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專欄 | 小分子環(huán):硫雜環(huán)丁烷的 “三位一體” 魔力,被忽視的潛力分子砌塊

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聊砌塊,說化學(xué)

環(huán)丁烷、、等已廣泛應(yīng)用于藥物管線,但含硫四元環(huán) —— 硫雜環(huán)丁烷化合物,卻因合成瓶頸長期被忽視。本文介紹一種穩(wěn)健且可規(guī)?;暮铣善脚_,以易獲取的硫雜環(huán)丁烷-3-酮和表硫氯醇為起始原料,成功制備出涵蓋 S(II)、S(IV)、S(VI) 三種硫氧化態(tài)的多樣化 3-取代和 3,3-二取代雜環(huán)丁烷構(gòu)建塊。


揭示了硫氧化態(tài)對化合物親脂性、酸堿性的調(diào)控規(guī)律:

  • S(II) 類接近環(huán)丁烷,S(IV) 和 S(VI) 類極性更高、親脂性更低

  • 通過合成上市藥物磺胺醋酰的雜環(huán)丁烷類似物驗證了其藥用價值

  • 為現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)提供了新工具。


關(guān)鍵詞:硫雜環(huán)丁烷、氧雜環(huán)丁烷、氮雜環(huán)丁烷

DIO:10.26434/chemrxiv-2025-scr74

硫雜環(huán)丁烷化合物的特殊性

已從實驗室的 “潛力藥效團” 邁入臨床應(yīng)用階段,目前已有 1 款獲批藥物(Rilzabrutinib、9 款臨床候選藥物、2 款工具化合物及 3 款 2024 年新披露先導(dǎo)化合物含氧化雜環(huán)丁烷。砌塊化學(xué)已對氧雜環(huán)丁烷進行多次介紹,點擊下圖查看。

近十年來在藥物發(fā)現(xiàn)中變得越來越流行,目前至少有七種已批準(zhǔn)的藥物含有氮雜環(huán)丁烷殘基,數(shù)十種其他含氮雜環(huán)丁烷的生物活性分子正處于不同的臨床試驗階段。點擊下圖查看對氮雜環(huán)丁烷的具體介紹。

硫雜環(huán)丁烷長期被藥物研發(fā)忽視,但文獻中存在多種具有生物活性的衍生物,如二肽甜味劑阿力甜、RORγt 反向激動劑、EZH2 抑制劑、FAP 抑制劑、殺蟲劑等。


  • 硫原子的低電負(fù)性和大尺寸使硫雜環(huán)丁烷應(yīng)變更低,比氧雜環(huán)丁烷、氮雜環(huán)丁烷更穩(wěn)定,不易發(fā)生開環(huán)反應(yīng)

  • 硫原子可發(fā)生氧化還原反應(yīng),形成 S(II)、S(IV)、S(VI) 三種氧化態(tài),有望通過調(diào)節(jié)氧化態(tài)精細(xì)調(diào)控化合物理化性質(zhì),成為 “三位一體” 的多樣化工具。


之前介紹過一種光催化反應(yīng),經(jīng)一步反應(yīng),氧代環(huán)丁烷中氧原子可轉(zhuǎn)變?yōu)榈?、硫原子等(O→S、O→N、O→C),用于藥物后期官能化,簡化復(fù)雜藥物合成。

氧/氮雜環(huán)丁烷往期匯總

突破合成瓶頸:規(guī)模化構(gòu)建多樣化庫

以兩種易獲取的起始原料 ——3-酮基硫雜環(huán)丁烷(可公斤級購買) 和表硫氯醇為核心,設(shè)計了多條高效合成路徑,成功制備出 3-取代、3,3-二取代硫雜環(huán)丁烷衍生物,涵蓋羧酸、胺、肼、醇、烷基鹵、磺酰鹵等多種功能類型,且實現(xiàn)硫氧化態(tài)的精準(zhǔn)調(diào)控。



S(VI) 取代衍生物合成

以 3-酮基硫雜環(huán)丁烷為起點,經(jīng) NaBH4還原得醇,再用

m
CPBA 氧化為 S(VI) 態(tài)砜。砜經(jīng)甲磺?;?,通過不同親核取代反應(yīng),高效制備 N-甲基胺、肼、磺酰氯、磺酰氟等衍生物,關(guān)鍵步驟收率最高達 97%,合成路徑高效且產(chǎn)物多樣。


含氮硫雜環(huán)丁烷制備

以 3-酮基硫雜環(huán)丁烷為原料,通過還原胺化、與 Boc-肼反應(yīng)分別制備 S(II) 態(tài)胺和肼;再以 S(II) 態(tài)胺為前體,經(jīng) NaIO4選擇性氧化與脫保護,獲得 S(IV) 態(tài)亞砜胺,解決了傳統(tǒng)方法規(guī)模化難的問題。


S(IV/VI) 羧酸衍生物合成

以表硫氯醇為起始物,與氰化鉀反應(yīng)生成腈,經(jīng)堿性水解得羧酸(可酯化)。通過調(diào)控

m
CPBA 用量實現(xiàn)氧化態(tài)可控,1.1 eq得 S(IV) 態(tài)亞砜羧酸,過量得 S(VI) 態(tài)砜羧酸, 為極性可調(diào)的羧酸類構(gòu)建塊提供合成路徑 。


羧基功能化轉(zhuǎn)化

3-羧基硫雜環(huán)丁烷經(jīng) BH3還原為醇,mCPBA 氧化為砜醇。砜醇經(jīng)甲磺?;罨?,與鹵離子親核取代得溴化物、碘化物等烷基化試劑,還可與甲胺反應(yīng)制備 N-甲基胺,驗證了合成策略的通用性。


同源醇 / 胺合成

3-羧基硫雜環(huán)丁烷轉(zhuǎn)化為 Weinreb 酰胺,與格氏試劑反應(yīng)生成酮中間體。以酮為基礎(chǔ),經(jīng)還原得 S(II)、S(VI) 態(tài)次級醇,經(jīng)胺化得同源胺,豐富硫雜環(huán)丁烷構(gòu)建塊的結(jié)構(gòu)與功能多樣性。


Wittig 反應(yīng)同源化

3-酮基硫雜環(huán)丁烷與穩(wěn)定葉立德經(jīng) Wittig 反應(yīng),生成 α,β-不飽和酯和丙烯腈。丙烯腈經(jīng)還原、水解得硫雜環(huán)丁基乙酸,再氧化為 S(VI) 態(tài)砜羧酸;腈還可還原為胺并進一步氧化,獲得 S(VI) 態(tài)胺類同源衍生物。


硫雜環(huán)丁基乙酸衍生

以硫雜環(huán)丁基乙酸為原料,經(jīng)硼烷還原得醇,mCPBA 氧化為 S(VI) 態(tài)砜醇。砜醇通過親核取代等反應(yīng),成功制備溴化物和磺酰氯,實現(xiàn)了羧酸類前體向不同功能基團的高效轉(zhuǎn)化


3,3-二取代硫雜環(huán)丁烷

針對3,3-二取代衍生物,以腈類為原料,經(jīng)脫質(zhì)子-烷基化在 C(3) 位引入甲基,得到 3,3-二取代腈。該產(chǎn)物經(jīng)水解得羧酸,經(jīng) Curtius 重排得伯胺,構(gòu)建了完整的 3,3-二取代衍生物合成鏈條。


3-甲基取代硫雜環(huán)丁烷

氧雜環(huán)丁烷經(jīng) HBr 開環(huán)、分子內(nèi) S-烷基化環(huán)化得醇。醇經(jīng)甲磺?;?、親核取代得疊氮化物,氧化為 S(VI) 態(tài)砜后,催化氫化還原疊氮基得胺,開發(fā)了簡潔合成路線,步驟精簡且反應(yīng)高效。


此外,經(jīng)一步光催化反應(yīng),氧代環(huán)丁烷中氧原子可轉(zhuǎn)變?yōu)榈?、硫原子等(O→S、O→N、O→C),用于藥物后期官能化,簡化復(fù)雜藥物合成。

S (VI) 甲基胺鹽酸鹽

3-甲基取代醇經(jīng)兩步氧化得 S(VI) 態(tài)羧酸,通過改良的 DPPA 介導(dǎo) Curtius 重排,經(jīng)酸性后處理得胺鹽酸鹽。該路徑彌補了傳統(tǒng)二醇環(huán)化法產(chǎn)率低的缺陷,為 3-甲基-3-取代 S(VI) 態(tài)胺提供可靠方案。


3-甲基醇功能化

以 3-甲基取代醇為中間體,經(jīng)甲磺酰化活化羥基,再通過親核取代引入硫醇基團,或經(jīng)特定氧化轉(zhuǎn)化為磺酰氯。高效制備出溴化物、硫醇、磺酰氯三種功能差異化衍生物,豐富了 3,3-二取代構(gòu)建塊庫。


藥用價值證明

為驗證藥用價值,將 3,3-二取代硫雜環(huán)丁烷胺引入抗菌藥物磺胺醋酰結(jié)構(gòu)。通過胺與對硝基苯磺酰氯磺化,再根據(jù)硫氧化態(tài)選擇 Zn/NH4Cl 或 Pd 催化氫化還原硝基,成功制備出磺胺醋酰的異電子等排類似物。



理化性質(zhì)揭秘:“氧化態(tài)” 決定功能定位

為明確硫雜環(huán)丁烷化合物的應(yīng)用價值,研究團隊將其與藥物研發(fā)中常用的氧雜環(huán)丁烷、N-甲基氮雜環(huán)丁烷、環(huán)丁烷類似物進行系統(tǒng)對比,重點研究了 pKa和 LogD兩項關(guān)鍵理化指標(biāo),揭示了清晰的結(jié)構(gòu)-性質(zhì)關(guān)系:

酸堿度

在酸堿性方面,硫氧化態(tài)升高會導(dǎo)致羧酸酸性增強、胺堿性減弱。

羧酸類:S(VI) 態(tài)砜羧酸 pKa 低至 3.22,S(IV) 態(tài)亞砜羧酸 pKa=3.72,均強于氧雜環(huán)丁烷羧酸,酸性增強有助于改善化合物水溶性和生物利用度。

胺類:S(VI) 態(tài)砜胺 pKa=5.41,較環(huán)丁烷胺降低超 4 個單位;S(II) 態(tài)胺堿性與其他雜環(huán)胺接近,可通過調(diào)節(jié)氧化態(tài)精準(zhǔn)控制胺基的堿性強度。


親脂性

S(II) 態(tài)硫雜環(huán)丁烷:LogD 值為 1.87,與環(huán)丁烷高度接近,可作為(環(huán))烷烴類似物在藥物設(shè)計中使用

S(IV)/(VI)態(tài)亞砜:S(IV) 態(tài)亞砜(LogD=0.4)和 S(VI) 態(tài)砜(LogD=0.7)的親脂性顯著降低,且均低于以高親水性著稱的氧雜環(huán)丁烷(LogD=0.8),極性優(yōu)勢突出,適用于需要改善水溶性的藥物分子設(shè)計。


總結(jié)


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