在2018年公安邊防部隊轉(zhuǎn)制調(diào)整之前，廣東省內(nèi)同時駐有4個出入境邊防檢查總站和廣東省公安邊防總隊，而這4個出入境邊防檢查總站原先其實也是廣東省公安邊防總隊的組成部分。只不過在1998年7月3日，根據(jù)《國務(wù)院關(guān)于北京等九城市邊防檢查職業(yè)化改革試點方案的批復(fù)》（國函[1997]76號），北京、天津、上海、廣州、深圳、珠海、廈門、?？?、汕頭九座城市邊防檢查機構(gòu)人員編制由現(xiàn)役制改編為職業(yè)制人民警察，著人民警察制服，并在各城市組建副廳級的出入境邊防檢查總站，改由公安部出入境管理局直接領(lǐng)導(dǎo)管理。

上述9城市出入境邊檢總站依法擔(dān)負(fù)著國家設(shè)在上述城市對外開放口岸的出入境邊防檢查任務(wù)，依法對出入境人員及其攜帶的行李物品、交通運輸工具及其載運的貨物進(jìn)行檢查和監(jiān)護，致力于打擊出入境違法犯罪活動，維護國家主權(quán)、安全和正常的出入境秩序。

至于其余各省、自治區(qū)、直轄市的邊檢機構(gòu)人員編制依然為現(xiàn)役制（隸屬公安邊防部隊），統(tǒng)一著武警制服，享受現(xiàn)役人員的待遇，由公安部邊防管理局統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)管理，但公安部出入境管理局可實施業(yè)務(wù)指導(dǎo)。但需要說明的是，兩支邊檢人員隊伍雖然在編制體制、身份、著裝、待遇等方面有較大差異，但他們所承擔(dān)的職責(zé)任務(wù)以及在口岸的執(zhí)法權(quán)限和方式卻是完全相同的。

到了2011年，根據(jù)中央編辦《關(guān)于調(diào)整北京等七個職業(yè)制邊防檢查總站機構(gòu)規(guī)定的批復(fù)》（中央編辦復(fù)字 [2011]54號），除汕頭、?？谥獾?個城市出入境邊防檢查總站從副廳級升格為正廳級。

2018年3月，黨中央決策部署，科學(xué)界定劃轉(zhuǎn)國家移民管理系統(tǒng)的公安邊防部隊職能、機構(gòu)、人員，穩(wěn)步實施轉(zhuǎn)隸官兵轉(zhuǎn)改定級、評授警銜，從符合條件士兵中招錄人民警察和工勤人員，隊伍管理、勤務(wù)組織和后勤保障由現(xiàn)役制模式調(diào)整為公安機關(guān)職業(yè)制人民警察模式。改革中，公安邊防部隊體制機制重塑，力量結(jié)構(gòu)實現(xiàn)重構(gòu)、整體面貌煥然一新，完成了朝革命化、正規(guī)化、專業(yè)化、職業(yè)化執(zhí)法隊伍建設(shè)方向的迅速轉(zhuǎn)變。

至2018年12月31日，全國所有出入境邊防檢查站完成警察職業(yè)化改革，統(tǒng)一劃歸國家移民管理局管理。2019年1月1日，調(diào)整后新組建的33個出入境邊檢總站按照新的編制體制運行，并且建立了權(quán)責(zé)明晰、協(xié)作順暢、執(zhí)行有效的現(xiàn)代化移民治理體系，國家移民管理隊伍自此踏上新征程。

但在此過程中，原“廣州、深圳、珠海、汕頭”出入境邊防檢查總站調(diào)整優(yōu)化為如今的“廣州、深圳、珠?！背鋈刖尺叿罊z查總站，數(shù)量由4降為了3，使得力量進(jìn)一步集中、資源進(jìn)一步整合，從而更好的服務(wù)廣東地區(qū)的出入境管理服務(wù)事業(yè)。因為汕頭出入境邊檢總站于2018年改革中被撤銷、整合并入深圳邊檢總站；如此一來，深圳邊檢總站便承擔(dān)深圳、汕頭、惠州、梅州、汕尾、潮州、揭陽等7個城市共計39個對外開放口岸的出入境邊防檢查任務(wù)。

值得一提的是，廣東是目前大陸地區(qū)31個省份中唯一同時駐有3個出入境邊防檢查總站的省份，這是非常特殊的。實際上這也很好理解，畢竟廣東可是我國首屈一指的對外開放大省、外貿(mào)大省、出入境大省，同時也是我國改革開放的排頭兵、先行地、實驗區(qū)，其外貿(mào)進(jìn)出口總額連續(xù)39年居全國首位。直至現(xiàn)在，廣東仍在舉全省之力高水平推進(jìn)“五外聯(lián)動”（即深化外貿(mào)、外資、外包、外經(jīng)、外智“五外聯(lián)動”全方位改革），堅定不移的擴大高水平對外開放，不斷在高水平開放中贏得優(yōu)勢、贏得主動、贏得未來。

也正因如此，海關(guān)總署在廣東省不僅單獨設(shè)有正廳級的海關(guān)總署廣東分署，而且還同時在廣東省內(nèi)設(shè)立了7個正廳級直屬海關(guān)，具體分別是廣州海關(guān)、深圳海關(guān)、拱北海關(guān)、汕頭海關(guān)、黃埔海關(guān)、江門海關(guān)和湛江海關(guān)，各自管理各自的關(guān)區(qū)。

其中，海關(guān)總署廣東分署是海關(guān)總署直接領(lǐng)導(dǎo)的正廳局級派出機構(gòu)，現(xiàn)設(shè)有副廳級機構(gòu)（緝私局）1個、正處級機構(gòu)15個、事業(yè)單位1個，并受海關(guān)總署委托管理全國海關(guān)信息中心廣東分中心（副廳局級），以及主要承擔(dān)協(xié)調(diào)、組織實施廣東省內(nèi)海關(guān)之間的工作關(guān)系和業(yè)務(wù)運作，推動廣東省內(nèi)海關(guān)實施跨關(guān)區(qū)業(yè)務(wù)改革等工作。