看到一句話

• 絕大多數(shù)中國人也許也不知道日本最原始的原住民遠(yuǎn)比現(xiàn)代中國人的祖先早上萬年就通過海洋遷徙到東亞（一類編號(hào)YAP的原始基因在日本人基因測序里有三分之一而在中國人里低于1%）。

第一直覺就是有問題，因?yàn)樵诜肿尤祟悓W(xué)上，日本還是比較明確的，既然走出非洲理論大家都認(rèn)可，那么作為東亞一個(gè)孤懸小島上的人難道是飛過去的？還是土地里長出來的？

01，日本原住民“早萬年”，為啥不對勁？

第一，時(shí)間搞錯(cuò)了。我恰恰有這篇文章。這個(gè)文章論證的是日本人的一部分基因是在來自于一萬年左右進(jìn)入日本島的繩文人。

而中國人進(jìn)入東亞時(shí)間大概是5萬年前。所以不存在日本比中國還早1萬年的說法！

第二，地理位置錯(cuò)位。論文其實(shí)說的是日本島的問題，雖然日本屬于東亞，但是東亞不等于日本。所以在這個(gè)問題上，還是要慎重的說

第三，關(guān)于基因比例的問題。日本人YAP多是絕對不能證明日本人早的，反過來這恰恰說明了兩個(gè)問題。日本人群體太小，所以基因始終無法得到稀釋。

而其他地方的群體太過龐大，所以很多突變很快會(huì)通過群體擴(kuò)散最后變得很低了。事實(shí)上在生物學(xué)上，一個(gè)典型的問題就是建立者效應(yīng)。

建立者效應(yīng)（founder effect，亦稱為奠基者效應(yīng)、建立者效應(yīng)或創(chuàng)始者效應(yīng)、始祖效應(yīng)）是遺傳漂變的一種形式，指由帶有親代群體中部分等位基因的少數(shù)個(gè)體重新建立新的群體，這個(gè)群體后來的數(shù)量雖然會(huì)增加，但因未與其他生物群體交配繁殖，彼此之間基因的差異性甚小。這種情形一般發(fā)生于對外隔絕的海島，或較為封閉的新開辟村落等。也可稱“定殖者效應(yīng)”。

日本這種海島，恰恰符合這個(gè)特點(diǎn)，由于孤懸海外，只有部分人可以從大陸遷徙到日本，于是這少部分人成了日本人的祖先，也就是建立者效應(yīng)，他們的后代由于種群太少，多樣性也小，于是基因擴(kuò)散很難。

而相反，對于大陸，由于人群遷徙特別頻繁，還經(jīng)常跟其他民族交流，所以這些基因頻率淘汰得非常快。

02，文章解讀

這篇文章題目是Y Chromosomal DNA Variation and the Peopling of Japan，發(fā)表于1995年，AJHG，這個(gè)期刊倒是業(yè)內(nèi)比較知名，屬于專業(yè)期刊，是我們做分子人類學(xué)的top1（當(dāng)然你要是更吊的話就發(fā)到了nature science了，比如金力教授關(guān)于漢族遷徙的就發(fā)到了nature）

首先說一下，1995年的時(shí)候，人類基因組還沒測呢！畢竟那個(gè)時(shí)候測序技術(shù)太不成熟了，后來大師venter 搞出的新技術(shù)才讓我們有了更加方便的測序。另外，作者測的是一個(gè)基因多態(tài)性，叫做 Y Alu polymorphic (YAP) element

那么作者得出了啥結(jié)論呢？首先，作者檢測了沖繩，本州島的靜岡和青森兩個(gè)地方，以及臺(tái)灣這四個(gè)地方。然后呢，發(fā)現(xiàn)這四個(gè)地方里，有42%的日本人有YAP，而臺(tái)灣人沒有——結(jié)論是這個(gè)YAP在亞洲人分布是不規(guī)則的（否則大家都有了）。

這是取樣的大體位置

其次，他算了下遺傳距離，通過遺傳距離，他計(jì)算出，沖繩人和來自于本州（靜岡和青森）的日本人是不一樣的！

這是分布圖，括號(hào)里是百分比，我們可以看到

1、臺(tái)灣人明顯和日本人不一樣，臺(tái)灣人經(jīng)常是100,

2、日本內(nèi)部，沖繩和本州明顯不一樣，比如第一個(gè)YAP，沖繩是56%，本州是34%

最終他得出的結(jié)論是，現(xiàn)代日本人的基因貢獻(xiàn)來源是多樣的，包含了

1、古代繩文人（一萬年前，來自于中國）

2、彌生時(shí)代（秦漢時(shí)期-200~200年）來自于朝鮮半島或者中國大陸的移民，而沖繩人應(yīng)該和彌生時(shí)代的人有一定的交集。作者推測，攜帶有YAP的人大概在繩文時(shí)代（1萬年左右）進(jìn)入日本人，而大量的無YAP人大概在2300年前的彌生時(shí)代進(jìn)入了日本。

作者最后說，這些差異可能跟以下因素有關(guān)

1，遷徙群體

2，建立者的規(guī)模

3，建立者效應(yīng)的古代史

4，生活方式，比如繩文人的采集狩獵和彌生人的農(nóng)業(yè)文化。

整篇文章明明就說了一個(gè)事情，日本人的基因來源多樣性，比如沖繩就特殊，而且還保留著繩文時(shí)代遷徙而來的人的基因部分。這完全就不是用來比較日本人和中國人的啊！而且作者提到了彌生時(shí)代非常大規(guī)模的來自于中國大陸或者朝鮮半島的人類遷徙。

03，關(guān)于這篇文章的意義

這篇文章是用來解讀日本本土人來源的。在作者之前，關(guān)于日本人起源，日本主流有三種觀點(diǎn)：

1、現(xiàn)代日本人來自于3萬年前的亞洲大陸，那個(gè)時(shí)候日本海島還連接著大陸

2、日本來自于1萬年前，即繩文人，主要是陶瓷和狩獵文化

3、日本人來自于2300年前，即彌生文化，通過朝鮮半島，帶來了編織技術(shù)、金屬制造和水稻技術(shù)。彌生文化最早發(fā)現(xiàn)于九州，然后很快覆蓋全日本島，甚至導(dǎo)致了北海道南部的文化徹底改變。

而大家在爭議古代繩文人對日本的基因貢獻(xiàn)有多少。這里又有兩種理論

一種叫做替代（substitution），即后來人把前人替代了，

一種叫做轉(zhuǎn)換（transformation），即現(xiàn)代日本人是最初在更始世（一萬二千年以前）從中國南部來到日本，然后在本土獨(dú)自的發(fā)展。

而作者提出了一種新的看法，叫做雜交（hybridization），認(rèn)為現(xiàn)代日本人是不同批次遷徙到日本的人的混合體。

04，聊聊一些不太嚴(yán)謹(jǐn)?shù)恼f法

還有一些其他說法，似乎并不嚴(yán)謹(jǐn)。

歐洲人意識(shí)到自己并不是尼安德特人的子孫后代

no，事實(shí)上嚴(yán)格意義上，現(xiàn)代人是智人和尼安德特共同的后裔。

中國人意識(shí)到自己作為智人而跟北京猿人并沒有什么傳承關(guān)系

no，這個(gè)目前還有待研究。因?yàn)槲覀兡壳斑€沒有檢測到中國的古人類基因。出現(xiàn)一個(gè)中國本土的“尼安德特人”是非常有可能的（類似于丹尼索瓦人），即現(xiàn)代人到了中國和當(dāng)?shù)氐墓湃祟愡M(jìn)行了混合，由于中國大陸不太適合保存古人類，所以研究比較滯后，而歐洲做的非常好。

事實(shí)上現(xiàn)代人類學(xué)證明，現(xiàn)代智人是從非洲走出后，他們和各地的古人類進(jìn)行了雜交并產(chǎn)生了后代。

現(xiàn)代基因圖譜的測定表明斯拉夫人遠(yuǎn)比德國人擁有“更純的雅利安人血統(tǒng)”，從而響亮打了幾十年前納粹德國人種優(yōu)

no！推翻這個(gè)的明顯是考古學(xué)的功勞而非分子人類學(xué)。因?yàn)榈聡丝谥械摹把爬踩恕保ń鸢l(fā)碧眼）和真實(shí)的雅利安人是兩碼事，這屬于納粹搞錯(cuò)了日耳曼人本質(zhì)，給自己的爹強(qiáng)行取了個(gè)雅利安的名字而已，根本不存在誰是純種的問題。

這是歐洲的y染色體，咋看純度？

發(fā)現(xiàn)DNA與遺傳物質(zhì)的真相真的是人類最偉大的發(fā)現(xiàn)之一，它極大的完善了進(jìn)化論，并成為依靠考古挖化石的方法之外，支持進(jìn)化論的又一個(gè)堅(jiān)實(shí)的論證。

no，搞錯(cuò)人了，完善進(jìn)化論的是木村資生的中性進(jìn)化論，對其貢獻(xiàn)巨大的人包括：

1，孟德爾和摩爾根的現(xiàn)代遺傳學(xué) 2，沃森和克里克的DNA雙螺旋，他倆都不是發(fā)現(xiàn)DNA的！

請問在座的各位有幾個(gè)知道誰發(fā)現(xiàn)了dna？進(jìn)入教科書的人叫艾弗里，不過他不是發(fā)現(xiàn)DNA的，而是證明DNA是遺傳物質(zhì)的。答案是1869年,是瑞士生物學(xué)家Friedrich Miescher發(fā)現(xiàn)的（我也是百度加谷歌找到的這尊）。

ref.

Hammer M F, Horai S. Y chromosomal DNA variation and the peopling of Japan[J]. American journal of human genetics, 1995, 56(4): 951.

最后，很多人不太清楚時(shí)間點(diǎn)。

1，一代測序是上世紀(jì)70年代才搞出來的

2，人類基因組計(jì)劃是2001年才完成的，在這之前，我們不清楚人類整體基因的情況，而這個(gè)計(jì)劃過程中venter和各國科學(xué)家組成的兩個(gè)團(tuán)隊(duì)互相印證，最后才確定了二代測序。

3，人類走出非洲是1987年才提出的，根據(jù)的是線粒體DNA