1969年8月20日出生在河北石家莊。父母見他個子冒得快，1983年就把他送到省體校專門練籃球。他學東西上手快，1984年進了河北青年隊，1985年直接升到省男籃打前鋒。那年他剛16歲，身高已經(jīng)兩米出頭，身體結實，籃下卡位和扣籃都拿手，很快在隊里站住腳。

1989年他不到20歲就入選國家男籃，當上主力大前鋒。之后幾年他參加亞運會拿了冠軍，還打過世界錦標賽，在亞洲賽場表現(xiàn)突出。1992年巴塞羅那奧運會，他跟著隊伍出戰(zhàn)，雖然上場時間有限，還是打出了自己的貢獻。奧運結束后，他決定去美國繼續(xù)打球和讀書，盡管籃協(xié)明確警告會取消國家隊資格。

到了美國，他先在猶他山谷社區(qū)大學適應環(huán)境。那邊節(jié)奏快，身體對抗強，他咬牙跟上。1992到1993賽季打下來，數(shù)據(jù)穩(wěn)步上升。之后轉到猶他大學正式參加NCAA比賽，成為最早一批在中國大陸球員里進美國大學聯(lián)賽的人。1993到1994賽季，他打滿28場，還在對陣亞利桑那大學的比賽里拿到個人新高分數(shù)和籃板。

1994到1995賽季，球隊來了新球員，他上場時間縮水不少。1995年夏天他去洛杉磯快船試訓季前賽，出場時間穩(wěn)定，但常規(guī)賽開始前被裁掉，沒能留在NBA。之后他轉去菲律賓聯(lián)賽打了三個月，幫球隊拿到加強賽冠軍，當?shù)厍蛎詫λu價很高。那段時間他打得順，證明自己在國外也能立足。

在美國讀書期間，他在猶他大學遇到了日本裔女生高橋美子。她在美國長大，父親做生意，家境不錯。兩人因為都是亞洲面孔聊得來，馬健主動接近，1994年前后確立關系。他們平時用英語溝通，感情一步步穩(wěn)下來。高橋美子后來全程支持他度過低谷。

1995年從菲律賓回來，馬健申請重回國家隊。1996年亞特蘭大奧運會周期，他狀態(tài)不錯卻沒被選中。他公開說過選拔過程里關系因素占了上風，這番話傳開后，籃協(xié)就徹底把他排除在外。從那以后他再也沒有代表國家隊出戰(zhàn)國際比賽，跟男籃體系的聯(lián)系斷了。

回國后他先加盟北京首鋼打CBA。1997賽季他幫球隊完成保級，場均得分和籃板都很突出，證明自己還能打。1998年他轉到北京奧神，當起核心球員。球隊那年從乙級打上去，他貢獻穩(wěn)定，賽季末還入選北方全明星陣容。

在奧神期間他繼續(xù)打主力，2000賽季前期數(shù)據(jù)保持不錯。12月21日一場主場比賽后，球隊突然把他開除。原因是合同出現(xiàn)糾紛，老板懷疑他表現(xiàn)有問題。馬健不服，提起訴訟告球隊侵犯姓名權。法院審理后判那份合同無效，因為缺少關鍵條款和簽字，但他因此兩年多沒球可打。

官司期間他無法注冊參賽，日子過得艱難。2002年11月他簽約上海東方，12月7日完成首秀。2003年3月球隊又因合同問題把他裁掉。那時他已經(jīng)34歲，身心都累，就此選擇退役。CBA階段的轉會和解約，讓他跟幾家俱樂部都留下了糾葛。

退役后馬健沒完全離開籃球圈。他先嘗試做生意，還在2010年拍過幾部電影演小角色。后來他轉行當籃球解說員，主要在網(wǎng)絡平臺分析NBA比賽。解說時他話風直接，常點出中國男籃和CBA存在的問題，比如訓練方式和管理模式。這讓他在圈內(nèi)一直有爭議。

高橋美子這些年一直在他身邊。兩人結婚后生了兩個兒子和一個女兒。小女兒2016年出生，到2025年已經(jīng)9歲。大兒子早已成年。全家定居北京，生活平穩(wěn)。高橋美子父親早年在拉斯維加斯給過一套房子，幫助他們渡過經(jīng)濟難關。她入鄉(xiāng)隨俗，學會照顧家庭和支持馬健的事業(yè)。

如今2025年馬健56歲，身體保持得很好。他住在北京，經(jīng)常在社交平臺發(fā)健身視頻，肌肉線條還像當年打球時那么結實。白天他打理自己的公司，晚上固定做NBA解說，跟搭檔一起聊球，觀點尖銳但專業(yè)。粉絲喜歡他這種不拐彎的風格。