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深度科學(xué)| Nat. Chem.: 銥催化復(fù)雜多取代吡啶氫化,實現(xiàn)含敏感基團(tuán)藥物分子的后期修飾

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編者語:

新型銥催化離子氫化策略,在溫和條件下將吡啶環(huán)高選擇性轉(zhuǎn)化為哌啶環(huán),為創(chuàng)新藥物研發(fā)開辟新途徑。

01


背景介紹

藥物分子中,碳原子和氮原子可以連接成各種環(huán)狀結(jié)構(gòu),這些結(jié)構(gòu)是藥物發(fā)揮作用的核心骨架。其中,含氮的六元環(huán),吡啶環(huán)和哌啶環(huán)尤為重要。統(tǒng)計顯示,超過80%的美國FDA批準(zhǔn)的小分子藥物都含有氮雜環(huán)(圖1),而吡啶和哌啶正是其中最常見的兩種。這兩種環(huán)雖然原子組成相似,但性質(zhì)迥異。吡啶環(huán)是平面的芳香環(huán),結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,但剛性較強(qiáng),在體內(nèi)代謝過程中可能不夠靈活。哌啶環(huán)是三維的飽和環(huán),具有更高的sp3碳含量,構(gòu)象更靈活,能更好地與生物靶點結(jié)合,通常具有更高的臨床成功率。

因此,將藥物分子中的吡啶環(huán)轉(zhuǎn)化為哌啶環(huán)(即“環(huán)飽和化”),是優(yōu)化藥物性質(zhì)(如提高活性、改善代謝穩(wěn)定性、降低毒性)的一種重要策略。然而,傳統(tǒng)的催化氫化方法通常需要苛刻的條件(如高溫、高壓、強(qiáng)酸),并且像“爆破”一樣缺乏選擇性,會破壞藥物分子中常見的其他敏感基團(tuán)(如硝基、氰基、烯烴、炔烴、鹵素等),導(dǎo)致整個分子“癱瘓”。開發(fā)一種溫和條件下精準(zhǔn)氫化吡啶環(huán),同時完美保留其他一切敏感官能團(tuán)的方法,一直是合成化學(xué)家夢寐以求的目標(biāo)。


1. 一些含哌啶環(huán)的藥物分子

2025年12月02日,瑞士洛桑聯(lián)邦理工學(xué)院(EPFL)的Arthur Despois和 Nicolai Cramer兩人在Nature Chemistry期刊發(fā)表題為“Iridium(III)-catalysed ionic hydrogenation of pyridines to multisubstituted piperidines”的研究論文。該研究開發(fā)了一種高效、高選擇性的銥(III)催化離子氫化方法,能夠在溫和條件下將多種取代(硝基、疊氮、鹵素、烯基、炔基等多種易還原基團(tuán))的吡啶直接轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的多取代哌啶(圖2,催化劑用量可低至0.05 mol%,并可放大至十克級規(guī)模。研究還成功將該方法應(yīng)用于多種已上市藥物的吡啶基團(tuán)后期氫化,展示了其在復(fù)雜分子修飾中的強(qiáng)大潛力。


2. 圖文總覽

02


圖文解析

1.核心設(shè)計:從“協(xié)同氫化”到“分步離子氫化”

傳統(tǒng)路徑(協(xié)同氫化),催化劑同時活化氫分子(H2),將兩個氫原子“協(xié)同”加到吡啶環(huán)上。此過程對催化劑活性要求高,容易“誤傷”其他可還原基團(tuán)。新路徑(離子氫化)(圖3d),將加氫過程“分步”進(jìn)行:

1)質(zhì)子化:布朗斯特酸(如TFA)先提供質(zhì)子(H+),與吡啶的氮原子結(jié)合,生成活性的吡啶鹽。這一步破壞了吡啶的芳香穩(wěn)定性,使其更容易被還原。

2)氫負(fù)離子進(jìn)攻:銥催化劑活化H2,生成活性的銥-氫負(fù)離子物種([Ir-H]),“精確制導(dǎo)”地將氫負(fù)離子(H-)傳遞給已被活化的吡啶鹽陽離子。


3. 哌啶結(jié)構(gòu)單元的藥學(xué)意義及其通過選擇性加氫合成的方法

傳統(tǒng)氫化好比用“大錘砸鎖”,而新方法則像用“鑰匙開鎖”。其核心機(jī)制在于反應(yīng)路徑的根本性改變。這種“先質(zhì)子化,再氫負(fù)離子加成”的離子機(jī)制,是實現(xiàn)超高選擇性的關(guān)鍵。因為它只針對已經(jīng)被酸活化的、帶正電的吡啶鹽進(jìn)行反應(yīng),而對中性的、未被活化的敏感基團(tuán)(如硝基、烯烴)“視而不見”。

2.卓越性能:令人驚嘆的官能團(tuán)耐受性

研究團(tuán)隊展示了極其廣泛的底物范圍(>90個例子),幾乎所有常見的、易還原的官能團(tuán)都能在反應(yīng)中安然無恙。如圖4和5所示,該方法可以耐受的“敏感”基團(tuán)包括:

(1)硝基、疊氮基:通常極易被還原,但在此條件下完全不受影響。

(2)鹵素(氯、溴、碘):避免了通常難以避免的脫鹵副反應(yīng)。

(3)不飽和鍵(烯烴、炔烴):不會被加氫,保留了進(jìn)行后續(xù)衍生化的“把手”。

(4)芐位敏感基團(tuán)(芐醇、芐氯):也能穩(wěn)定存在。

這種廣泛的耐受性使得化學(xué)家能夠合成出以前難以獲得、具有新穎取代模式的多取代哌啶分子,極大地擴(kuò)展了可用的化學(xué)空間。


4. 單取代吡啶的氫化反應(yīng)


5. 多取代吡啶加氫反應(yīng)的應(yīng)用范圍

3.實際應(yīng)用:對真實藥物分子進(jìn)行“后期修飾”

研究人員直接對幾種已上市的藥物分子(如抗皮炎藥羅氟司特、抗腫瘤藥培西達(dá)替尼)進(jìn)行研究,僅選擇性地將其分子中的吡啶環(huán)氫化為哌啶環(huán),而分子其他部分(包括更復(fù)雜的環(huán)丙基、吲哚等結(jié)構(gòu))均完好無損(圖6)。例如,對培西達(dá)替尼(含有三個不同的吡啶單元)的氫化,催化劑能精準(zhǔn)識別并只還原其中電子云密度最低的一個吡啶環(huán),展現(xiàn)了驚人的區(qū)域選擇性。這為快速生成一系列結(jié)構(gòu)新穎的哌啶類化合物庫,用于藥物構(gòu)效關(guān)系研究提供了強(qiáng)大工具。


6. 復(fù)雜吡啶化合物的氫化反應(yīng)

4.實用性與可擴(kuò)展性

該方法在室溫或略高于室溫下進(jìn)行,氫氣壓力適中。銥催化劑用量極低(可至0.05 mol%),且對空氣和水穩(wěn)定,無需手套箱等特殊設(shè)備,大大降低了使用門檻。產(chǎn)物以穩(wěn)定的哌啶鹽酸鹽形式析出,無需復(fù)雜的柱色譜純化,通過簡單過濾即可獲得高純度產(chǎn)品。研究成功進(jìn)行了十克級的放大實驗(圖7),證明了其工業(yè)應(yīng)用的潛力。


7. 規(guī)?;a(chǎn)和下游轉(zhuǎn)化

03


總結(jié)

該研究通過離子氫化路徑,巧妙地改變了反應(yīng)的本質(zhì),提供了一種普適、高效、高選擇性的工具,能夠直接將吡啶轉(zhuǎn)化為哌啶,并完美保留絕大多數(shù)敏感官能團(tuán)。其卓越的官能團(tuán)耐受性和出色的后期修飾能力,使其成為藥物化學(xué)家工具箱中的“利器”,能夠快速、高效地合成大量結(jié)構(gòu)多樣且富含sp3碳的哌啶類化合物,用于藥物發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化。

04


展望(巨人肩上前行)

1. 開發(fā)手性銥催化劑,實現(xiàn)不對稱離子氫化;

2. 應(yīng)用于其他具有芳香性的氮雜環(huán)(如嘧啶、喹啉、異喹啉等)的選擇性氫化。

文獻(xiàn)信息

Arthur Despois & Nicolai Cramer, Iridium(III)-catalysed ionic hydrogenation of pyridines to multisubstituted piperidines, Nature Chemistry, 2025, https://doi.org/10.1038/s41557-025-02008-2

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