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重磅!中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)突破性成果登《自然》!

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2026年2月26日,中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院植物抗逆高效全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室楊淑華和施怡婷教授團(tuán)隊(duì)在《自然》(Nature)發(fā)表題為《重構(gòu)E3泛素連接酶協(xié)同增強(qiáng)玉米耐冷性和磷利用效率》(Rewiring an E3 ligase enhances cold resilience and phosphate use in maize)的研究論文。該研究系統(tǒng)揭示了玉米中關(guān)鍵E3泛素連接酶NLA(NITROGEN LIMITATION ADAPTATION)在低溫響應(yīng)與磷吸收調(diào)控中的核心樞紐作用,闡明其在協(xié)調(diào)逆境適應(yīng)與養(yǎng)分利用中的關(guān)鍵分子機(jī)制。研究進(jìn)一步結(jié)合人工智能輔助的蛋白設(shè)計(jì)與基因編輯技術(shù),實(shí)現(xiàn)了NLA蛋白功能的定向優(yōu)化與精準(zhǔn)重塑,成功解耦了作物耐寒性與磷吸收的負(fù)相關(guān),創(chuàng)制出兼具強(qiáng)耐寒性和高磷利用效率的新型玉米種質(zhì),有效提升了低溫脅迫下的產(chǎn)量表現(xiàn)。這一突破性成果標(biāo)志著我國(guó)在作物復(fù)雜性狀協(xié)同調(diào)控機(jī)制解析與智能設(shè)計(jì)育種領(lǐng)域取得重大進(jìn)展,為在氣候變化背景下實(shí)現(xiàn)糧食穩(wěn)產(chǎn)增產(chǎn)與資源高效利用提供了堅(jiān)實(shí)的理論支撐。



聚焦低溫與養(yǎng)分雙重脅迫的

關(guān)鍵科學(xué)問(wèn)題

玉米起源于熱帶,是全球最重要的糧食作物之一,對(duì)低溫極為敏感。春播生產(chǎn)中頻發(fā)的“倒春寒”常導(dǎo)致出苗緩慢、幼苗生長(zhǎng)受阻,甚至引發(fā)顯著減產(chǎn)。低溫對(duì)作物的影響并不僅限于溫度脅迫本身,還會(huì)通過(guò)改變土壤理化性質(zhì)間接加劇養(yǎng)分限制。

磷是植物能量代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞分裂不可或缺的關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)元素。然而,在低溫條件下,土壤中磷的有效性下降,根系活性減弱,磷吸收效率顯著降低,進(jìn)而引發(fā)“生理性缺磷”。因此,在寒冷環(huán)境下,作物往往同時(shí)面臨抗寒壓力和養(yǎng)分不足的雙重挑戰(zhàn)。這種內(nèi)在拮抗成為遺傳改良中的關(guān)鍵瓶頸,嚴(yán)重制約產(chǎn)量穩(wěn)定與資源利用效率的提升。

在全球磷資源日趨緊張、肥料利用效率亟待提升的背景下,從分子層面闡明低溫應(yīng)答和磷高效利用之間的協(xié)同調(diào)控機(jī)制,對(duì)于保障糧食安全與農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。

揭示“冷-磷”協(xié)同調(diào)控的分子樞紐

既往研究主要關(guān)注SPX結(jié)構(gòu)域蛋白作為細(xì)胞內(nèi)磷水平感應(yīng)器的經(jīng)典功能,系統(tǒng)解析了其在磷饑餓響應(yīng)中的調(diào)控機(jī)制。然而,SPX家族是否參與低溫脅迫響應(yīng)及其分子機(jī)制長(zhǎng)期未明,這一認(rèn)知空白限制了對(duì)“冷–磷”互作關(guān)系的深入理解。

圍繞這一關(guān)鍵問(wèn)題,研究團(tuán)隊(duì)系統(tǒng)篩選玉米SPX家族成員,最終鎖定關(guān)鍵調(diào)控因子NLA,并證實(shí)SPX家族蛋白在植物低溫響應(yīng)中扮演著全新角色。研究發(fā)現(xiàn),NLA如同一個(gè)“分流閥門”,整合調(diào)控茉莉酸(JA)信號(hào)通路與磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程。在低溫條件下,NLA蛋白在體內(nèi)積累,一方面通過(guò)泛素化降解JA信號(hào)抑制因子JAZ11,激活JA介導(dǎo)的低溫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,從而提高玉米耐冷性;另一方面,NLA依賴其SPX結(jié)構(gòu)域?qū)〈级嗔姿幔↖nsPs)的感知能力,識(shí)別并泛素化降解磷轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白PT4,抑制根系對(duì)磷的吸收。

這一發(fā)現(xiàn)揭示,NLA作為分子樞紐,在增強(qiáng)耐冷性的同時(shí)限制磷吸收,其“雙向調(diào)控”機(jī)制在分子層面解釋了低溫環(huán)境下耐冷性與磷吸收效率相互制約的內(nèi)在原因,為破解性狀權(quán)衡提供了關(guān)鍵突破口。

AI輔助蛋白設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)功能解耦

為打破這一經(jīng)典性狀權(quán)衡,研究團(tuán)隊(duì)結(jié)合AlphaFold3結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分子對(duì)接分析,精準(zhǔn)定位SPX結(jié)構(gòu)域中負(fù)責(zé)感知InsPs的關(guān)鍵區(qū)域,并利用CRISPR/Cas9技術(shù)在NLA基因中刪除12個(gè)堿基,構(gòu)建新變體NLAΔ12。

功能分析顯示,該變體對(duì)InsP的結(jié)合能力下降約50倍,幾乎喪失對(duì)InsPs的感知能力,不再與PT4結(jié)合并促進(jìn)其降解,從而維持根系磷吸收能力;與此同時(shí),NLA與JAZ11的互作不依賴于InsPs水平,NLAΔ12仍可有效降解JAZ11,維持甚至增強(qiáng)JA介導(dǎo)的耐冷信號(hào)通路。

通過(guò)這一基于結(jié)構(gòu)信息的精準(zhǔn)設(shè)計(jì),研究團(tuán)隊(duì)成功實(shí)現(xiàn)“保留抗寒、解除限磷”的功能解耦,在分子層面破解了長(zhǎng)期存在的性狀權(quán)衡難題,體現(xiàn)了人工智能輔助蛋白設(shè)計(jì)與精準(zhǔn)編輯技術(shù)在復(fù)雜性狀改良中的巨大潛力。



圖1.新變體NLAΔ12解耦玉米耐冷性和磷吸收抑制,

在低溫脅迫條件下實(shí)現(xiàn)穩(wěn)產(chǎn)增產(chǎn)

田間試驗(yàn)驗(yàn)證穩(wěn)產(chǎn)增產(chǎn)潛力

為驗(yàn)證實(shí)際應(yīng)用效果,研究團(tuán)隊(duì)在吉林公主嶺、河北涿州和海南三亞開展多點(diǎn)田間試驗(yàn)。與實(shí)驗(yàn)室恒定低溫處理不同,田間環(huán)境存在自然晝夜溫差與復(fù)雜氣候波動(dòng),更能檢驗(yàn)材料的真實(shí)適應(yīng)能力。

結(jié)果顯示,在氣候相對(duì)溫暖的中低緯度試驗(yàn)點(diǎn)(三亞和涿州),nlaΔ12新材料與對(duì)照材料的產(chǎn)量表現(xiàn)基本一致,差異未達(dá)顯著水平;而在高緯度、易發(fā)生低溫脅迫的公主嶺試驗(yàn)點(diǎn),新材料表現(xiàn)出顯著的產(chǎn)量?jī)?yōu)勢(shì)。

為進(jìn)一步評(píng)估其在不同生育階段應(yīng)對(duì)低溫的能力,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)設(shè)置早播、正常播和晚播處理,分別模擬苗期與灌漿期可能遭遇的低溫脅迫情景。結(jié)果表明,在早播低溫條件下,新材料存活率顯著提升;在晚播遭遇灌漿期低溫時(shí),其穗部發(fā)育狀況和籽粒充實(shí)度均明顯優(yōu)于對(duì)照材料??傮w而言,在低溫逆境下,nlaΔ12改良材料籽粒產(chǎn)量較對(duì)照提高約10%-15%,展現(xiàn)出良好的穩(wěn)產(chǎn)增產(chǎn)潛力。

此外,在玉米自交系中還鑒定到JAZ11和PT4基因中編碼泛素化位點(diǎn)的優(yōu)異自然變異。將人工改造的nlaΔ12與自然優(yōu)良等位變異PT4A267進(jìn)行組合后,后代材料在保持強(qiáng)耐寒性的同時(shí),磷吸收能力進(jìn)一步增強(qiáng),呈現(xiàn)協(xié)同效應(yīng),顯示出良好的育種應(yīng)用前景。

該研究為復(fù)雜環(huán)境下作物性狀的系統(tǒng)重構(gòu)提供了可復(fù)制的技術(shù)路徑,也為人工智能賦能精準(zhǔn)育種向機(jī)制驅(qū)動(dòng)方向發(fā)展提供了重要實(shí)踐范例。



圖2. NLA及其新變體NLAΔ12調(diào)控玉米耐冷性、

磷吸收效率和產(chǎn)量穩(wěn)定性工作模型

鑒于該成果的重要科學(xué)意義與應(yīng)用前景,Nature同期邀請(qǐng)華中農(nóng)業(yè)大學(xué)嚴(yán)建兵教授,與崖州灣國(guó)家實(shí)驗(yàn)室青年科學(xué)家劉杰共同撰寫題為“Protein engineering fixes a major crop trade-off”的專題亮點(diǎn)評(píng)述文章。評(píng)述指出,該研究通過(guò)對(duì)關(guān)鍵調(diào)控蛋白進(jìn)行AI輔助設(shè)計(jì)與功能重塑,成功破解了作物復(fù)雜性狀間的經(jīng)典權(quán)衡,被視為分子機(jī)制解析與精準(zhǔn)設(shè)計(jì)育種深度融合的代表性范例。該成果為作物改良由單一性狀優(yōu)化邁向系統(tǒng)性環(huán)境適應(yīng)設(shè)計(jì)提供了新的理論框架與技術(shù)路徑。評(píng)述專家進(jìn)一步展望了其應(yīng)用前景,認(rèn)為這種解耦冷耐受與磷吸收的“一石二鳥(two-in-one)”策略,有望拓展至其他關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)元素(如氮)的高效利用調(diào)控,對(duì)培育適應(yīng)氣候變化背景下多重脅迫環(huán)境的作物新品種具有重要意義。

本研究由中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院植物抗逆高效全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室楊淑華教授和施怡婷教授擔(dān)任共同通訊作者,博士研究生廖歡為第一作者。宋文教授、李溱教授、田豐教授、楊小紅教授、鞏志忠教授和趙曉云博士等給予重要支持。張曉燕副教授、郭麗博士、李卓洋博士、傅迪毅博士、莊軍紅以及博士研究生任柯宇、劉志成、蘇天航、張朝陽(yáng)等共同參與研究。中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)作物功能基因組學(xué)與分子育種研究中心為該研究提供了遺傳轉(zhuǎn)化服務(wù)和重要材料支持。該研究得到生物育種重大專項(xiàng)、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金以及拼多多-中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)研究基金等項(xiàng)目資助。

近年來(lái),楊淑華教授團(tuán)隊(duì)圍繞植物低溫響應(yīng)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與整合機(jī)制、玉米高緯度低溫適應(yīng)性調(diào)控以及低溫與養(yǎng)分協(xié)同調(diào)控等前沿領(lǐng)域,持續(xù)開展系統(tǒng)深入的研究,取得了一系列具有國(guó)際影響力的原創(chuàng)性成果。相關(guān)研究論文發(fā)表在Nature、Cell、Mol Cell、Nat Plants、Mol Plant、Plant Cell、PNAS等國(guó)際主流學(xué)術(shù)期刊。上述成果不僅推動(dòng)了植物耐低溫研究領(lǐng)域的發(fā)展,也為耐冷玉米品種的精準(zhǔn)設(shè)計(jì)與改良奠定了堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ),提供了重要的遺傳資源和關(guān)鍵分子靶點(diǎn)。

來(lái)源|中國(guó)農(nóng)大新聞網(wǎng)

編輯|曾婷

審校|楊雨睿 張舒然

責(zé)編|范晨輝 姜萍萍

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