1937年8月13日，上海打響了淞滬會戰(zhàn)。9月，焦急害怕的李秀英隨兄先期回到南京。 11月13日，日軍占領(lǐng)了上海。緊接著，日軍分兵三路進(jìn)攻南京。

1937年12月13日，南京淪陷，日軍對南京進(jìn)行分區(qū)圍剿，開始了為期6周的南京大屠殺。當(dāng)時德國人拉貝等國際友人在南京市中心設(shè)立了方圓3.86平方公里的國際安全區(qū)，庇護(hù)中國難民。李秀英的父親將女兒安置到自以為安全的五臺山小學(xué)的一個地下室里。

12月19號，一車日本兵開到了五臺山小學(xué)，他們下車后直奔李秀英她們藏身的地下室。他們沖進(jìn)去就把婦女往外拖，陸李秀英雖然挺著大肚子，但因年輕，也沒逃過，被他們往車上拖。陸李秀英當(dāng)時想，如果被他們糟蹋死，還不如自己先死了干脆，她連猶豫一下都沒有，就一頭撞到墻上。李秀英撞昏后，被周圍的難民救起，重新安置到地下室里。

晚上天快黑時，又有三個日本兵直沖到婦女的房間來。一個日本兵撲上來欲強(qiáng)暴陸李秀英，他身上的軍刀因?yàn)閺澫卵侗鷽_下，李秀英一把將刀把抓住。他和李秀英爭奪時就喊叫同伴，另兩個日本兵就拔出刺刀，一邊一個向李秀英沖來。李秀英死命抓住刀把，那個企圖強(qiáng)暴她的日本兵掙脫不開，一直擋在她的身前，她就用全力推搡他以抵擋刺過來的刀。在左右搖晃中，兇殘的日本兵戳到了陸李秀英的腿，李秀英人仍堅強(qiáng)地反抗著，沒有倒下。他們又戳她的臉，李秀英臉上的血嘩嘩地直淌下來……。

最后終因失血多，李秀英體力漸弱，被日本兵的刺刀刺中肚子，這是最深、最重的一刀，李秀英松開了手，倒在了血泊中……。日本兵以為她死了，這才揚(yáng)長而去。

馬吉牧師在實(shí)地拍攝的《南京暴行紀(jì)實(shí)》影像中，有治療李秀英的畫面。

12月22日，拉貝在日記中這樣描述日本兵在南京國際安全區(qū)的這一暴行：“12月19日下午，一名日本士兵在美國學(xué)校（五臺山）試圖強(qiáng)奸一名懷有6個半月身孕的19歲的中國女子，當(dāng)女子反抗時，日本士兵手執(zhí)匕首或是刺刀向她襲擊。該女子胸部和臉部有10處刀傷，腿上也有數(shù)處刀傷，下身有一個很深的刀傷，胎兒的心跳已經(jīng)聽不見。該女子目前被安置在大學(xué)醫(yī)院�！�

1946年10月19日下午3時，平民陸李秀英也被國民政府國防部審判戰(zhàn)犯的軍事法庭傳訊入庭。在中國第二歷史檔案館館藏戰(zhàn)爭罪犯處理委員會檔案上是這樣記載的：

“中華民國三十五年度（1946年）偵字第號谷壽夫戰(zhàn)犯一案于三十五年十月十九日下午三時在本庭訊問，出席官佐如左：檢察官丁承綱，書記官丁象庵。檢察官命引陸李秀英入庭。

問：姓名、年（齡）、籍（貫）?

答：陸李秀英，二十八歲，南京人，住利濟(jì)巷松蔭里十六號。

問：你做什么事?

答：沒有做事。

問：日本人進(jìn)南京城的時候，你知道么?

答：二十六年陽歷十二月十二、三日進(jìn)城的。

問：當(dāng)時是什么日本部隊，你知道么?

答：聽說是中島部隊。

問：你當(dāng)時在什么地方?

答：在上海路美國小學(xué)校內(nèi)避難。

問：你當(dāng)時是被害的么?是什么時候?

答：我是被害的，是十二月十九日的早晨。

問：在什么地方?

答：就在學(xué)校內(nèi)。

問：你怎樣被害的呢?

答：在這個學(xué)校避難的同時有六七個青年婦女，有四五個老頭子。十九日晨有三個日本兵入學(xué)校內(nèi)，對青年婦女?dāng)M行強(qiáng)奸，我就竭力掙扎，被這三個日本兵用刺刀將臉、腿、腹各部一共戳了三十三刀。我當(dāng)時懷孕六個月，血流滿地，昏厥不醒人事，日本人以為我死了，他們就走了。以后我父親將我送到鼓樓醫(yī)院，由威爾遜醫(yī)生醫(yī)治，住院四十余日，并由美國教會牧師麥克林?jǐn)z有活動照片，這個照片現(xiàn)在送到國際法庭去了。我到現(xiàn)在每逢下雨的天就周身痛苦，不能行動。

問：你當(dāng)時懷孕的嬰孩流產(chǎn)了沒有?

答：在受傷的第三天就流產(chǎn)了。

問：其余的幾個青年婦女也沒有被奸污么?

答：我掙扎的時候其他人都跑掉了，未被奸污。

問：谷壽夫這個人，你知道么?

答：我當(dāng)時不知道。

問：你知道其他的事么?

答：在我遇難前一二時，有一個五十多歲的老頭子，因?yàn)槿毡颈鴵屗捏H子，他不肯被拉走，被日本兵一槍打死了。

問：你其他還有什么話么?

答：我要求法庭代我們請恤金，并向日本要求損害賠償。

在該檔案中還有一段證人結(jié)文，內(nèi)載有：

“今到場為證人，當(dāng)系據(jù)實(shí)陳述，決無匿飾增減。此結(jié)。證人陸李秀英。中華民國三十五年十月十九日�！�

一九九八年，日本作者松村俊夫在其《南京大屠殺的大疑問》一書中，聲稱1998年活著的李秀英不是南京大屠殺時候的李秀英，污蔑她是“假證人”。

在國家的幫助下，接下來的幾年，李秀英多次赴日發(fā)起訴訟，經(jīng)數(shù)輪辯論，終于迫使日本右翼不得不低頭道歉。

2004年12月4日6點(diǎn)10分在南京鼓樓醫(yī)院逝世，享年86歲。

2014年12月11日上午，李秀英的墓地旁矗立起一座半身銅像。