睢杞太抗日根據(jù)地堪稱平原抗日根據(jù)地的典范。共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)的抗日武裝，在開封、商丘、周口都有日軍重兵駐守的情況下，在此堅持近八年的抗戰(zhàn)，紅旗不倒。

1938年5月31日睢縣、6月3日杞縣、6月6日太康縣相繼淪陷后，三縣黨組織在以吳芝圃為首的豫東特委領(lǐng)導(dǎo)下建立了抗日武裝。

1938年6月10日，根據(jù)河南省委“盡快把分散的武裝集中起來，建立一支較強的武裝隊伍，發(fā)展游擊戰(zhàn)爭”的指示，睢、杞兩縣抗日武裝在杞縣南部大鄭莊合編為睢杞抗日游擊大隊。吳芝圃任黨代表，統(tǒng)一調(diào)動指揮部隊，王海山任大隊長負責(zé)軍事訓(xùn)練和指揮。

1938年7月初，在杞縣傅集鎮(zhèn)吳芝圃主持召開軍政會議，決定將睢杞太三縣武裝整編為豫東抗日游擊第三支隊（簡稱“三支隊”）。司令員吳芝圃，副司令員兼參謀長王海山、孟海若，政治部主任王靜敏。

三支隊下轄3個大隊和1個特務(wù)中隊（警衛(wèi)連）；一大隊由一中隊擴編而成，譚志政任大隊長，不久由杜隸生繼任，王靜敏兼政委；二大隊由二中隊擴編而成，張輯五任大隊長兼政委；三大隊由睢縣姜朗山等游擊隊擴編而成，姜朗山任大隊長，政委鄧海望，特務(wù)中隊長苗澤生。三支隊很快發(fā)展到1000多人。

此外，共產(chǎn)黨的統(tǒng)戰(zhàn)武裝睢縣原國民黨西陵區(qū)李壽山的區(qū)隊也迅速擴大為“二團隊”，下轄3個大隊，共產(chǎn)黨員王鴻鈞任黨代表，也擴大到1500多人槍。

1938年9月中旬，中共河南省委根據(jù)中共中央和長江局，“應(yīng)將工作重心移向豫東，創(chuàng)造豫皖蘇魯邊新局面”的指示，令三支隊西進西華、扶溝一線待命，準備與東進的彭雪楓部會師。

10月10日，彭雪楓在西華主持召開中共豫東特委擴大會議，決定西華人民抗日自衛(wèi)軍在當?shù)貓猿侄窢?，其他三支隊伍合編為新四軍游擊支隊?2日，在杜崗舉行了慶祝會師大會，宣布新四軍游擊支隊正式成立。彭雪楓任司令員兼政委，吳芝圃任副司令員，張震任參謀長，肖望東任政治部主任。支隊下轄3個大隊、1個特務(wù)連、1個通信排。

新四軍游擊支隊中睢縣武裝占了一半。睢縣留下堅持斗爭的孫其昌又組織起起100多人的抗日武裝，杞縣杜省吾也聯(lián)系王秉章、徐敬詩、許如壁，組織起200多人的抗日武裝與李壽山的“二團隊”一起分別開展游擊戰(zhàn)爭打擊敵人。

11月22日，正值日、偽在睢杞太猖狂之際，彭雪楓率領(lǐng)剛合編的游擊支隊回師睢杞太。12月上旬，游擊支隊完成既定目標后，揮師東進，留下馬慶華等數(shù)10人配合地方武裝堅持斗爭。

1939年2月上旬，為發(fā)展睢杞太地區(qū)，擴大武裝，籌集經(jīng)費，迎接中共中央派往豫皖蘇邊區(qū)的干部，吳芝圃率游擊支隊三大隊及特務(wù)連再次回師睢杞太。他們與護送干部的冀魯豫支隊會師后，對睢杞太地區(qū)的日偽頑勢力以沉重打擊。1939年3月，吳芝圃率部撤回豫皖蘇邊區(qū)，楊得志率部撤回冀魯豫。

4月，豫皖蘇邊黨委決定在睢杞太中心縣委的基礎(chǔ)上建立睢杞太特委，馬慶華任特委書記。同時，成立特委直接領(lǐng)導(dǎo)的睢杞太獨立大隊，大隊長馮敬宇（后換馮勝），政委馬慶華（后換張先舟）。睢杞太獨立大隊到王秉章接任大隊長時，已發(fā)展到4個中隊400多人槍。

8月，原三支隊副司令員孟海若從陜北學(xué)習(xí)歸來，組建睢杞太獨立二大隊，任大隊長、政治指導(dǎo)員劉建民，下轄三個中隊300多人槍。10月，中共豫東特委代理書記王其梅率西華農(nóng)民自衛(wèi)軍2個連東渡黃河開往睢杞太地區(qū)，組建三大隊，大隊長王其梅，教導(dǎo)員劉萌光，下轄2個中隊，約180人槍。

1940年1月1日，中共豫東特委（1940年1月后改為睢杞太地委）在杞縣南部谷熟崗一帶召開整編大會，特委書記韓達生主持會議。會議宣布將睢杞太3個獨立大隊合編為新四軍六支隊睢杞獨立團。藍僑任團長兼政委，張先舟任政治處主任。

6月，豫皖蘇區(qū)黨委建立睢杞太軍政委員會，睢杞獨立團改為睢杞太獨立團。7月，新四軍6支隊任命孔石泉為睢杞太軍政委員會書記兼獨立團政委。

9月，睢杞太獨立團主力進入黃泛區(qū)（太康以西馬屯），建立了水上根據(jù)地，并相繼建立了民主政權(quán)、后方醫(yī)院、光明日報、光明話劇團、被服廠和干部集訓(xùn)隊等。

經(jīng)過葛崗、邢口、白廟、西陵、瓦崗等百余次戰(zhàn)斗，睢杞太獨立團不斷發(fā)展壯大，全團達2300余人。另外，還有睢縣、杞縣、太康縣3縣的獨立大隊700余人。睢杞太地區(qū)的抗日斗爭在日偽軍的包圍中頑強發(fā)展。

1941年2月初，藍僑、孔石泉率領(lǐng)的睢杞太獨立團東移到永城南藕坑李村。3月初，睢杞太地區(qū)抗日斗爭形勢嚴峻，睢杞太地委在杞縣東南部申紀村召開緊急擴大會議，決定重建水東地委和水東獨立團。

1942年1月，冀魯豫軍區(qū)派林耀斌任獨立團團長，王其梅仍兼政委。12月，水東黨政軍委員會撤銷，設(shè)立水東地委，唐克威任水東地委書記兼水東獨立團政委，韓明任副政委，陳子植任參謀長。