在全國眾多省級軍區(qū)中，防區(qū)面積最大的就是新疆軍區(qū)，這是因為新疆屬于我國最大的省份。

不僅如此，新疆軍區(qū)的轄區(qū)范圍還會涵蓋甘肅和西藏的部分區(qū)域，包括負責西藏西北端的阿里地區(qū)防務的阿里軍分區(qū)，以及負責甘肅和外蒙邊界防務的東風泉邊防連，都由新疆軍區(qū)管轄。

使得新疆軍區(qū)成為全國眾多省級軍區(qū)中，唯一一個防區(qū)范圍涵蓋三個省份的軍事單位。

從級別編制的角度說，新疆軍區(qū)自從1985年百萬大裁軍那一年成立伊始，就屬于兵團級，也就是副大軍區(qū)級，新疆軍區(qū)的司令員和政委是標配的中將，要比全國任何一個其他的省級軍區(qū)級別要高，其他的省級軍區(qū)皆屬于正軍級建制，無非是后來西藏軍區(qū)和北京衛(wèi)戍區(qū)的軍政主官高配副大軍區(qū)級而已。

既然新疆軍區(qū)防區(qū)面積最大、管轄的防區(qū)范圍最廣、級別編制最高，那么新疆軍區(qū)究竟由誰管呢？

首先在七大軍區(qū)時代，新疆軍區(qū)歸屬蘭州軍區(qū)管轄。

包括新疆軍區(qū)在內，全國各個省級軍區(qū)都是由所在大軍區(qū)管轄，根據(jù)大軍區(qū)所轄省份的數(shù)量，來決定下轄省級軍區(qū)的數(shù)量。

比如濟南軍區(qū)主管山東省和河南省兩個省的防務，那么濟南軍區(qū)就管轄解放軍山東省軍區(qū)、河南省軍區(qū)這2個省級軍區(qū)。

而新疆軍區(qū)所在的新疆屬于蘭州軍區(qū)的防務范圍，除了新疆之外，還有甘肅、青海、寧夏、陜西這4個省份也是蘭州軍區(qū)的防區(qū)，所以陜甘寧青四個省級軍區(qū)也都由蘭州軍區(qū)管轄。

新疆軍區(qū)的軍政主官，有時甚至會轉任蘭州軍區(qū)的主官副職或升任蘭州軍區(qū)的主官，比如新疆軍區(qū)司令員朱錦林中將在卸任后，就轉任蘭州軍區(qū)副司令員；還有新疆軍區(qū)政委劉雷中將，卸任后就直接升任蘭州軍區(qū)政委，這可被視為新疆軍區(qū)隸屬于蘭州軍區(qū)的一個佐證。

隨著軍改進程的開啟，七大軍區(qū)被撤番，并在此基礎上改制成立了新的五大戰(zhàn)區(qū)，根據(jù)戰(zhàn)區(qū)防區(qū)的重新分配，西部戰(zhàn)區(qū)領導指揮四川、甘肅、青海、寧夏、新疆、西藏、重慶共七省區(qū)市的武裝力量。

這是不是就意味著新疆軍區(qū)就轉隸到西部戰(zhàn)區(qū)序列呢？

實則不然。

西部戰(zhàn)區(qū)領導指揮川甘青寧疆藏渝七省區(qū)市的武裝力量，指的是領導指揮駐防所在省份的部隊，比如駐扎在青海西寧的陸軍76集團軍、駐扎在四川成都的77集團軍等等，并不代表西部戰(zhàn)區(qū)可以指揮這七個省份的所有省級軍區(qū)。

一方面，省級軍區(qū)在軍區(qū)改戰(zhàn)區(qū)的軍改進程中，絕大部分都改變了隸屬關系，專門把總參的動員部單拎出來升格改制成副戰(zhàn)區(qū)級的軍委國防動員部，成為軍委直轄的15個職能部門之一，作為省級軍區(qū)的直接領導部門。

這就意味著，全國眾多省級軍區(qū)，歸屬于國防動員部管轄，而非所在戰(zhàn)區(qū)管轄，畢竟國防動員部和戰(zhàn)區(qū)也沒有直接隸屬關系。

但新疆軍區(qū)、西藏軍區(qū)、北京衛(wèi)戍區(qū)這三個省級軍區(qū)除外，它們因承擔作戰(zhàn)任務，被視為一支作戰(zhàn)勁旅，又不納入非作戰(zhàn)領導機關的國防動員部序列。

另一方面，全國絕大部分的省級軍區(qū)僅僅是作為國防動員單位，承擔國防動員、退役安置、征兵宣傳等非戰(zhàn)性職能，不再下轄作戰(zhàn)部隊了，比如浙江省軍區(qū)舟山警備區(qū)所屬的數(shù)個海防團和船運大隊就轉隸到東部戰(zhàn)區(qū)陸軍，改制為海防某旅；黑龍江省軍區(qū)下轄的某邊防團和烏蘇里江巡邏艇大隊轉隸到北部戰(zhàn)區(qū)陸軍，改制為邊防某旅等等。

縱覽全國，只有承擔作戰(zhàn)任務的京疆藏三個履行作戰(zhàn)任務的省級軍區(qū)還下轄有作戰(zhàn)部隊。

其中新疆軍區(qū)，幾乎擁有陸軍集團軍所有的編制兵力，比如新疆軍區(qū)特戰(zhàn)旅、陸航旅、防空旅、汽車運輸旅、炮兵旅等等，這都是陸軍集團軍才有的兵力配置，某種程度上說新疆軍區(qū)就是一種特殊的陸軍集團軍。

可見，新疆軍區(qū)既下轄有作戰(zhàn)部隊，還不納入國防動員部管轄，似乎更貼近戰(zhàn)區(qū)對所轄防區(qū)所定義的領導指揮轄區(qū)境內武裝力量的標準，應該接受西部戰(zhàn)區(qū)管轄才對。

實際上，新疆軍區(qū)是接受新疆黨委和陸軍的雙重領導。

一來，新疆軍區(qū)雖說都是陸軍部隊，且和陸軍集團軍有相似的兵力配置，但新疆軍區(qū)畢竟是標準的副戰(zhàn)區(qū)級單位，級別要比陸軍集團軍高，不可能接受同級的西部戰(zhàn)區(qū)陸軍領導機關指揮，所以新疆軍區(qū)和西藏軍區(qū)、北京衛(wèi)戍區(qū)這三支部隊納入陸軍序列，不歸屬所屬戰(zhàn)區(qū)陸軍管轄，直接由陸軍總部領導，況且五大戰(zhàn)區(qū)陸軍也屬于陸軍總部領導。

二來，新疆軍區(qū)在承擔作戰(zhàn)任務的同時，還需履行已經(jīng)轉隸到國防動員部的那些省級軍區(qū)所承擔的國防動員職能，充當所在省級黨委的軍事部、省級政府的兵役部，以至于新疆軍區(qū)也會有一位司令員或政委，被選為新疆的自治區(qū)黨委常委，即“戎裝常委”，這和其他那些沒有作戰(zhàn)功能的省級軍區(qū)是一樣的安排。

當然了，新疆軍區(qū)再怎么說也是擁有雄厚作戰(zhàn)能力的野戰(zhàn)部隊，一旦到了戰(zhàn)時，其地處西北邊疆，在西部戰(zhàn)區(qū)的防區(qū)內，仍得服從西部戰(zhàn)區(qū)的軍事部署。