R2達(dá)到0.96。

使用分子圖像意味著將分子的結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化為圖形表示,將分子圖像作為輸入的情況相對少見,但隨著深度網(wǎng)絡(luò)算法的發(fā)展,其已經(jīng)被用作輸入信息。與傳統(tǒng)的定量構(gòu)效關(guān)系模型相比,基于圖的表示法具有揭示混合物成分之間模式的優(yōu)勢,并且在捕捉復(fù)雜性和對稱性方面表現(xiàn)出色。Sanchez-Lengeling等以分子圖像結(jié)構(gòu)作為輸入,成功訓(xùn)練出能捕捉結(jié)構(gòu)與氣味之間關(guān)系的圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。Bo Weichen等使用以二維分子圖像作為輸入的CNN自動提取特征,并建立了圖像與分子氣味之間的聯(lián)系。為解決結(jié)構(gòu)-氣味距離的不連續(xù)性問題,Lee等通過構(gòu)建一個POM,成功地將分子結(jié)構(gòu)與氣味感知聯(lián)系起來。研究利用MPNN,將化學(xué)結(jié)構(gòu)映射到氣味感知,并通過大規(guī)模的實驗驗證了POM在氣味預(yù)測任務(wù)中的有效性和泛化能力。POM能夠保留氣味感知的距離和層次結(jié)構(gòu),在多種氣味預(yù)測任務(wù)中超越了傳統(tǒng)化學(xué)信息學(xué)模型。該研究為理解氣味感知機制、預(yù)測新型氣味分子的性質(zhì)以及推動氣味數(shù)字化技術(shù)的發(fā)展提供了重要的理論基礎(chǔ)和工具支持。

同樣,可使用圖像顯示分子的結(jié)構(gòu)信息并作為CNN的輸入,預(yù)測食品相關(guān)指標(biāo),滿足消費者對健康食品的需求。Koyama等開發(fā)一種基于圖像處理和ML結(jié)合的方法,通過智能手機拍攝菠菜圖像并從中提取顏色特征和局部特征,包括灰度、顏色空間的均值、最小值和標(biāo)準(zhǔn)差,使用SVM和ANN,將提取的特征作為輸入,預(yù)測菠菜的新鮮度等級。結(jié)果表明,SVM和ANN在四分類中的總體準(zhǔn)確率為70%,在三分類中為77%,在二分類中為84%,模型預(yù)測結(jié)果與個體評價結(jié)果相似。該研究能夠有效替代訓(xùn)練有素的小組成員,提供了一種快速、低成本且可重復(fù)的菠菜新鮮度預(yù)測方法。Da Silva Cotrim等使用CNN提取圖像中的顏色特征,通過全局平均池化減少維度,再用SVM進(jìn)行分類,用于在食品熱處理過程中識別和跟蹤顏色變化,CNN-SVM混合系統(tǒng)能夠準(zhǔn)確識別和分類面包烘焙階段,準(zhǔn)確率高達(dá)99.70%,該系統(tǒng)在減少計算資源消耗并提高模型訓(xùn)練速度方面表現(xiàn)出色,可應(yīng)用于食品加工提升新鮮度的過程。

2)設(shè)計人工風(fēng)味分子

利用已知風(fēng)味分子的結(jié)構(gòu)結(jié)合ML進(jìn)行從頭分子生成,能夠高效識別到新型風(fēng)味分子。生成模型將物理化學(xué)性質(zhì)與分子結(jié)構(gòu)相映射,可以高效預(yù)測出高度優(yōu)化的多樣化分子集合,參與后續(xù)食品風(fēng)味的調(diào)控,如圖3所示。Zhavoronkov等為快速發(fā)現(xiàn)針對盤狀結(jié)構(gòu)域受體1的強效抑制劑,結(jié)合強化學(xué)習(xí)、變分推斷和張量分解,創(chuàng)建生成張量強化學(xué)習(xí)模型,在21 d內(nèi)成功識別出抑制劑。Skinnider等基于RNN使用LSTM架構(gòu)開發(fā)了DarkNPS深度生成模型,能從已知精神活性物質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)中學(xué)習(xí)并生成新的結(jié)構(gòu)。研究展示出深度生成模型在化學(xué)結(jié)構(gòu)解析、藥物設(shè)計中的能力,為人工智能在分子設(shè)計領(lǐng)域的實踐提供了成功案例,同時能擴展到其他類型的化學(xué)物質(zhì)的結(jié)構(gòu)解析,如新型興奮劑、環(huán)境污染物、食品滋味物質(zhì)等。


2.2.2 基于分子性質(zhì)的風(fēng)味分析

1)食品感知預(yù)測

一種經(jīng)常使用的食品分析策略是利用食品中主導(dǎo)風(fēng)味的關(guān)鍵性物質(zhì)的屬性并結(jié)合ML算法實現(xiàn)風(fēng)味特征的預(yù)測。Shang Liang等利用來自于包含1 026 種氣味分子和相應(yīng)的氣味描述符的分子數(shù)據(jù)庫并使用DRAGON軟件計算氣味分子的理化參數(shù),先通過PCA和Boruta方法提取數(shù)據(jù)特征,隨后使用SVM、RF和ELM預(yù)測分子的氣味感知,結(jié)合Boruta特征提取的SVM模型表現(xiàn)最佳,準(zhǔn)確率達(dá)到97.08%,該方法可用于輔助氣相色譜-嗅覺(GC-O)測定中的人工評估。Chawgien等根據(jù)西瓜的最大頻率、熵值和質(zhì)量的屬性,使用樸素貝葉斯、KNN、DT、RF、ANN、邏輯回歸、SVM和GBDT對西瓜的甜度進(jìn)行了分類。Saville等通過ANN(包括MLP分類器)、RF、SVM和KNN分析407 種清酒的12 個理化性質(zhì)和260 種清酒的感官評估數(shù)據(jù)識別日本清酒的質(zhì)量,ANN在清酒風(fēng)味等級預(yù)測中的準(zhǔn)確率為91.14%,在清酒分類中,MLP的精確率達(dá)到100%。Li等從來自2015年日本大米競賽數(shù)據(jù)中收集樣本,以脂肪酸、水分、蛋白質(zhì)、直鏈淀粉和口感得分的理化參數(shù)作為SVM、LDA、KNN的輸入實現(xiàn)了大米的口感得分的預(yù)測。總之,這是一種較為直接的利用分子性質(zhì)的方法來實現(xiàn)一定精度的預(yù)測。下面將介紹一種較為間接的方法,它是基于物質(zhì)在代謝途徑中的循環(huán)實現(xiàn)風(fēng)味預(yù)測。

2)風(fēng)味代謝物篩選

對于一種植物,由基因調(diào)節(jié)的相關(guān)酶控制著植物體內(nèi)多種代謝途徑,這些代謝途徑由各種物質(zhì)通過生化反應(yīng)形成,這些參與的物質(zhì)具有相應(yīng)的性質(zhì),可能有些就是影響植物果實風(fēng)味的關(guān)鍵物質(zhì)。從篩選代謝物角度出發(fā),通過代謝組學(xué)結(jié)合統(tǒng)計和ML算法,能有效剖析并確定多種影響食品風(fēng)味的代謝物,目前已在影響水果風(fēng)味的代謝物探索中應(yīng)用。

Sun Zhu等為探索影響Pepino果實的關(guān)鍵風(fēng)味代謝物,基于化學(xué)成分,通過代謝組學(xué)和ML結(jié)合的方法預(yù)測果實風(fēng)味特性。果實Pepino來自不同地區(qū),代謝組學(xué)檢測涵蓋的化合物包括氨基酸及其衍生物、核苷酸及其衍生物、酚酸等有機酸、脂質(zhì)、糖類和醇類等,使用14 種ML模型預(yù)測感官評分。研究發(fā)現(xiàn),N-乙酰組胺、精氨酸、咖啡酸能增強風(fēng)味強度;3-磷酸甘油、檸檬酸和蔗糖影響果實的喜好度;甘油酸和磷酸抑制甜味,增強酸味,蔗糖則相反。篩選出27 種關(guān)鍵代謝物可區(qū)分不同地區(qū)的Pepino果實,并顯著影響消費者的風(fēng)味感知,為Pepino的精準(zhǔn)育種提供了新靶點,有助于培育出風(fēng)味更佳的果實品種。Ferr?o等將藍(lán)莓的香氣與消費者偏好相聯(lián)系,從代謝組學(xué)角度出發(fā),使用52 個南方高叢藍(lán)莓品種,利用嶺回歸、RF、多核混合、基因組最佳線性無偏預(yù)測算法得到一些關(guān)鍵萜烯類揮發(fā)物,包括p-傘花烴、香葉醛、芳樟醇、L-薄荷醇、香葉酮、香葉醇、D-檸檬烯、β-蒎烯,這些化合物是“芳香型”風(fēng)味藍(lán)莓的主要代謝物,在“芳香型”藍(lán)莓中的濃度顯著高于“非芳香型”藍(lán)莓,與消費者對藍(lán)莓的喜好密切相關(guān)。Fan Zhen等為識別影響草莓甜度的化學(xué)物質(zhì),對草莓樣本中的3 種糖(葡萄糖、果糖、蔗糖)、2 種有機酸(檸檬酸、蘋果酸)和113 種揮發(fā)性化合物進(jìn)行定量分析,通過消費者小組對148 個草莓樣本進(jìn)行感官評價,包括甜度、酸度、風(fēng)味強度和整體喜好等指標(biāo),利用相關(guān)性分析、PCA、PLS、RF、GLM、梯度增強線性模型、最小絕對收縮和選擇算子模型預(yù)測甜度和消費者喜好。研究發(fā)現(xiàn)20 種揮發(fā)性化合物能夠獨立于糖類增強甜味感知;18 種揮發(fā)性化合物能夠獨立于糖類增強消費者喜好;15 種揮發(fā)性化合物對甜味和喜好都有積極作用;乙酸己酯、丁酸己酯、丁酸3-甲基丁酯等使草莓在口感和香氣上更加豐富和甜美。這些發(fā)現(xiàn)為通過遺傳工程和標(biāo)記輔助育種改善草莓風(fēng)味提供了重要的化學(xué)物質(zhì)目標(biāo)。綜上,代謝組學(xué)數(shù)據(jù)結(jié)合模型預(yù)測,可挖掘與風(fēng)味相關(guān)的代謝物質(zhì),為植物育種中風(fēng)味品質(zhì)改良提供方向。

2.2.3 基于分子序列的風(fēng)味分析

1)風(fēng)味物質(zhì)化學(xué)合成設(shè)計

化學(xué)反應(yīng)可作為一種反應(yīng)序列并結(jié)合ML模型進(jìn)行物質(zhì)預(yù)測,ML在其中表現(xiàn)出色,但預(yù)測風(fēng)味前體物質(zhì)合成鮮見報道。Coley等開發(fā)一個能夠預(yù)測有機反應(yīng)結(jié)果的模型,結(jié)合傳統(tǒng)的反應(yīng)模板和神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的靈活性,以提高結(jié)果的預(yù)測精度,通過ML能準(zhǔn)確預(yù)測化學(xué)反應(yīng)的主要產(chǎn)物,從而輔助有機合成設(shè)計和反應(yīng)評估,解決了現(xiàn)有軟件在實驗室中反應(yīng)步驟失敗率高的問題。研究使用1976—2013年美國專利商標(biāo)局授予專利中的15 000 個實驗反應(yīng)記錄作為數(shù)據(jù)集,選擇出現(xiàn)頻率最高的1 689 個獨特反應(yīng)SMARTS字符串模板用于模型訓(xùn)練,應(yīng)用這些模板到反應(yīng)物池中,可生成一系列可能的候選產(chǎn)物。構(gòu)建神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)之后,使用5折交叉驗證進(jìn)行訓(xùn)練和測試,用于評估每個候選反應(yīng)的可能性,通過具體反應(yīng)示例展示了模型的預(yù)測能力,包括正確預(yù)測的反應(yīng)(如氯化、酰胺合成、異噁唑合成等)和錯誤預(yù)測的反應(yīng)(如酰胺化、水解、脫保護等),并分析模型在這些情況下的表現(xiàn)?;旌夏P驮谥饕a(chǎn)物排名為1的情況下的準(zhǔn)確率為71.8%,排名在前3的情況下的準(zhǔn)確率為86.7%,排名在前5的情況下的準(zhǔn)確率為90.8%。Segler等提出了一種基于DNN的混合神經(jīng)符號的方法,結(jié)合手工編碼和自動提取的規(guī)則集,用于反應(yīng)預(yù)測和逆合成,通過在包含350萬反應(yīng)的化學(xué)知識庫上進(jìn)行訓(xùn)練,學(xué)習(xí)如何在特定的分子上下文中應(yīng)用規(guī)則,并對反應(yīng)規(guī)則進(jìn)行優(yōu)先級排序。與傳統(tǒng)的基于規(guī)則的系統(tǒng)相比,該模型在反應(yīng)預(yù)測任務(wù)中的準(zhǔn)確率從7%提高到92%,在逆合成任務(wù)中的準(zhǔn)確率從5%提高到78%。這些研究能夠有效預(yù)測有機反應(yīng)的主要產(chǎn)物,有助于加速化學(xué)研究和藥物開發(fā)中的合成路線規(guī)劃,展現(xiàn)了深度學(xué)習(xí)在風(fēng)味分子合成設(shè)計中的潛力。以上的測定對象是化學(xué)反應(yīng)序列,但更多的序列數(shù)據(jù)是基因組序列、轉(zhuǎn)錄組序列以及氨基酸序列,以下將逐一介紹序列數(shù)據(jù)結(jié)合ML算法在食品風(fēng)味方向的相關(guān)研究成果。

2) 挖掘天然風(fēng)味分子

盡管對已知風(fēng)味分子的研究已取得一定進(jìn)展,但目前僅對潛在天然產(chǎn)物的6%進(jìn)行了評估,隨著基因組數(shù)據(jù)的迅速增長,植物的生物合成潛力被低估,預(yù)計還有數(shù)百萬種潛在的天然產(chǎn)物尚未被發(fā)現(xiàn),仍有大量未知的天然產(chǎn)物有待探索。在植物中,參與特化代謝途徑的基因通常以生物合成基因簇(BGCs)的形式在染色體上連續(xù)編碼,這揭示生物合成途徑的細(xì)節(jié),為識別天然風(fēng)味分子提供了有力支持。

Blin等介紹了用于微生物基因組挖掘的工具antiSMASH 6.0,可檢測和表征BGCs,通過基因組數(shù)據(jù)可探索微生物中的次生代謝產(chǎn)物(如抗生素、抗病毒藥物等)的生物合成途徑。Hannigan等通過深度學(xué)習(xí)和自然語言處理技術(shù),顯著提高了BGCs的預(yù)測精度和分類能力,并可挖掘出潛在的BGCs。這些計算工具和技術(shù)可為微生物基因組學(xué)和天然產(chǎn)物的挖掘提供重要資源,為植物中風(fēng)味基因及物質(zhì)挖掘提供了指導(dǎo)。Kautsar等介紹了plantiSMASH在線分析平臺,可自動化識別、注釋和分析植物BGCs,并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)優(yōu)先考慮候選BGCs,并進(jìn)行比較基因組學(xué)分析研究每個簇的進(jìn)化保守性。通過實驗驗證,plantiSMASH能夠成功檢測所有已知的植物BGCs,已經(jīng)在多個植物基因組中發(fā)現(xiàn)大量的候選BGCs,這有助于發(fā)現(xiàn)和研究植物次生代謝產(chǎn)物。利用質(zhì)譜檢測代謝物的質(zhì)荷比(m/z)獲取代謝物的分子質(zhì)量信息,結(jié)合工具NPLinker,可將基因組學(xué)鑒定的BGCs與代謝組學(xué)檢測到的代謝物進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,通過基因-代謝物關(guān)聯(lián),明確BGCs對應(yīng)的實際代謝產(chǎn)物,實現(xiàn)天然產(chǎn)物的精準(zhǔn)鑒定,從而架起基因信息與實際分子的橋梁,隨后將鑒定出的天然產(chǎn)物分子結(jié)構(gòu)輸入ML模型預(yù)測這些新發(fā)現(xiàn)分子的風(fēng)味類別和強度,以篩選出具有更優(yōu)特性的天然分子香料,具體過程見圖4。


3)預(yù)測植物代謝性狀

基于基因組序列建立預(yù)測模型分析植物性狀或代謝途徑是從植物源頭出發(fā)進(jìn)行風(fēng)味分析的有效手段,已經(jīng)出現(xiàn)相關(guān)研究。Hershberger等結(jié)合全基因組標(biāo)記和全轉(zhuǎn)錄組豐度數(shù)據(jù),采用了轉(zhuǎn)錄組預(yù)測模型,用于預(yù)測甜玉米粒中類胡蘿卜素和生育色素的性狀。結(jié)果顯示,結(jié)合基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的預(yù)測模型在某些性狀上優(yōu)于僅使用基因組數(shù)據(jù)的模型;在因果基因的識別方面,全轉(zhuǎn)錄組關(guān)聯(lián)分析(TWAS)檢測到4 個因果基因的顯著關(guān)聯(lián),在通路水平分析中發(fā)現(xiàn)了其他相關(guān)基因,這些發(fā)現(xiàn)為通過生物強化提高甜玉米的營養(yǎng)價值提供了重要的遺傳基礎(chǔ)。Hu Haixiao等通過整合基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)數(shù)據(jù),使用兩核線性模型整合可能的因果位點,解釋少量或無表型變異的位點,同時在多環(huán)境實驗中,使用多性狀模型結(jié)合多組學(xué)數(shù)據(jù)提高預(yù)測準(zhǔn)確性,最終增強了燕麥農(nóng)藝性狀和種子營養(yǎng)性狀的預(yù)測能力。因此,在研究植物營養(yǎng)成分的過程中,通過明確基因表達(dá)、代謝產(chǎn)物之間的關(guān)系,有助于最終得到新的風(fēng)味分子。

4)鮮味肽的篩選策略

現(xiàn)今大多數(shù)的食物都存在偏甜和偏咸的現(xiàn)象,為降低甜味活咸味程度,同時不喪失食物中的甜味和鮮味程度,通常會在食品中添加呈味肽。隨著基因組時代多肽序列增長迅速,會對大量的多肽進(jìn)行篩選,其中鮮味肽因具有較高的營養(yǎng)價值和風(fēng)味活性,已成為近年來呈味肽研究的一個熱點。傳統(tǒng)鮮味肽篩選方法包括4 個階段:粗肽提取,肽的分離純化,肽的篩選鑒定和鮮味肽的合成、驗證。但傳統(tǒng)的鮮味肽篩選方法可能會損失一些高活性肽,阻礙鮮味肽篩選,降低鮮味肽篩選效率,因此隨后引入ML基于肽序列的各種特征向量篩選特定的活性肽片段,實現(xiàn)生物活性肽的高通量篩選。

圖5展示了基于序列的ML生物肽預(yù)測模型的開發(fā)主要涉及3 個關(guān)鍵步驟:數(shù)據(jù)收集和處理、數(shù)據(jù)特征提取、模型訓(xùn)練與評估。Charoenkwan等提出的基于序列的iUmami-SCM預(yù)測器主要基于20 個氨基酸和400 個二肽的傾向評分進(jìn)行設(shè)計,輸入信息缺少,整體預(yù)測性能不足,隨后研究開發(fā)的iBitter-SCM模型彌補了前者缺陷。Zhang Jingcheng等基于Transformer的BERT開發(fā)了一種名為Umami-BERT的基于氨基酸序列的預(yù)測器,也能夠?qū)崿F(xiàn)鮮味肽的快速篩選?;谏鲜瞿P徒⒎?wù)器專門用于鮮味肽篩選可提高效率,加速鮮味肽產(chǎn)業(yè)化的發(fā)展。


2.3 基于數(shù)據(jù)庫的風(fēng)味分析

風(fēng)味數(shù)據(jù)庫是高質(zhì)量的味覺和氣味分子數(shù)據(jù)匯聚資源,是儀器測定和分子角度描述的綜合結(jié)果。這些庫中通常包含了分子名稱、特定結(jié)構(gòu)(如SMILES)的分子表示,分子物理化學(xué)特性以及風(fēng)味描述、感官評價等信息,其中分子的物理化學(xué)特性可通過軟件(如Dragon軟件)計算得出。數(shù)據(jù)庫的獲取渠道可以是文獻(xiàn)或整理可獲取的已知風(fēng)味分子庫。這為研究風(fēng)味以及嗅覺、味覺受體作用機制的人員提供了幫助。

常見并應(yīng)用的風(fēng)味數(shù)據(jù)庫有BitterDB、SuperSweet和FlavorDB。Dagan-Wiener等開發(fā)了一個基于BitterDB數(shù)據(jù)庫收集苦味分子作為正樣本集,從文獻(xiàn)中收集非苦味分子作為負(fù)樣本集,訓(xùn)練了自適應(yīng)提升(AdaBoost)的分類器BitterPredict預(yù)測化合物是否具有苦味。Bo Weichen等從BitterDB、SuperSweet和FlavorDB數(shù)據(jù)庫收集苦味和甜味分子,使用MLP和CNN揭示了分子苦感的影響因素,也成功通過分子結(jié)構(gòu)預(yù)測了分子味覺。Bo Weichen等從FlavorDB和PubChem中檢索氣味分子數(shù)據(jù)集,通過關(guān)鍵詞“eary”“fresh”“meaty”“musty”“nutty”“spicy”“sulfurous”“woody”和“fruity”搜索有氣味的分子,以及“odorless”搜索無氣味的分子,研究者共收集了2 087 個有氣味的分子和411 個無氣味的分子,通過這些分子結(jié)合深度學(xué)習(xí)算法,探索分子結(jié)構(gòu)與氣味之間的關(guān)系,有利于發(fā)現(xiàn)新的氣味分子。其他數(shù)據(jù)庫也有應(yīng)用于風(fēng)味分析,Sharma等通過ODORactor和FlavorDB收集氣味分子,從PubChem數(shù)據(jù)庫獲取無氣味分子,被標(biāo)注為“無氣味/無異味/無嗅/幾乎無氣味/幾乎沒有氣味/無明顯氣味”的分子是通過他們提出的DNN預(yù)測模型手動收集得到,成功預(yù)測了分子的不同氣味。Yang Zhengfei等從文獻(xiàn)中手動收集Taste DB和LogSw DB兩個數(shù)據(jù)集,使用DT、KNN、SVM、RF、XGBoost、GBDT和PLS等算法建立一種多層甜味評估系統(tǒng),能夠?qū)μ鹞秳┑膩碓?、結(jié)構(gòu)、營養(yǎng)價值進(jìn)行分類,并定量預(yù)測其甜度。目前公共數(shù)據(jù)集只納入極小部分已知的風(fēng)味分子,大部分分散在眾多文獻(xiàn)報告中,未得到系統(tǒng)整理,且盡管所提供的信息量足夠,但在使用時優(yōu)化并提供標(biāo)準(zhǔn)化的合理數(shù)據(jù)是實現(xiàn)準(zhǔn)確預(yù)測的關(guān)鍵??傊L(fēng)味數(shù)據(jù)庫可以作為一種便捷手段研究風(fēng)味應(yīng)用。

結(jié) 語

本文綜述了食品風(fēng)味分析中的ML算法,其常見方法涵蓋有監(jiān)督算法、無監(jiān)督算法以及深度學(xué)習(xí)算法。在風(fēng)味分析策略中,介紹了利用的儀器和不同的分子屬性方法以及數(shù)據(jù)庫的利用。先引入幾種常用的分析儀器的原理、優(yōu)勢和風(fēng)味應(yīng)用;在基于分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行風(fēng)味分析時,分子圖像和SMILES符號是主要的模型輸入對象;基于分子性質(zhì)的風(fēng)味分析,劃分為性質(zhì)的直接利用與間接利用兩種方式;基于分子序列的風(fēng)味分析,分別闡述了風(fēng)味物質(zhì)化學(xué)合成設(shè)計、挖掘天然風(fēng)味分子、植物代謝性狀的預(yù)測、鮮味肽的篩選策略四方面的內(nèi)容;在利用數(shù)據(jù)庫進(jìn)行風(fēng)味分析時,總結(jié)出幾種常見的風(fēng)味數(shù)據(jù)庫及其應(yīng)用。需要注意的是,盡管ML算法已廣泛應(yīng)用于食品風(fēng)味分析過程,但算法在分析時仍有局限性,對于不同的風(fēng)味數(shù)據(jù),例如數(shù)據(jù)類型的不同、數(shù)據(jù)量的多少、數(shù)據(jù)維度的高低,數(shù)據(jù)間的線性或非線性關(guān)系、數(shù)據(jù)中自變量與因變量的模式、風(fēng)味的最終目標(biāo),需要選用相應(yīng)的算法去分析達(dá)到所需的最佳效果,并非隨意調(diào)用。

對于ML算法部分,其已憑借出色的處理數(shù)據(jù)能力,在風(fēng)味領(lǐng)域嶄露頭角,為進(jìn)一步提升其在食品風(fēng)味分析中的效能,可采取多種策略。對于模型選擇的考慮,可以進(jìn)行多模型對比,挑選更適合預(yù)測風(fēng)味的模型,也可開發(fā)復(fù)合模型以應(yīng)對更復(fù)雜的風(fēng)味任務(wù);對于模型精度的考慮,可以簡化模型復(fù)雜度,使用有效的小數(shù)據(jù)集,訓(xùn)練出更專業(yè)化的模型,但更關(guān)鍵的是要深入探究人類對風(fēng)味的感知原理,讓算法更好地學(xué)習(xí)模擬人類的感知模式。對于風(fēng)味分析策略部分,在利用儀器時,現(xiàn)有技術(shù)與ML算法聯(lián)用已實現(xiàn)對食品風(fēng)味的有效分析,未來還可開發(fā)并使用更新的技術(shù)儀器與ML相結(jié)合。在分子研究的層面上,可以探索更多的分子性質(zhì)或結(jié)構(gòu)的表示方法,從而拓寬風(fēng)味研究的渠道;也應(yīng)強化ML與多組學(xué)數(shù)據(jù)的融合分析,深入剖析食品風(fēng)味形成的分子機制,從而指導(dǎo)育種工作,篩選出更多具有應(yīng)用價值的食品原成分。此外,借鑒ML在人工分子合成、控制化學(xué)反應(yīng)合成以及利用序列模型篩選目標(biāo)物質(zhì)的成功經(jīng)驗,可以指導(dǎo)更多理想風(fēng)味物質(zhì)的精準(zhǔn)合成,通過這些物質(zhì)抑制食品中不良風(fēng)味的產(chǎn)生,或?qū)σ延械牟涣硷L(fēng)味進(jìn)行掩蓋和改善,從而更好地滿足消費者多樣化的需求。對于數(shù)據(jù)庫的利用,目前還存在諸多問題,如數(shù)據(jù)獲取途徑受限、數(shù)據(jù)維度和數(shù)量有限、更新不及時等,針對這些問題,應(yīng)該鼓勵科研人員在發(fā)表文獻(xiàn)時公開相關(guān)數(shù)據(jù)、豐富數(shù)據(jù)庫的資源,為食品風(fēng)味領(lǐng)域工作者的使用研究提供便捷手段。未來,還可以在現(xiàn)有風(fēng)味分析方法上進(jìn)行拓展研究或是開創(chuàng)更加全新的研究路線,旨在推動食品的高質(zhì)量發(fā)展以及食品行業(yè)的產(chǎn)品升級。

作者簡介

通信作者:


朱丹曄,女,博士、助理研究員,畢業(yè)于西北農(nóng)林科技大學(xué)葡萄與葡萄酒學(xué)專業(yè),獲工學(xué)博士學(xué)位,博士期間赴美國俄勒岡州立大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng),畢業(yè)同年進(jìn)入中國煙草總公司鄭州煙草研究院從事科研工作,研究方向為風(fēng)味化學(xué)及資源高值化利用。作為項目負(fù)責(zé)人承擔(dān)國家自然科學(xué)基金-青年科學(xué)基金項目、鄭州市優(yōu)秀青年科技人才(博士)培養(yǎng)專項項目、鄭州煙草研究院青年人才托舉工程計劃項目、國家煙草專賣局(中國煙草總公司)煙草工藝重點實驗室引領(lǐng)計劃專項科技項目,作為主要完成人參與美國American Vineyard Foundation項目、國家自然科學(xué)基金-面上項目等多項科研項目,發(fā)表論文10余篇,申請專利多項。


喬學(xué)義,研究員,全國評煙委員會委員。主要從事煙葉原料、卷煙配方和加工工藝技術(shù)研究。主持和參與中國煙草總公司科技重大專項、重點項目二十余項。獲省部級一等獎1 項,二等獎3 項,三等獎1 項,授權(quán)專利40余項,發(fā)表論文40余篇,出版本專業(yè)論著5 部。

第一作者:


張超,鄭州煙草研究院2024級碩士研究生,研究方向為食品風(fēng)味。

引文格式:

張超, 堵勁松, 劉偉, 等. 結(jié)合機器學(xué)習(xí)算法的食品風(fēng)味分析策略[J]. 食品科學(xué), 2025, 46(23): 333-346. DOI:10.7506/spkx1002-6630-20250526-171.

ZHANG Chao, DU Jinsong, LIU Wei, et al. A review of strategies for food flavor analysis incorporating machine learning algorithms[J]. Food Science, 2025, 46(23): 333-346. (in Chinese with English abstract) DOI:10.7506/spkx1002-6630-20250526-171.

實習(xí)編輯:南伊;責(zé)任編輯:張睿梅。點擊下方閱讀原文即可查看全文。圖片來源于文章原文及攝圖網(wǎng)



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